Fungos endofíticos são micro-organismos que vivem no interior dos tecidos vegetais sem causar-lhes danos aparentes. Esses fungos ainda são pouco estudados, mas demonstraram em estudos recentes que possuem grande potencial na produção de substâncias biotecnológicas de interesse farmacêutico, industrial e agrícola. O objetivo do presente trabalho foi apresentar um panorama acerca da diversidade e produção de substâncias bioativas de fungos endofíticos associados a espécies vegetais da região amazônica. Para isso, foi elaborada uma revisão de literatura exploratório-descritiva, com abordagem qualitativa, considerando estudos publicados entre os anos de 2000 e 2021. Foram selecionados 33 trabalhos, entre eles, teses de doutorado, dissertações de mestrados e artigos científicos originais sobre a temática e região (Amazônia) escolhidas. Verificou-se a existência de resultados promissores relacionados a fungos endofíticos provenientes de espécies vegetais amazônicas, bem como de extratos produzidos a partir de micro-organismos endofíticos dessa região, revelando atividade antibacteriana, antifúngica, citotóxica, biossurfactante, potencial de controle biológico de pragas ou aplicabilidade no diagnóstico de doenças.