Análisis de la diversidad de papas (Solanum spp.) con marcadores moleculares microsatélite de los distritos de Secclla y Santo Tomás de Pata (Huancavelica) y Santillana (Ayacucho)

Abstract

La investigación se realizó con los objetivos de estudiar los perfiles moleculares de la diversidad genética, comparar la variabilidad y distancias genéticas de los marcadores moleculares de papas (Solanum spp.) colectados en campo de cultivo de agricultores de 12 comunidades de los distritos de Secclla, Santo Tomás de Pata y Santillana. Las 128 accesiones fueron cultivadas en bolsas polietileno con dos repeticiones cada una. El muestreo de los foliolos jóvenes se realizó a los 48 días después de la siembra. La extracción del ADN se procedió por el método de CTAB, copias de fragmentos del ADN se obtuvo mediante PCR, que fueron separados por PAGE. En el análisis molecular se empleó 8 pares de marcadores microsatélites. Los resultados se analizaron por los estadísticos, coeficiente Simple Matching, NTSYS 2.10p, método de agrupamiento UPGMA para estimar el polimorfismo y el AMOVA se calculó usando el programa Arlequin (versión 3.0). El PIC promedio fue 0.238, señala la existencia de polimorfismo. La distancia y similitud genética, las poblaciones que exhiben mayor relación genética comprenden, Santillana y Santo Tomás de Pata, denotando que las accesiones de estas poblaciones presentan mayores características en común. El AMOVA muestra que la variabilidad se encuentra dentro de poblaciones (91.55%), y la diferenciación genética entre las tres poblaciones es moderada (FST = 0.08448). © 2019. Journal of the Selva Andina Research Society. Bolivia. Todos los derechos reservados. Palabras clave:Diversidad genética de Solanum spp. Microsatélites, Ayacucho-Huancavelica, polimorfismo de papa, marcadores SSR. Abstract J. Selva Andina Res. Soc.2019; 10(1):4-15.The research was carried out with the objectives of studying the molecular profiles of genetic diversity, comparing the variability and genetic distances of the molecular markers of potatoes (Solanum spp.) which were collected in farmers' field from 12 communities of the Secclla, Santo Tomás de Pata and Santillana districts. The 128 accessions were cultivated in polyethylene bags with two repetitions each. The sampling of the young leaflets was carried out 48 days after sowing. DNA extraction was performed by CTAB method, copies of DNA fragments were obtained by PCR, which were separated by PAGE. In the molecular analysis, 8 pairs of microsatellite markers were used. The results were analyzed by the statistics, Simple Matching coefficient, NTSYS 2.10p, UPGMA grouping method to estimate the polymorphism and the AMOVA was calculated using the Arlequin program (version 3.0). The average PIC was 0.238, indicating the existence of polymorphism. The distance and genetic similarity, the populations that exhibit the greatest genetic relationship include Santillana and Santo Tomás de Pata, denoting that the accessions of these populations have greater common characteristics. The AMOVA shows that the variability is within populations (91.55%), and the genetic differentiation between the three populations is moderate (FST = 0.08448).