Análise comparativa da região codificadora para a proteína capsidial de isolados de PepYMV e PVY coletados em pimentão

Abstract

RESUMOO Potato virus Y (PVY) e Pepper yellow mosaic virus (PepYMV) sã o a s ú nica s espécies de potyviru s encontra da s em pimenta e pimentão no Brasil. A região codificadora para a proteína capsidial de isola dos de PepYMV e PVY coleta dos em pimentã o, foi a va liada quanto à variabilidade e presença de motivos específicos aos potyvirus. A identidade da seqüência de aminoácidos na CP entre os isolados de PepYMV foi de 93% a 100%, enquanto que para os de PVY 94% a Moura, M.F; Marubayashi, J.M.; Mituti, T.; Gioria, R.; Kobori, R.; Pavan, M.A.; Krause-Sakate, R. Análise comparativa da região codificadora para a proteína capsidial de isolados de PepYMV e PVY coletados em pimentão. Summa Phytopathologica, v.38, n.1, p.93-96, 2012.Palavras-chave adicionais: pimentão, variabilidade, Potyvirus 9 8 %. Entre os víru s esta va riou de 7 3 % a 7 9 %. Foi observa da va riabilidade nas regiões conservadas da CP. Todos os isolados de PepYMV seqü encia dos nã o a presenta ra m o motivo DAG na CP, relacionada a transmissão dos vírus por afídeos, enquanto que para as seqüência s obtidas de PVY foi observada. Dema is domínios como MVWCIENG, ENT ERH, QMKAAA e PYMPRYG fora m verificadas em ambas espécies. 94% to 98%. Among the viruses that ranged from 73% to 79%. It was observed variability in the conserved regions of the CP. All PepYMV isolates sequenced did not show the DAG motif in the CP, related to virus transmission by aphids, while for sequences of PVY this motif was observed. Other motifs, such MVWCIENG, ENTERH, QMKAAA and PYMPRYG were found in both species. Potato virus Y (PVY) and Keywords: sweet pepper, variability, Potyvirus ABSTRACTO pimentão (Capsicum annuum L.) é uma hortaliça cultivada em todo o Brasil, e encontra-se entre as dez olerícolas mais consumidas no país. A produção de pimentão é predominantemente em campo aberto, sendo que o Estado de São Paulo abrange cerca de 23,70% da área cultivada brasileira que é de 12.000 ha (11).A suscetibilidade do pimentão a problemas fitossanitários causados por vírus ocasiona graves problemas à cultura. Um dos critérios taxonômicos para classificação de espécies no gênero Potyvirus é comparação da identidade de sequência de aminoácidos codificadora para proteína capsidial (CP), que sendo inferior a 80%, classifica isolados em diferentes espécies (3). Neste trabalho foi analisada a CP de uma coleção de isolados de potyvirus provenientes das seguintes áreas produtoras de pimentão no Estado de São Paulo: Iacanga, Piraju, Lins e MogiMirim. O RNA total foi extraído a partir de plantas de fumo (Nicotiana tabacum cv. TNN), mantidas em casa de vegetação, utilizando-se o método de Bertheau (4) ou pelo kit de extração Total RNA Purification Norgen, seguindo as recomendações do fabrican te. Para am plificação da C P tant o de P VY com o PepYMV foi desenhado um par de oligonucleotídeos iniciadores denom inados P epN ib (5' GWTSGYY GMM TTGGATGATG 3 ') e PepUT R (5' AGTAGTAC AGGAAAAGCC 3 ' ) qu e amplifica a região codificadora para a proteína capsidial (960 nts). A reação de RT-PCR para...

Role of enzymes on the susceptibility of three cucumber varieties to the infestation with whitefly Bemisia tabaci Genn in Egypt

“…belongs to the family curcubitaceae and is one of the most important vegetable crops in Egypt. It is infested by many pests which are great economic pests of cucurbitaceous vegetable plants that cause serious damage directly by sucking plant juice and indirect damage by phytopathogenic transmission [6,7,8].…”

Identifying resistance to root-knot nematodes in Capsicum genotypes

“…is gaining notoriety in the Brazilian market, due to the growing demand in the segment of fresh vegetables, condiments, seasonings and preserves. Among the domesticated species of Capsicum, the sweet pepper (Capsicum annuum L.) stands out for the high yield and economic value (BÜTTOW et al, 2010;PIMENTA et al, 2016), with an estimated national production area of 12.000 hectares (MOURA et al, 2012). In Brazil, the main producing regions are the Southeast and Center-West, especially the state of São Paulo, which produced, in the 2012 harvest, 65.6 thousand tons in 2.2 thousand hectares (IEA, 2016).…”

Histologia da interação entre <i>Phytophthora capsici</i> e genótipo de pimentão com diferentes níveis de resistência

“…É cultivado em diversos países, somando produção mundial de 31,1 milhões de toneladas (FAOSTAT 2013). No Brasil é considerado uma das dez olerícolas mais consumidas (Moura et al 2012), com produção predominante e crescente nos estados de Minas Gerais e São Paulo, sendo esse o maior produtor (Blat e Costa 2007) com cerca de 82 mil toneladas produzidas em 2015 (IEA 2015).…”