Age distribution of porcine sapovirus asymptomatic infection and molecular evidence of genogroups GIII and GIX? circulation in distinct Brazilian pig production systems

Abstract

This study aimed to evaluate the natural infection by SaV in pigs of different categories of production cycle in an important Brazilian pig-producing region. Faecal samples (n = 169) of suckling, post-weaning, finisher and breeder pig categories were analysed. Animals were from five farrow-to-weaning and nine grower-to-finish commercial pig farms. The RT-PCR assay was performed targeting the partial RNA-dependent RNA polymerase (RdRp) gene of porcine SaV genome. The virus was detected in 23.7% (40/169) of faecal samples and in 10/14 (5/5 farrow-to-weaning; 5/9 grower-to-finish) of pig farms evaluated. Porcine SaV was most frequently (p < 0.05) detected in pigs at post-weaning than in grower-to-finish and breeder categories. The phylogenetic analysis revealed that the porcine SaV strains belong to the GIII and GIX? genogroups. This study showed that the porcine SaV GIII genogroup has spread in the pig herds and provides the first evidence of GIX? genogroup circulation in South America.

>b<Ocorrência e caracterização molecular de calicivírus suínos>/b<

“…Isso está de acordo com o reportado por Kuroda et al (2017). Outros estudos, porém, reportam que a infecção por Sapovírus é mais frequente em animais de até um mês de idade (BARRY et al, 2008b;VALENTE et al, 2016) Kuroda et al (2017). Desta maneira, outras técnicas para o sequenciamento do VP1 seriam uma melhor abordagem, como por exemplo a amplificação da extremidade 3' do genoma através de RACE-PCR (L'HOMME et al, 2009a, SCHEUER et al, 2013, YIN et al, 2006, SONG et al, 2011 ou sequenciamentos de nova geração (CHEN et al, 2018, KURODA et al 2017.…”

“…No Brasil os genogrupos de SaV já relatados (em humanos e suínos) foram GI, GII, GIII, GV, GVII, GVIII e GIX, além de amostras não classificadas (COSTA et al, 2017;REYMÃO et al, 2016;FIORETTI et al, 2016;PORTAL et al, 2016;VALENTE et al, 2016;OLIVEIRA et al, 2013;CUNHA et al, 2010b;BARRY et al, 2008b, HERNANDEZ et al, 2014 v.82, n.11, p.5408-5416, 2008. Di Bartolo, 2014Sisay, 2016Martella, 2008Nakamura, 2010Shen, 2011Reuter, 2007Mauroy, 2008Scheuer, 2013Chao, 2012Keum, 2009Yin, 2006Wang, 2006b Cunha, 2010b Martinez, 2006Wolf, 2009Cunha, 2010aShen, 2012Monini, 2015Silva, 2015bGutiérrez, 2011van der Poel, 2000Wang, 2005Farkas, 2005Machnowska, 2014Bucardo, 2016Mattison, 2007Taku, 2017Sugieda, 1998 APÊNDICE B -Gráficos de dispersão para meta-análise de Norovírus Para responder à pergunta "qual a relação da infecção pelo Norovírus com a ocorrência de diarreia?…”

“…Liu, 2014 Kim, 2006Martella, 2008Nakamura, 2010Shen, 2011Reuter, 2007Mauroy, 2008Barry, 2008bTan, 2015Hernandez, 2014Valente, 2016jun, 2016Scheuer, 2013Chao, 2012Jeong, 2007Keum, 2009Reuter, 2010Yin, 2006Wang, 2006b Cunha, 2010b Yu, 2008Kuroda, 2017Martinez, 2006Dufkova, 2013Liu, 2012b Figura 12 -A) Reconstrução da imagem de Pan-1, Calicivírus de primata a partir de crio-microscopia eletrônica. B) Reconstrução da imagem de partículas recombinantes do Norwalk vírus a partir de criomicroscopia eletrônica.…”

“…Com efeito, vale o exemplo da ocorrência do genogrupo GIX? 1 em criações suínas no Brasil (VALENTE et al, 2016). Adicionalmente, cada genogrupo pode ser subdividido em diversos genotipos (ICTV, 2011).…”

“…Mais recentemente, no estado do Paraná, demonstrou-se que o SaV pertencente ao genogrupo GIII é endêmico nas criações, havendo ainda, como já mencionado, evidências da circulação do genogrupo GIX? (VALENTE et al, 2016).…”