A prospective feasibility trial to challenge patient-derived pancreatic cancer organoids in predicting treatment response

Abstract

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Culture media composition influences patient-derived organoid ability to predict therapeutic responses in gastrointestinal cancers

“…For one case, HO106, response was compared to 7 CRC PDOs since we did not have additional small bowel PDOs for comparison. Drug response for PDOs tested with the same therapeutic agent(s) was categorized as Sensitive, Intermediate, or Resistant based on each PDO's normalized AUC values for each drug using the Jenks Natural Breaks algorithm by BAMMtools, an R package (59) similar to other studies (20,51,60). For 2 cases (HO17 and HO42), we did not have enough CCA PDOs available for comparison, so response was determined relative to published IC50 data for the same cancer type and drug.…”

Les organoïdes dérivés de tumeurs (ou tumoroïdes), des outils de choix pour la médecine de précision en oncologie

“…Une étude princeps a ainsi montré l'intérêt de l'utilisation des tumoroïdes dérivés de tumeurs gastrointestinales métastatiques pour prédire la réponse de 21 patients à différentes chimiothérapies (avec 100 % de sensibilité, 93 % de spécificité, 88 % de valeur prédictive positive et 100 % de valeur prédictive négative) [16]. Une autre étude réalisée à partir des tumoroïdes dérivés de 11 tumeurs chimionaïves, a également permis de prédire à 91 % pour la première ligne de traitement et 80 % pour la deuxième ligne, la réponse à la chimiothérapie de patients présentant un cancer du pancréas ; cependant, les tumoroïdes issus de cinq autres tumeurs qui avaient été prétraitées n'ont prédit la réponse au traitement que dans 40 % des cas [17]. La corrélation entre la réponse à la radiothérapie des patients et celle des tumoroïdes a été analysée dans les cancers colorectaux chez 19 patients, aboutissant à l'établissement d'un modèle de prédiction d'une précision de 82 % pour les patients sensibles et de 92 % pour les patients résistants [18].…”

“…Plusieurs oncométabolites, issus du cycle de Krebs, ont en effet été retrouvés plus abondamment dans les tumoroïdes issus de patients ayant récidivé de façon précoce. Cette caractéristique pourrait non seulement permettre d'identifier les tumeurs les plus agressives, mais également constituer une vulnéra-chimionaifs ont prédit avec efficacité, non seulement la réponse à la première ligne de traitement (91 %) mais également à la deuxième ligne (80 %) [17].…”