Estimativas de efeitos genéticos em bezerros cruzados por diferentes modelos e métodos de estimação

Abstract

RESUMO -Os objetivos neste trabalho foram comparar estimativas de parâmetros genéticos obtidas por meio de dois modelos -um contendo apenas efeitos aditivos e de dominância e outro que incluiu os efeitos aditivo-conjunto (complementaridade) e epistático -e testar alternativas de critérios objetivos para determinação do coeficiente lambda na aplicação da regressão de cumeeira. Os resultados obtidos revelaram que a escolha de um critério para determinação do coeficiente lambda em regressão de cumeeira depende não apenas do conjunto de dados e do modelo utilizado, mas, sobretudo, de um conhecimento prévio acerca do fenômeno estudado e do significado prático e da interpretação dos parâmetros encontrados. Pelo uso de modelos mais completos para avaliação de efeitos genéticos em bovinos de corte, pode-se identificar a contribuição dos efeitos aditivo-conjunto e epistático, que encontram-se embutidos no efeito de heterose estimado por modelos mais simples. A regressão de cumeeira é uma ferramenta que viabiliza a obtenção dessas estimativas mesmo na presença de forte multicolinearidade.Palavras-chave: epistasia, estimação viesada, heterose, multicolinearidade, regressão de cumeeira Estimates of genetic effects in crossbred calves by different models and estimation methodsABSTRACT -The purpose of this study was to compare estimates of genetic effects obtained using the additive-dominance model and another which included parameters for joint-additive (complementarity) and epistatic effects, as well as evaluate alternative objective criteria for choosing the lambda coefficient in ridge regression implementation. The results indicated that the criterion to be employed at the choice of lambda not only depends on the data set and the model used, but also on a previous knowledge about the phenomenon under study and the practical interpretation of estimated coefficients. When performing genetic effects evaluation, if other than additive and dominance effects are contemplated, it may be possible to identify and separate joint-additive and epistatic effects, which are usually inlaid in the heterotic effect estimated by the additive-dominance model. The use of ridge regression method can make such analyses possible even under strong multicollinearity.Key Words: biased estimation, epistasis, heterosis, multicollinearity, ridge regression IntroduçãoSistemas de cruzamentos são fundamentados na exploração de efeitos raciais e de heterose. O uso eficiente dos efeitos raciais se baseia no conhecimento das características raciais diretas e maternas. Adicionalmente, o uso efetivo da heterose requer a caracterização dos efeitos de heterose nas vacas e nos bezerros cruzados (Roberson et al., 1986).A heterose e seus efeitos, geralmente benéficos ao desempenho, têm sido atribuídos aos efeitos de dominância de genes de ação melhoradora. Em muitas investigações, essa hipótese mostra-se satisfatória na explicação da superioridade observada em grupos de indivíduos cruzados, como reportado por Gregory et al. (1991). Contudo, segundo Sharma et al. ...

Componentes de variância e parâmetros genéticos em uma população multirracial Nelore-Angus sob enfoque Bayesiano

“…Cardoso & Tempelman (2004) encontraram resultado similar ao comparar o efeito aditivo, de dominância e a interação aditiva × aditiva entre o modelo animal e o MAMR em estudo com uma população Nelore-Hereford. Outros autores também encontraram valores negativos para epistasia em estudo sobre ganho pré-desmame para uma população multirracial Nelore-Hereford Pimentel et al, 2006 Tabela 2 -Médias e desvios-padrão a posteriori dos efeitos genéticos fixos para ganho pós-desmama em uma população Nelore-Angus devido às perdas por recombinação (Tabela 3; Figura 1). Nas extremidades à direita e à esquerda da figura, observam-se os picos de desempenho para GPD dos animais F 1 , na extremidade inferior, os animais Nelore puros com pior desempenho e na extremidade oposta (superior), os animais Angus puros com desempenho intermediário, semelhante ao dos animais 3/8 Nelore.…”

Modelagem de efeitos genéticos e ambientais que influenciam o peso à desmama de bezerros mestiços Charolês-Zebu

“…No modelo MUTIL, o efeito de grupo genético é considerado parte do grupo de contemporâneos, portanto, não permitindo que os desempenhos dos diferentes grupos (Trematore et al, 1998;Roso & Fries, 2000;Pimentel et al, 2006). Com relação ao valor positivo estimado para o coeficiente b 1 , utilizado para modelar o efeito genético aditivo individual médio, concorda-se com a explicação de Trematore et al (1998) de que valores positivos seriam esperados, em razão das características dos dois grupos de raças utilizadas nos cruzamentos, e indicam efeito positivo dos alelos da raça Charolesa para o aumento do peso à desmama.…”

“…Para explicar esta diferença no ajuste dos modelos, concorda-se com Trematore et al (1998), que sugeriram que efeitos epistáticos, de ligação gênica e, ou não-lineares possam ser responsáveis por parte da variação existente entre grupos genéticos, para o peso à desmama de bezerros cruzados Charolês-Nelore. Efeitos significativos da epistasia e da complementaridade sobre características pré-desmama de bezerros cruzados Hereford-Nelore foram obtidos por Carvalheiro et al (2006) e Pimentel et al (2006).…”

Estimativas de efeitos genotípicos sobre os desempenhos pré e pós-desmama de populações Hereford x Nelore

“…Quando a composição genética dos pais de determinada vaca (mãe) não era conhecida (a dos produtos era obrigatória), considerou-se que esta composição foi resultante de acasalamento inter se. O conceito de epistazigose também foi empregado por Roso et al (2005a,b), Pimentel et al (2006) e Carvalheiro et al (2006 para estimar efeitos epistáticos diretos e maternos sobre o ganho de peso pré-desmama de bovinos de corte cruzados. Segundo Fries et al (2000Fries et al ( , 2002, a fração esperada de gametas recombinantes (com combinações de alelos não encontradas nas raças parentais), produzidos por um indivíduo cruzado poderia ser descrita pela heterozigose racial (H) para qualquer número de locos, com respeito às raças puras originais e como uma proporção da freqüência máxima de formas recombinantes possível de ser encontrada em uma população, que é a observada em gametas de indivíduos F1.…”

“…De acordo com os resultados de Piccoli et al (2002) e de Pimentel et al (2006), que estudaram efeitos aditivos e não aditivos sobre o ganho pré-desmama de populações Hereford × Nelore, a adição dos componentes epistáticos ao modelo tradicional tornou mais evidente a observação da heterose e parte dos efeitos de heterose que estariam sendo estimados pelos modelos aditivo-dominante poderia ser originada da complementariedade (interação de efeitos aditivos entre raças). Roso et al (2005a), trabalhando com 478.466 animais de diferentes genótipos de cruzamentos entre dez raças européias, também verificaram a existência de efeitos epistáticos diretos e maternos sobre o ganho de peso pré-desmama.…”