Comparative study on the use of specific and heterologous microsatellite primers in the stingless bees Melipona rufiventris and M. mondury (Hymenoptera, Apidae)

Abstract

Due to their high degree of polymorphism, microsatellites are considered useful tools for studying population genetics. Nevertheless, studies of genetic diversity in stingless bees by means of these primers have revealed a low level of polymorphism, possibly the consequence of the heterologous primers used, since in most cases these were not specifically designed for the species under consideration. Herein we compared the number of polymorphic loci and alleles per locus, as well as observed heterozygosity in Melipona rufiventris and M. mondury populations, using specific and heterologous primers. The use of specific primers placed in evidence the greater frequency of polymorphic loci and alleles per locus, besides an expressive increase in observed heterozygosity in M. rufiventris and M. mondury, thereby reinforcing the idea that populational studies should be undertaken by preferably using species-specific microsatellite primers.

Estudio de microsatélites en las abejas sin aguijón Melipona colimana y M. beecheii de Mesoamérica

“…La pérdida de diversidad genética en meliponinos como consecuencia de la degradación de sus hábitats ha sido demostrada en estudios anteriores. Lopes et al (2010) observaron un descenso de la heterocigosidad en M. rufiventris y M. mondury a causa del reducido número de colonias encontradas como consecuencia de la destrucción y fragmentación de sus ecosistemas naturales. Otros estudios revelaron que la fragmentación de los hábitats afecta en mayor medida a los individuos especialistas que a los generalistas (Kitahara y Fujii, 1994), como es el caso de las abejas sin aguijón (Zayed et al, 2005).…”

“…En cuanto a la media de riqueza alélica para todos los loci se obtuvieron valores similares en ambas especies (3,143 en M. colimana y 3,000 en M. beecheii, diferencia no significativa, p= 0,87). Estos valores están incluidos dentro del rango de variación observado en otras especies de Melipona: desde 1,67 en M. rufiventris (Lopes et al, 2010) hasta 3,78 obtenido en M. bicolor (Peters et al, 1998), especie para la que fueron diseñados parte de los cebadores utilizados. Los valores de heterocigosidad esperada por locus fueron mayores en M. beecheii (0,276-0,713) que en M. colimana (0,038-0,723) aunque no significativamente diferentes (p= 0,80).…”

“…Entre las herramientas moleculares, los microsatélites han sido usados en estudios de genética de poblaciones de abejas sin aguijón (Borges et al, 2010;Quezada-Euán et al, 2007, 2012. Lopes et al (2010) demostraron que el uso de microsatélites especí-ficos dio una mayor frecuencia de polimorfismo y de alelos por locus en dos especies del género Melipona que al usar marcadores diseñados para otras especies del mismo género. Igualmente Viana et al (2011) pusieron en marca el análisis de microsatélites en cuatro especies de Melipona usando cebadores diseñados para otras especies del mismo género.…”

A comparative study of the use of tiger-specific and heterologous microsatellite markers for population genetic studies of the Bengal tiger (Panthera tigris tigris)

“…These are regions of the genome that are made up of short repeat sequences, consisting of one to six nucleotides (Hancock, 1999;Sawaya et al, 2013), and they are widely used in studies of various organisms because of their high degree of polymorphism and their co-dominant inheritance. One of the limiting factors in the use of these markers is the development of speciesspecific primers (Lopes et al, 2010) to resolve genetic relationships at all levels of the population structure (Jarne and Lagoda, 1996;Hille et al, 2002). Nevertheless, attempts have been made to use these methods for the domestic cat (Felis catus) (Menotti-Raymond et al, 1999), Sumatran tiger (P. t. sumatrae) (Williamson et al, 2002), Asiatic lion (P. leo persica) (Singh et al, 2002), South China tiger (P. t. amoyensis) (Zhang et al, 2006), puma (Puma concolor) (Kurushima et al, 2006) and Bengal tiger (Bhagvatula and Singh, 2006;Sharma et al, 2008) among the Felidae.…”

“…Thus they may be used in a variety of applications, including gene mapping and analysis of family relatedness and paternity (Angers and Bernatchez, 1996;Vigilant et al, 2001;Inoue et al, 2008), whereas species-specific microsatellite loci are very useful and essential for long-term population genetic studies (Lopes et al, 2010) and for understanding genetic fitness. Therefore, in this study, we compare for the first time the genetic characteristics of tiger-specific microsatellite loci (n = 15) developed for the Bengal tiger (Sharma et al, 2008) and Sumatran tiger (Williamson et al, 2002) with those of heterologous microsatellite loci (n = 15) developed for the domestic cat (Menotti-Raymond et al, 1999 and Asiatic lion (Singh et al, 2002) in captive Bengal tigers using high quality DNA samples.…”