Poder de detecção de "Quantitative Trait Loci", da análise de marcas simples e da regressão linear múltipla

Silva, Heyder Diniz; Vencovsky, Roland

doi:10.1590/s0103-90162002000400020

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“…Um teste estatístico univariado para a comparação das médias de k grupos, quando a hipótese de igualdade das médias ( ) 0 H é rejeitada, deve ser complementado com um procedimento que envolve comparações múltiplas. Dentre estes testes, destacam-se: teste t de Student, teste de Tukey, teste de Duncan, teste de Dunnet e o teste LSD como sendo os mais comuns para confirmação dos resultados experimentais, que mostram quais tratamentos diferem, ou não, estatisticamente (SOUSA et al, 2012).…”

Section: Comparação Entre Os Resultados Dos Procedimentos Univariado unclassified

Diferenciação De Grupos De Eucaliptos Por Procedimentos Uni E Multivariado

Batistela

Padovani²

2015

EnergAgric

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RESUMO: Entre as diversas propriedades físicas analisadas na madeira, a densidade básica é bastante utilizada como parâmetro de seleção. Apesar de observar variação entre e dentro de uma mesma árvore, esta última variação normalmente não é considerada nos procedimentos estatísticos realizados. Este trabalho teve como objetivo empregar as técnicas de análise de variância multivariada (MANOVA) e análise de variância univariada (ANOVA) para a comparação dos perfis de resposta dos grupos de eucaliptos estudados e estabelecer a proximidade genética entre estes perfis pela distância generalizada de Mahalanobis. O conjunto de dados para a densidade básica das árvores relativas aos três grupos considerados, G1 = Eucalyptus saligna, G2 = E. grandis e G3 = E. grandis x E. urophylla possuem, respectivamente, n 1 = 27, n 2 = 31 e n 3 = 30 unidades experimentais. Em cada árvore a densidade básica foi mensurada em discos amostrados a 0% (base), 25%, 50%, 75% e 100% da altura comercial. Concluiu-se que o disco selecionado a 100% da altura comercial da árvore é o diferenciador de todos os grupos e os discos 25%, 50% e 75% da altura comercial da árvore são diferenciadores das espécies puras com o híbrido. O disco que não deve ser considerado para diferenciação dos grupos é o retirado da base da árvore, pois nele todas as densidades mostraram-se iguais estatisticamente. Do ponto de vista do procedimento multivariado, verificou-se que os três grupos são diferentes entre si assegurando um nível conjunto de significância de 5%, considerando o tronco da árvore como um todo, o que não pode ser assegurado nas comparações pelo processo univariado. A distância de Mahalanobis indicou as espécies puras como sendo as mais próximas quanto as características genéticas.

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Section: Comparação Entre Os Resultados Dos Procedimentos Univariado unclassified

Diferenciação De Grupos De Eucaliptos Por Procedimentos Uni E Multivariado

Batistela

Padovani²

2015

EnergAgric

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“…Consequentemente, devido ao efeito acumulativo, um número superior de marcadores foi identificado, em analogia aos níveis de menor magnitude, disponibilizando maior número de informações, contudo, com menor precisão. Segundo Silva & Vencovsky (2002), o nível de significância representa a probabilidade de erro de os marcadores estarem associados a falsos QTL (QTL inexistente/fantasma).…”

Section: Resultsunclassified

Níveis de significância na identificação de marcadores moleculares no mapeamento genômico

Jangarelli¹,

Euclydes

Cecon

2011

R. Bras. Zootec.

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RESUMO -Utilizaram-se diferentes níveis de significância genômica na seleção assistida por marcadores para estimar o valor fenotípico, o número de marcadores usados na seleção e a porcentagem de alelos favoráveis e desfavoráveis fixados em uma característica quantitativa. Uma comparação entre os níveis de 0,5; 1; 2; 4; 6; 8; 10; 12; 14; 16; 18 e 20% foi realizada por meio do sistema computacional de simulação genética (GENESYS), utilizado na simulação de um genoma constituído de um caráter quantitativo de herdabilidade igual a 0,20. A partir da população inicial, procederam-se à avaliação dos doze níveis de significância, via seleção assistida por marcadores, por meio dos valores fenotípicos obtidos durante dez gerações. Aplicou-se o método de agrupamento por ligação composta adotando a distância Euclideana média como medida de dissimilaridade entre as significâncias genômicas. Há similaridade nos valores fenotípicos obtidos com os níveis de significância de 4 e 16%, que são superiores aos altamente significativos (0,5 a 2%) e aos extremamente sugestivos (18 e 20%), em razão dos ganhos fenotípicos obtidos ao longo das gerações sob seleção.Palavras-chave: análise multivariada, seleção assistida por marcadores, significância genômica, simulação Levels of significance on the identification of molecular markers in genomic mappingABSTRACT -Different levels of genomic significance were used in assisted selection by markers to estimate the phenotypic value, the number of markers used in the selection and the percentage of favorable and unfavorable alleles fixed in a quantitative characteristic. A comparison among the levels 0.5; 1; 2; 4; 6; 8; 10; 12; 14; 16; 18 and 20 was done by using the computer system of gene simulation (GENESYS), used for simulation of a genome consisted of a quantitative character with heritability equal to 0.20. From the initial population, the evaluation of the twelve levels of significance by selection assisted by markers was carried out using the phenotypic values obtained for 10 generations. The cluster method by composite link was applied by using the average Euclidean distance as dissimilarity measure among the genomic significances. There are similarities among the phenotypic values obtained with significance levels from 4 to 16%, which are superior to the highly significant (from 0.5 to 2%) and to the extremely suggestive levels (18 and 20%), because of the phenotypic gains obtained over generations under selections.Key Words: genomic significance, multivariate analysis, selection assisted by markers, simulation Revista Brasileira de Zootecnia IntroduçãoO melhoramento genético molecular visa integrar as metodologias e técnicas empregadas no melhoramento genético tradicional com as tecnologias e estratégias da biologia molecular (Dekkers & Hospital, 2002). Recentemente, passou a considerar e a utilizar diferentes ferramentas, também disponibilizadas pela ciência genômica (Borém et al., 2003).Os marcadores moleculares são sequências de DNA que podem ser identificadas e mapeadas e são uti...

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“…Stepwise regression analysis was used to identify molecular markers associated with resistance and agronomic characteristics in different crops (Silva and Vencovsky, 2002). Ruan et al (2009) successfully applied stepwise regression to study the association between molecular markers and dryness caused by disease in Hippophae L. Pereira et al (2008) used stepwise regression analysis to identify quantitative trait loci linked to grain productivity in common bean.…”

Section: Discussionmentioning

confidence: 99%