Este trabalho analisa a influência da estrutura organizacional no desempenho gerencial, examinando a estrutura por meio das configurações de Mintzberg (2012) e o desempenho com base nos modelos de Vieira e Vieira (2003) e Fernandes, Fleury e Mills (2006). O estudo utilizou uma amostra probabilística aleatória simples, constituída por 279 observações, aplicada com técnicos-administrativos e docentes de 37 unidades administrativas de uma IES federal. A análise utilizou técnicas de análise fatorial, análise de correlação de Pearson e regressão linear múltipla. Os resultados indicam que quatro componentes da estrutura organizacional influenciam positivamente no desempenho, um tem efeito negativo, e um não apresenta relação. Conjuntamente, esses componentes apresentaram significância estatística, evidenciando a influência direta da estrutura organizacional no desempenho gerencial.