Marcadores RAPD na análise da diversidade genética de isolados de Acremonium strictum

Teixeira, Hudson; Vieira, Maria das Graças Guimarães Carvalho; Machado, José C.

doi:10.1590/s0100-41582004000600009

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“…According to Leslie and Summerell (2006), the combinations of phylogenetic and biological concepts have a high potential for consistent characterization of the genus Fusarium. Furthermore, the use of molecular techniques for DNA analysis has allowed the development of fast, sensitive, and specific methods, complementary to the diagnosis of pathogens, for complementary to the morphological analysis (TEIXEIRA et al, 2004).…”

Section: Resultsmentioning

confidence: 99%

Fusarium oxysporum and F. verticillioides associated with damping-off in Pinus spp.

Maciel

Walker

Santos³

et al. 2017

Revista Ciência Agronômica

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-Occurrence of Fusarium spp. is one of the problems, most limiting to growth of seedlings, in nurseries. This pathogen can be transmitted via seeds and causes damages to the seedlings during pre-and post-emergence stages. The present study aimed to identify Fusarium spp. at the species level based on morphological and molecular characteristics and to verify the pathogenicity of these isolates in seeds lots of Pinus elliottii and P. taeda. For this, we used two Fusarium isolates and five lots of Pinus spp. seeds. Morphological characterization was performed based on a key, specific to Fusarium spp. identification, whereas, molecular identification was carried out by amplification and sequencing of the regions from internal transcribed spacer (ITS) and the elongation factor 1-(tef1). The pathogenicity test was conducted through the contact of the seeds with fungal culture for 48 h, followed by sowing them in sand. The variables evaluated were emergency speed index, percentage of emergency, non-emergency seeds, symptomatic seedlings, and seedling damping-off. One isolate, F1UFSM, was identified as F. verticillioides and another isolate, F2UFSM, was identified as F. oxysporum. Both the isolates were pathogenic to the seeds of Pinus spp., causing a reduction in the percentage of emergence and seedling damping-off. Key words: ITS. Elongation factor (tef1). Pinus taeda. Pinus elliottii.RESUMO -A ocorrência de Fusarium spp. é um dos problemas mais limitantes em viveiros, esse patógeno pode ser transmitido via semente e causar danos em pré e pós-emergência. O presente trabalho objetivou identificar isolados de Fusarium spp. a nível de espécie e verificar a patogenicidade desses isolados em lotes de sementes de Pinus elliottii e P. taeda. Foram utilizados dois isolados do patógeno e cinco lotes de sementes de Pinus spp. Para caracterização molecular, sequenciaram-se as regiões genômicas: ITS e fator de elongação 1-(tef1), para morfologia dos isolados utilizaram-se chaves de identificação específica para o gênero Fusarium. O teste de patogenicidade foi realizado através do contato das sementes com a cultura fúngica por 48 horas, seguida de semeadura em areia. As variáveis avaliadas foram: índice de velocidade de emergência, porcentagem de emergência, plântulas sintomáticas e tombamento de plântulas. O isolado F1UFSM foi identificado como Fusarium verticillioides e o F2UFSM como F. oxysporum. Ambos foram patogênicos a P. taeda e P. elliottii, causando redução no percentual de emergência e tombamento de plântulas. Palavras-chave: ITS. Fator de elongação (tef1). Pinus taeda. Pinus elliottii.

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Fusarium oxysporum and F. verticillioides associated with damping-off in Pinus spp.

Maciel

Walker

Santos³

et al. 2017

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Variabilidade genética de isolados do cogumelo Agaricus blazei por meio de marcadores RAPD

et al. 2007

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RESUMOAgaricus blazei (Murrill) ss. Heinem. é um cogumelo nativo do Brasil que vem despertando a atenção de vários pesquisadores em todo o mundo, devido às suas propriedades farmacológicas e nutricionais. Este trabalho teve por objetivo, analisar a variabilidade genética de alguns isolados utilizados comercialmente, por meio de marcadores RAPD. Foram analisados nove isolados de A. blazei, provenientes de diferentes regiões do Brasil e, como controle, dois isolados de A. bisporus. Todos eles fazem parte da coleção de fungos do Laboratório de Cogumelos Comestíveis e Medicinais do DBI/UFLA. Diferentes primers aleatórios foram utilizados, gerando um total de 139 bandas polimórficas. Procedeu-se a avaliação de similaridade genética entre os isolados pelo coeficiente de Dice e análise de agrupamento pelo método UPGMA. Os resultados revelaram que dos 9 isolados de A. blazei, 6 (CS1, CS3, CS4, CS6, CS8 e CS9) apresentaram uma alta similaridade genética, sendo considerados isolados de uma mesma origem ou clones. O isolado CS2 foi o que apresentou a maior divergência genética em relação aos demais, seguido dos isolados CS5 e CS7, os quais formaram cada um, um grupo a parte, com médias de 60,6%, 88,7% e 91,3% de similaridade genética, respectivamente. Termos para indexação:Variabilidade, RAPD, Cogumelo, Agaricus blazei. ABSTRACTAgaricus blazei (Murrill) ss. Heinem. is a Brazilian native mushroom which has called the attention of several researchers all over the world due to its nutritional and pharmacological properties. The objective of this study was to evaluate the genetic variability of some isolates commercially used, using RAPD markers. Nine isolates of A. blazei were analyzed, from different regions in the country, and two isolates of the A. bisporus, which served as control group. All of them are part of the collection of mushroom of the Edible and Medicinal Mushroom Laboratory of DBI/UFLA. For RAPD analysis, different random primers were used, generating 139 polymorphic bands. The genetic similarity evaluation was proceeded between the isolates by means of Dice coefficient and grouping analysis through the UPGMA method. The results showed that from the 9 isolates of A. blazei, 6 (CS1, CS3, CS4, CS6, CS8 e CS9) have shown a high genetic similarity and these were considered isolates of the same origin or clones. The CS2 was the isolate which showed the higher genetic divergence in relation to the others, followed by the CS5 and CS7, with averages of 60.6%, 88.7% and 91.3% genetic similarity, respectively. Agaricus blazei (Murrill) ss. Heinemann é um cogumelo nativo do Brasil que se tornou mundialmente conhecido devido às suas propriedades farmacológicas e nutricionais. No Brasil, a espécie ficou conhecida popularmente como cogumelo do sol , pelo fato de crescer em campo aberto, sendo conhecido também como cogumelo piedade, cogumelo medicinal, cogumelo princesa, cogumelo-de-Deus, cogumelo da vida, cogumelo dos deuses (MIZUNO, 1995) e, mais recentemente, Champignon do Brasil (AMAZONAS, 2004). No Japão, ele é conhecido...

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Fusarium oxysporum and F. verticillioides associated with damping-off in Pinus spp.

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