Propriedades moleculares de um isolado brasileiro do Southern bean mosaic virus

Moreira, Andreia; Gaspar, José Carlos

doi:10.1590/s0100-41582002000300009

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“…O seqüenciamento dos isolados do SBMV de São Paulo (Moreira & Gaspar, 2002) e do Paraná permitirá verificar o grau de similaridade entre os dois isolados brasileiros do vírus com outros isolados já seqüenciados, e poderá contribuir para o entendimento das causas da variabilidade existente nas características biológicas das estirpes do SBMV.…”

Section: Fig 2 -unclassified

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Detecção do Southern bean mosaic virus no Paraná, e separação do Bean rugose mosaic virus em feijoeiro

et al. 2005

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Em lavouras de feijoeiro (Phaseolus vulgaris) da cultivar Carioca Comum, no município de Londrina, Estado do Paraná, foram encontradas plantas com sintomas de necrose da haste, mosaico clorótico leve e porte reduzido, semelhantes aos sintomas causados por infecção viral. Exames de microscopia eletrônica revelaram a presença de partículas isométricas. Em testes de imunodifusão dupla em gel de ágar os extratos foliares de plantas infetadas reagiram positivamente com anti-soro específico para o Southern bean mosaic virus (SBMV). O vírus foi purificado e a massa molecular de sua proteína capsidial foi estimada em 30 kDa, valor esperado para proteínas do capsídeo de vírus do gênero Sobemovirus. A gama de hospedeiras do SBMV isolado no Paraná foi restrita ao feijoeiro e a algumas cultivares de soja (Glycine max). A separação de dois vírus isométricos comuns em infecções mistas no feijoeiro foi possível através da reação de imunidade ao SBMV apresentada por Crotalaria sp, Chenopodium quinoa e Mucuna deeringiana, e da reação de susceptibilidade dessas mesmas hospedeiras ao Bean rugose mosaic virus (BRMV).

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“…Posteriormente foi encontrado no Estado de São Paulo (Costa, 1987), tendo sido este isolado parcialmente caracterizado ao nível molecular (Moreira & Gaspar, 2002).…”

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Detecção do Southern bean mosaic virus no Paraná, e separação do Bean rugose mosaic virus em feijoeiro

et al. 2005

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“…Mais recentemente, o vírus foi também encontrado no Estado do Paraná (SBMV-PR, Gasparin et al, 2005). Algumas propriedades moleculares foram determinadas para o isolado SBMV-SP: (a) as partículas virais apresentam diâmetro de 28-30 nm e a proteína capsidial possui massa molecular de 30 kDa; (b) das partículas virais foram extraídos RNAs de vários tamanhos, sendo o de 4,2 Kb o RNA genômico e o de 1,0 Kb supostamente um RNA subgenômico que codifica a proteína capsidial (Moreira & Gaspar, 2002).…”

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Caracterização da região 3'-terminal do genoma de um isolado brasileiro do Southern bean mosaic virus

et al. 2005

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O presente trabalho caracteriza a região 3'-terminal do genoma de um isolado do Southern bean mosaic virus encontrado no Estado de São Paulo (SBMV-SP). O RNA foi extraído de partículas virais purificadas e submetido a RT-PCR usando oligonucleotídeos desenhados para amplificar 972 nt da região 3'-terminal do RNA viral. Foi obtido fragmento de tamanho esperado que inclui o gene da proteína capsidial e a região 3'-terminal não codificadora. O gene da proteína capsidial (ORF4) contém 801 nucleotídeos, incluindo-se o códon de terminação UGA, com seqüência deduzida de 266 aminoácidos e massa molecular estimada de 28.800 Da. Sessenta e um aminoácidos terminais da ORF2 estão sobrepostos na ORF4. O "sinal de localização nuclear", encontrado dentro do "Domínio R" na região 5'-terminal da ORF4 de alguns sobemovírus, não foi identificado no SBMV-SP. Esse dado pode explicar a ausência de partículas virais do SBMV-SP no núcleo celular. A seqüência do SBMV-SP apresentou identidade de nucleotídeos e aminoácidos de, respectivamente, 91% e 93% com o isolado "Arkansas" (SBMV-ARK) descrito nos EUA. Os resultados obtidos indicam que o SBMV-SP e o SBMV-ARK são isolados muito proximamente relacionados.

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“…No Brasil, o SBMV foi detectado pela primeira vez em feijoeiros na região do Distrito Federal (SBMV-DF; Cupertino et al, 1982) Moreira & Gaspar (2002). Após purificação, uma alíquota do vírus foi tratada com SDS 2,5% e NaCl 0,1 M com aquecimento por 3 min à 55 o C. Em seguida foi acrescentado igual volume de fenol (equilibrado com tampão citrato de sódio 0,1 M pH 4,3), agitada manualmente por 30 s e, então, centrifugada para a separação das fases.…”

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Caracterização da região 5'-terminal de um isolado brasileiro do Southern bean mosaic virus<a href="#back1"></a>

et al. 2004

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O presente trabalho caracteriza a região 5'-terminal de um isolado do Southern bean mosaic virus encontrado no Estado de São Paulo (SBMV-SP). O RNA foi extraído de partículas virais purificadas e submetido a RT-PCR usando oligonucleotídeos desenhados para amplificar cerca de 590 nt da região 5'-terminal do RNA viral. Foi obtido um fragmento de tamanho esperado que, após clonagem e seqüenciamento, mostrou a existência de uma região não codificadora com 92 nt e a primeira ORF, começando no primeiro AUG (posição 93) e terminando no códon UGA na posição 534. Na região não codificadora foi detectado um segmento parcialmente complementar ao RNA ribossomal 18S. A ORF1 codifica uma proteína de 147 aminoácidos com massa molecular estimada de 17080 Da. A extremidade 3' da ORF1 sobrepõe a extremidade 5' da ORF2 em 34 nucleotídeos. Os resultados obtidos indicam que a região 5'-terminal do RNA do SBMV-SP é similar ao isolado Arkansas (SBMV-ARK) descrito na América do Norte.

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Propriedades moleculares de um isolado brasileiro do Southern bean mosaic virus

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Detecção do Southern bean mosaic virus no Paraná, e separação do Bean rugose mosaic virus em feijoeiro

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