Identificação por PCR dos alelos-S associados à compatibilidade gametofítica em ameixeira japonesa

Abstract

Resumo -O objetivo deste trabalho foi identificar e caracterizar molecularmente os alelos-S de cultivares de ameixeira japonesa e verificar a compatibilidade gametofítica entre estes. Foram utilizados dois pares de iniciadores específicos na amplificação dos alelos via PCR, em 18 cultivares: Pluma 7, Gulf Rubi, Blood Plum, Wickson, América, Santa Rosa, Rosa Mineira, Estrela Púrpura, Amarelinha, The First, Harry Pieckstone, Santa Rita, Seleção 16, Seleção A26 (Burbank), Seleção 21, Seleção 19, Methley e Simka. As condições da PCR e as combinações de oligonucleotídeos iniciadores utilizadas permitiram a identificação de alelos-S nas cultivares, bem como a indicação dos polinizadores mais compatíveis. As cultivares América e Santa Rosa, bem como Blood Plum, Wickson, Rosa Mineira, Estrela Púrpura e Seleção 21 apresentam incompatibilidade total entre si, por compartilharem os mesmos alelos.Termos para indexação: Prunus salicina, autoincompatibilidade gametofítica, S-RNase. Identification by PCR of S-alleles associated with gametophytic compatibility in Japanese plumAbstract -The objective of this work was to molecularly identify and characterize the S-alleles of Japanese plum cultivars and to verify the gametophytic compatibility between them. Two pairs of specific primers were used for allele amplification by PCR in 18 cultivars: Pluma 7, Gulf Rubi, Blood Plum, Wickson, América, Santa Rosa, Rosa Mineira, Estrela Púrpura, Amarelinha, The First, Harry Pieckstone, Santa Rita, Seleção 16, Seleção A26 (Burbank), Seleção 21, Seleção 19, Methley, and Simka. PCR conditions and oligonucleotide primer combinations used allowed the identification of S-alleles in cultivars, as well as the indication of the most compatible pollinators. América and Santa Rosa cultivars, as well as Blood Plum, Wickson, Rosa Mineira, Estrela Púrpura, and Seleção 21 show total incompatibility among each other, since they share the same alleles.

Identification and Characterization of S-RNases in Japanese Plum Genotypes

“…The identification and characterization of the allelic series (S-alleles), which is named 'S 1 ', 'S 2 ', 'S 3 ', 'S 4 ', and 'S 5 ' or 'S a ', 'S h ', 'S i ', 'S c ', and 'S e ', that encode the RNases in the stigma of the Japanese Plum cultivars, can help to manage orchards, since the cultivation of genotypes with different alleles may increase fertilization and effective fruit set (Ushijima et al, 1998;De Nettancourt, 2001;Kondo et al, 2002;De Conti et al, 2013;Sassa, 2016). Molecular studies to understand the reproductive process in Prunus species are focused on the identification and characterization of S-RNases genes through tools like Polymerase Chain Reaction (PCR) and DNA sequencing.…”