As atividades de inovação vêm sendo crescentemente consideradas centrais para o desenvolvimento econômico. Diante disso, são reforçados os discursos em defesa do fomento público a essas atividades, o que legitima a adoção de políticas de incentivo. Pelo fato de Brasil e Argentina deterem proeminência na América Latina em matéria de política de inovação, o presente artigo objetivou realizar uma análise comparada de suas políticas de fomento (com enfoque sobre os instrumentos adotados nos dois países durante os governos neodesenvolvimentistas petista e kirchnerista, abrangendo o período 2003 a 2015). Para alcançar tal objetivo, fez-se uso de revisão bibliográfica e documental e mapeamento dos instrumentos de fomento empregues, a partir da base GO SPIN - UNESCO. Em que pese as particularidades de cada contexto nacional, foram constatadas diversas similaridades na conformação das políticas brasileira e argentina de inovação quando vigentes os governos neodesenvolvimentistas.