A Síndrome de Sobreposição (SS) associada ao Lúpus Eritematoso Sistêmico (LES) e Líquen Plano (LP), entidade rara, é caracterizada por sinais clínicos e imuno-histopatológicos sincrônicos de ambos. Relatamos o caso de uma paciente do sexo feminino, 39 anos, com diagnóstico de LES, apresentando lesões intraorais cujas hipóteses diagnósticas foram Líquen Plano Oral (LPO) e LES. Neste cenário, o presente estudo teve como objetivo descrever as patologias citadas, assim como expor as dificuldades do processo diagnóstico da síndrome de sobreposição em questão, explanando as etapas da doença e o tratamento realizado. O trabalho foi realizado através de um estudo de caso com objetivos descritivos e abordagem qualitativa utilizando-se de conhecimentos clínicos da dermatologia, estomatologia e reumatologia, com base em pesquisa bibliográfica e revisão de literatura integrativa em bases de dados digitais juntamente com a análise de exames complementares, histopatológicos e de imunofluoerescência. Na biópsia de lesões clinicamente ambíguas, como no caso das lesões orais da paciente, características histopatológicas de um ou ambos os processos podem ser encontrados simultaneamente ou oscilando em períodos diferentes, dificultando o diagnóstico e complicando o prognóstico e tratamento. Assim, foi observado que a imunofluorescência direta (IFD) tornou-se uma ferramenta essencial para auxiliar no diagnóstico dessa condição. Este caso reforça que a SS possui um diagnóstico desafiador e seu tratamento envolve vários profissionais para gerenciá-la.