РезюмеВ лекции представлены достижения послед-них лет по систематике микроорганизмов. При-веден терминологический словарь, приведены правила и порядок присвоения названий бак-териям. Описываются принципы систематики микроорганизмов, отличия прокариотов и эу-кариотов. Представлена современная класси-фикация бактерий, имеющих медицинское зна-чение, согласно 2-му изданию «Bergeyꞌs Manual of Systematic Bacteriology», дано краткое описа-ние доменов «Archeae» и «Bacteria».Ключевые слова: систематика, классифика-ция, прокариоты, таксономия, номеклатура. AbstractThe lecture presents the recent advances in the taxonomy of microorganisms, the terminology, the principles, the rules, and the procedure for naming bacteria. In addition, we describe the differences between pro-and eukaryotes and between Archaea and Bacteria domains. Finally, we report the classification of bacteria relevant for basic, translational, and clinical medicine according to the 2nd edition of Bergey's Manual of Systematic Bacteriology.Keywords: systematics, classification, prokaryotes, taxonomy, nomenclature. English АктуальностьРасширение спектра возбудителей инфекци-онных и оппортунистических инфекций чело-века, многообразие их свойств требуют посто-янного совершенствования знаний о микроор-ганизмах. Компетентность врачей и другого ме-дицинского персонала в вопросах тактики на начальном (долабораторном) и конечном (ин-терпретация) этапах микробиологической диа-гностики, а не только работа бактериологов по выделению и идентификации микроорганизмов в целом будут определять качество и успех ле-чения конкретного пациента. В связи с этим не-обходима постоянная актуализация знаний по систематике и таксономии микроорганизмов, принципам их классификации и номенклатуры. Термины и понятияСистематика (греч. systema -целое, со-ставленное из частей; systematicos -упорядо-ченный) -биологическая наука, которая за-нимается всесторонним описанием микроор-ганизмов, выяснением степени родства меж-ду ними и распределением на соподчиненные группы. Цель систематики -создать класси-фикацию.Классификация (лат. classis -разряд, груп-па) -это процесс разделения множества ор-ганизмов на основании общих признаков на определенные таксономические группы.Таксономия (греч. taxis -расположение по порядку, закон) -это раздел систематики, изу-чающий принципы и методы распределения
The aim: In vitro identification of targets for antagonism factors in klebsiellas and enterococci for Candida albicans isolated from the intestinal microbiome of HIV infected patients.Materials and methods. The tests were performed using 38 Candida albicans strains, 28 Klebsiella pneumoniae strains, and 30 Enterococcus faecalis strains isolated from the intestinal microbiome of 89 HIV infected children. The mean age of the patients was 24 ± 2 months; the group consisted of 49 (55%) boys and 40 (45%) girls. Microorganisms were isolated from the intestinal biotope using such selective media as HiChrome Candida Agar, HiChrome Klebsiella Selective Agar Base, and Enterococcus Agar; the study included identification of species. Model experiments were performed to study anti-catalase activity of E. faecalis exometabolites and the impact of K. pneumoniae on morphological transformation of C. albicans fungi.Results. Klebsiellas decrease the intensity of germ tube formation in C. albicans by 58.7% (p < 0.01). When cocultured, 12.3% of the yeast cells produce germ tubes, while 29.8% of transformed cells was detected in the fungal monoculture. It has been found that exometabolites of 65.7% of E. faecalis strains decrease production of catalase in C. albicans. The initial catalase level in untreated cultures of C. albicans averages 1.02 µmol/min of optical density; after they are treated with E. faecalis exometabolites, the level decreases to 0.55 µmol/min, i.e. by 46.1% (p < 0.05).Conclusions. K. pneumoniae and E. faecalis demonstrate antagonism of different intensity toward C. albicans. Morphological transformation and catalase production are targets for antagonism factors of facultative microbiota in C. albicans.
Кемеровский государственный медицинский университет Цель. Оценить биологические свойства бифидобактерий у ВИЧ-инфицированных детей при различных степенях дисбактериоза кишечника для определения направлений коррекции бифидофлоры при ВИЧ-инфекции. Материалы и методы. Выделено 58 культур бифидобактерий от ВИЧ-инфицированных детей, 45 от детей группы сравнения. У бифидобактерий изучены индекс адгезии микроорганизмов (ИАМ), гидрофобность (Н), кислотообразование, антиоксидантная активность (АОА), отсроченный антагонизм к условно патогенным микроорганизмам. Результаты. У ВИЧ-инфицированных детей при I степени дисбактериоза кишечника биологические свойства бифидобактерий не отличались от группы сравнения (p>0,05).
Exopolysaccharide (EPS) production is a widespread phenotypic trait in many commensal and pathogenic microorganisms. In bifidobacteria, the discovery of the eps gene cluster propelled the multiple studies of their EPS, which represent heteropolysaccharides and generally consist of three monosaccharides: D-glucose, D-galactose, and L-rhamnose. EPS of B. animalis subsp. lactis additionally contains mannose while EPS of B. adolescentis and B. longum subsp. longum contains 6-deoxytealose. The number of repeat units in bifidobacterial EPS is a straincharacteristic feature. Precursors of the indicated EPS monomers are glucose-1-phosphate and fructose-6-phosphate, and the synthesis involves nucleotide sugar intermediates. Two molecular systems are implica in polymerisation and polymer secretion in bifidobacteria: ABC transporters and fippase polymerase complex (Wzx/Wzydependent pathway). EPS perform numerous functions. They protect bifidobacteria from aggressive gastrointestinal milieu and reactive oxygen species, provide a scaffold for the bacterial-bacterial interactions, and act as the receptors for phage adsorption. Further, EPS are used by the other members of the gut microbiota as substrates for nutrition, i.e. bifidobacteria regulate the composition and metabolic activity of intestinal microorganisms. Therefore, EPS-producing strains exhibit pronounced antibacterial effects due to the binding of opportunistic and pathogenic microbes. Finally, EPS can act as pathogen-associated molecular patterns. Beneficial effects of bifidobacterial EPS determined the possibility of their use as prebiotics or as a part of symbiotics. The main limitation in this regard is the low yield of the target product when culturing EPS-producing strains. Therefore, current research is aimed at finding novel EPSproducing strains among the bifidobacteria and creating favorable technological conditions that promote EPS production.
Цель-оценка in vitro влияния ДНК, выделенной из пробиотического штамма Bifidobacterium bifidum 791, на количественный уровень и адгезивные свойства фекальных изолятов бифидобактерий и условно-патогенных микроорганизмов разных видов. Материалы и методы. ДНК выделяли из пробиотического штамма B. bifidum 791. Биомассу бифидобактерий отмывали от питательной среды. Взвесь бактерий в буферном растворе трижды подвергали ультразвуковой обработке с частотой 40 кГц в течение 30 мин с последующим центрифугированием. Супернатанты объединяли и очищали хроматографически на Сефарозе CL-4B. В качестве тест-культур использовали B. breve, B. bifidum, B. infantis, Staphylococcus aureus, Escherichia coli lac-, Enterococcus faecalis, Candida albicans, изолированные из кишечника взрослых относительно здоровых людей. Результаты. Раствор нуклеиновой кислоты концентрацией 3,54 мкг/мл не влиял на количественный уровень бифидобактерий (p = 0,61). Cодержание ДНК в растворе 14,15-21,23 мкг/мл способствовало увеличению титров B. bifidum и B. breve на 2 lg КОЕ/мл по сравнению с контролем (p = 0,01), но не влияло на титры S. aureus, E. coli lacE E. faecalis, C. albicans (p = 0,73). Раствор ДНК повышал аутоагрегацию бифидобактерий в 1,5-2,0 раза. Способность к аутоагрегации под влиянием бифидобактериальной ДНК у S. aureus, E. faecalis, C. albicans не изменялась, у E. coli lac-увеличивалась в 2,3 раза (p = 0,05). Заключение. Раствор ДНК пробиотического штамма B. bifidum 791 концентрацией 14,15-21,23 мкг/мл стимулирует размножение и аутоагрегацию B. breve, B. bifidum фекального происхождения. Ключевые слова: ДНК; бифидобактерии; количественный уровень; аутоагрегация. Источник финансирования. Авторы заявляют об отсутствии финансирования при проведении исследования. Конфликт интересов. Авторы декларируют отсутствие явных и потенциальных конфликтов интересов, связанных с публикацией настоящей статьи. Для цитирования: Захарова Ю.В., Сухих А.С., Леванова Л.А., Плотникова Е.Ю. Изучение in vitro влияния ДНК пробиотического штамма Bifidobacterium bifidum на количественный уровень и колонизационные свойства кишечных микросимбионтов.
вовоспалительной терапии на минеральную плотность кости у больных анкилозирующим спондилитом: результаты проспективного наблюдения (Кемерово) Ильинских Н.Н., Ильинских Е.Н. Мониторинг цитогенетических последствий у больных весенне-летним клещевым энцефалитом (Томск) Шакирова Е.А., Артымук Н.В. Факторы риска неэффективности лечения и рецидивирующего течения гиперпластических процессов эндометрия у женщин репродуктивного возраста с ожирением (Кемерово) Воронкина А.В., Раскина Т.А., Малюта Е.Б., Летаева М.В., Хрячкова О.Н., Коков А.Н., Барбараш О.Л. Биохимические маркеры костного метаболизма у мужчин с ишемической болезнью сердца (Кемерово) Пьянзова Т.В., Каган Е.С., Аброськина А.А. Построение интегрального показателя комплексной оценки факторов риска неэффективного исхода противотуберкулезной терапии (Кемерово) Потапов И.В., Сухих А.С. Окислительно-восстановительные свойства комплексных соединений фторхинолонов с ионами меди (II) (Кемерово) Леванова Л.А., Захарова Ю.В. Значение биологических свойств клебсиелл в формировании нарушений микробиоценоза кишечника (Кемерово) Ширлина Н.Г., Стасенко В.Л., Ширинский В.А., Долгих Т.И. Эпидемиологическая характеристика рака молочной железы у женского населения Омской области (Омск) Коськина Е.В., Глебова Л.А., Бачина А.В., Чухров Ю.С., Власова О.П., Пеганова Ю.А. Гигиеническая оценка формирования нарушения здоровья детского населения при комплексном воздействии факторов окружающей среды в углехимических центрах Кузбасса (Кемерово) Червов В.О., Артымук Н.В. Информированность и онкологическая настороженность к раку органов репродуктивной системы у женщин Кемеровской области (Кемерово) Шапкин А.А., Ефименко И.В. Хилоторакс в хирургической практике: диагностика и лечение (Кемерово) ОБЗОРЫ Барбараш Н.А., Кувшинов Д.Ю. Актуальные проблемы предгипертонии (Кемерово) Кутихин А.Г. Минерало-органические наночастицы: природа, биологический смысл, механизмы патогенности (Кемерово) Кульпин П.В., Федорова Ю.С. Современные перспективы в химико-фармакологическом исследовании биологически активных веществ растения Garcinia mangostana L.
Aim. To evaluate the role of intestinal dysbiosis in the development of urinary tract infections in children admitted to a multidisciplinary hospital.Materials and Methods. We performed a bacteriological analysis of 2,694 urine samples collected from ≤ 3-years-old children who have been admitted to a multidisciplinary hospital (Kemerovo, Russian Federation). Urine specimens were inoculated by the 4-sector technique. Concurrently, we quantified the intestinal microbiota and its antimicrobial resistance in 100 children with urinary tract infections.Results. Titers of pathogenic microbes significantly differed in patients from distinct units (p = 0.02). The highest number of positive samples was detected in the neonatal pathology and neonatal intensive care units (43.8% each) as well as urology unit (37.9%). The most frequent pathogens belonged to Enterobacteriaceae family, in particular Escherichia coli, Klebsiella spp., Enterobacter spp., and Proteus spp. All studied children (100/100) suffered from intestinal dysbiosis. Titers of Bifidobacterium spp. and Lactobacillus spp. were reduced to 6 (5.0; 8.0) and 5 (4.0; 6.0) lg CFU/g, respectively. In 89.2% children, Escherichia coli lac+ levels were elevated to 9-10 lg CFU/g. Of note, 18.9% children had high Escherichia coli lac- titers [8 (6.0; 9.0) lg] and 24.3% had high Escherichia coli hly+ titers [5 (4.5; 6.0) lg] in the intestine. We have also found a high frequency (44.6%) and density [8.1 (7.0; 8.5) lg] of Klebsiella spp., in the intestinal mucosa of such patients. Notably, Enterobacter spp. and Proteus spp. were abundant [7 (5.0; 8.0) CFU/g] in the intestinal microbiota of 10.8% children. The prevalence of resistance strains in the studied setting reached 63%.Conclusions. More than 75% children with urinary tract infections suffer from intestinal dysbiosis. The microbiome of these patients was predominantly composed of Enterobacteriaceae and was characterized by high titers of Escherichia coli lac+, Klebsiella spp., Enterobacte spp., and Proteus spp. Similar profile of antimicrobial resistance in urinary and intestinal isolates of enterobacteria suggests intestinal microbiome as the main source of pathogens causing urinary tract infections in children.
scite is a Brooklyn-based organization that helps researchers better discover and understand research articles through Smart Citations–citations that display the context of the citation and describe whether the article provides supporting or contrasting evidence. scite is used by students and researchers from around the world and is funded in part by the National Science Foundation and the National Institute on Drug Abuse of the National Institutes of Health.
hi@scite.ai
334 Leonard St
Brooklyn, NY 11211
Copyright © 2024 scite LLC. All rights reserved.
Made with 💙 for researchers
Part of the Research Solutions Family.