No abstract

сибирская язва -особо опасная инфекция, общая для человека и животных, способная, проявившись однажды на какой-либо территории, сохранять угрозу повторных вспышек на многие десятилетия. начиная с 1900 г., на территории россии зарегистрировано более 70 тыс. вспышек инфекции среди людей и животных. достаточно полный учет поголовья животных, внедрение их массовой иммунизации, а также запрет захоронения туш и останков животных, павших от сибирской язвы, в почву привели к резкому снижению уровня заболеваемо-сти скота как основного источника ее возбудителя. одновременно с этим снижалась заболеваемость людей, чему также способствовало введение санитарноэпидемиологического надзора на предприятиях по переработке животного сырья и плановая иммунизация населения, подверженного профессиональному риску инфицирования.проводимые меры позволили снизить заболеваемость сибирской язвой среди сельскохозяйственных животных и людей, однако эпизоотии и эпидемические очаги регистрируются ежегодно. так, в течение Пробл. особо опасных инф. 2017; 1:84-88. .н.куличенко 3 , а.Г.рязанова 3 , н.П.буравцева 3 , е.и.еременко 3 , и.а.Дятлов 4 , В.В.малеев 5 , е.Г.симонова 5,6 , с.а.картавая 5 , и.Г.карнаухов 7 , В.П.Топорков 7 пути СовершенСтвования ЭпидеМиологичеСкого надзора и контроля за СибирСкой язвой в роССийСкой Федерации 1 Федеральная служба по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека, Москва; 2 ФГБОУ ДПО «Российская медицинская академия непрерывного профессионального образования», Москва; 3 ФКУЗ «Ставропольский научно-исследовательский противочумный институт», Ставрополь; 4 ФБУН «Государственный научный центр прикладной микробиологии и биотехнологии», п. Оболенск; 5 ФБУН «Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии», Москва; 6 ФГБОУ ВО Первый Московский государственный медицинский университет им. И.М.Сеченова, Москва; 7 ФКУЗ «Российский научно-исследовательский противочумный институт «Микроб», Саратов, Российская Федерацияприведены обобщенные данные по эпидемиологической и эпизоотологической обстановке по сибирской язве в российской Федерации, проанализированы причины неустойчивости ситуации. охарактеризованы современные клинико-эпидемиологические особенности сибиреязвенной инфекции. представлены ключевые направления совершенствования эпидемиологического надзора и контроля за сибирской язвой в современных условиях, основанные на системном подходе и эффективном межведомственном взаимодействии.Ключевые слова: сибирская язва, эпидемиологическая и эпизоотологическая ситуация, стационарно неблагополучные пункты, сибиреязвенные захоронения, эпидемиологический надзор, профилактические и противоэпидемические мероприятия.Presented are summarized data on anthrax epidemiological and epizootiological situation in the Russian Federation. The causes of the unstable situation are analyzed. Characterized are modern clinical and epidemiological features of anthrax infection, as well as key areas for improvement of surveillance and control of anthrax in the current conditions based on a systematic approach and effec...

Background Anthrax is a zoonotic disease caused by the Gram-positive bacterium Bacillus anthracis . In Russia, there are more than 35 thousand anthrax stationary unfavourable sites. At the same time, there is very little published information about the isolates of B. anthracis from the territory of Russia. In this study, we report the use of whole genome sequencing (WGS) and bioinformatics analysis to characterize B. anthracis 81/1 strain isolated in Russia in 1969 from a person during an outbreak of the disease in the Stavropol region. Results We used 232 B. anthracis genomes, which are currently available in the GenBank database, to determine the place of the Russian isolate in the global phylogeny of B. anthracis . The studied strain was characterized by PCR-based genetic methods, such as Multiple-Locus Variable-Number Tandem Repeat Analysis (MLVA), canonical single nucleotide polymorphisms (canSNP), as well as the method of full-genomic analysis of nucleotide polymorphisms (wgSNP). The results indicate that the Russian B. anthracis 81/1 strain belongs to Trans-Eurasion (TEA) group, the most representative in the world. Conclusions In this study, the full genomic sequence of virulent B. anthracis strain from Russia was characterized for the first time. As a result of complex phylogenetic analysis, the place of this isolate was determined in the global phylogenetic structure of the B. anthracis population, expanding our knowledge of anthrax phylogeography in Russia. Electronic supplementary material The online version of this article (10.1186/s12866-019-1542-3) contains supplementary material, which is available to authorized users.

Background Anthrax is a zoonotic disease caused by the gram-positive bacterium Bacillus anthracis . The most anthrax-endemic regions of Russia are Siberia and North Caucasus. Previously, genotyping of Russian B.anthracis isolates was carried out using canSNP and MLVA data; these methods yield lower resolution results compared to whole genome SNP analysis (wgSNP). In this research, we have used wgSNP method for genotyping of 10 B.anthracis isolates, obtained during 1961–2016 in Russia on territory of Western Siberia. Results We have analyzed 185 B.anthracis genomes available in GenBank database and genomes of 10 isolates obtained in this study to determine the place of Russian isolates in the global phylogeny of B.anthracis . For the studied genomes we have detected 7203 SNPs, which were used for building a phylogenetic reconstruction with Maximum Likelihood Method. Results of the phylogenetic analysis indicate that Russian strains belong to three different genetic groups. Three strains belong to genetic group “Ames”, two strains – to “STI” group. Five strains belong to the main genetic line B, and four of them form a subcluster, described for the first time, which we have named “Siberia”. Conclusions In this study, the data on genetic diversity of B.anthracis strains on the territory of Western Siberia is presented for the first time. As a result of complex phylogenetic analysis, the place of these isolates was determined in the global phylogenetic structure of the B.anthracis population. We describe a new cluster in the main genetic line B for the first time. Electronic supplementary material The online version of this article (10.1186/s12864-019-6060-z) contains supplementary material, which is available to authorized users.

Проблемы особо опасных инфекций. 2019; 1 ОБЗОРЫ 98 сибирская язва продолжает оставаться актуальной проблемой здравоохранения в мире, странах снг и российской Федерации [1][2][3][4][5][6].Сибирская язва в Российской Федерации. в 2018 г. сибирская язва зарегистрирована в двух субъ-ектах россии -республиках дагестан и тыва. в апреле в республике дагестан зафиксирован один случай заболевания сибирской язвой. инфицирование жительницы пос. временный (с. гимры унцукульского района) произошло при Ситуация По СибирСкой яЗве в 2018 г., ПрогноЗ на 2019 г.1 ФКУЗ «Ставропольский научно-исследовательский противочумный институт», Ставрополь, Российская Федерация; 2 Федеральная служба по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека, Москва, Российская Федерация в обзоре проведен анализ заболеваемости сибирской язвой в российской Федерации за период с 2009 по 2018 год, показавший, что инфекция среди людей регистрировались в 14 субъектах шести федеральных округов. выявлено 23 вспышки сибирской язвы среди людей, в процессе которых заболело 90 человек с тремя летальными исходами. в сравнении с предыдущим десятилетним периодом (1999-2008 гг.) число случаев заболевания сократилось в 1,6 раза. в 2018 г. зарегистрировано три случая кожной формы сибирской язвы в двух субъектах российской Федерации -республиках дагестан (1) и тыва (2). вспышки инфекции среди сельскохозяйственных животных и людей также зафиксированы в государствах ближнего зарубежья -грузии, казахстане, китае, кыргызстане и украине. эпизоотолого-эпидемиологическое неблагополучие по сибирской язве отмечено в ряде стран азии и африки. заражение людей происходило в результате контакта с больными и павшими животными в процессе убоя и разделки туш, а также употребления в пищу зараженного мяса. уровень заболеваемости животных и людей сибирской язвой в российской Федерации в 2019 г. будет зависеть от полноты реализации планов по профилактике сибирской язвы и при их максимальном выполнении не будет превышать регистрации единичных случаев.Ключевые слова: сибирская язва, вспышка, заболеваемость, Bacillus anthracis.Abstract. Analysis of the anthrax incidence in the Russian Federation over the period of 2009-2018 showed that the infections among the population were recorded in 14 regions of 6 Federal Districts. 23 anthrax outbreaks among people were revealed, where 90 people got sick with 3 lethal outcomes. In comparison to the previous ten-year period (1999)(2000)(2001)(2002)(2003)(2004)(2005)(2006)(2007)(2008), the number of cases of the disease was reduced by 1.6 times. Three cases of cutaneous anthrax were registered in two constituent entities of the Russian Federation in 2018 -the Republic of Dagestan (1) and the Republic of Tyva (2). Outbreaks of infection among livestock animals and people were recorded in such neighboring states as Georgia, Kazakhstan, China, Kyrgyzstan, and Ukraine. Epizootiological and epidemiological instability as regards anthrax was observed in several countries of Asia and Africa. Human infection occurred as a result of contact with ...