Numerous studies have reported genetic fragmentation of species whose habitat has been modified by roads and other anthropogenic features, but it is still not clear how most species respond to roads and whether genetic effects can be detected over a limited number of generations. We used road-crossing models and population genetic analysis (based on microsatellite loci) to make inferences about functional connectivity between populations of the Prairie Rattlesnake (Crotalus viridis (Rafinesque, 1818)) on opposite sides of the Trans-Canada Highway near Medicine Hat (Alberta, Canada). The road-crossing model predicted a high probability of mortality while crossing the Trans-Canada Highway. However, model-based genetic clustering methods (STRUCTURE and BAPS) did not detect structure; a nonmodel-based clustering method (DAPC) found structure, but most groups consisted of individuals captured throughout the study area. Estimates of effective population size were immeasurably large and power to detect genic differentiation was diminished if the effective size exceeded 500; this reduction in power was intensified when the number of loci was reduced (from eight to five to account for null alleles). Our results corroborate accounts of long-distance migration by this species and indicate that genetic fragmentation may not be easily detectable over this spatial and temporal scale. Résumé :Si de nombreuses études ont fait état de la fragmentation génétique d'espèces dont l'habitat a été modifié par des routes ou d'autres éléments d'origine humaine, la réaction de la plupart des espèces à la présence de routes n'est pas bien circonscrite, ni la question à savoir si ses effets génétiques peuvent être détectés sur un nombre restreint de générations. Nous avons utilisé des modèles de franchissement de route et l'analyse génétique des populations (basée sur les marqueurs microsatellites) pour établir des inférences concernant la connectivité fonctionnelle de populations de crotales de l'ouest (Crotalus viridis (Rafinesque, 1818)) de part et d'autre de la route Transcanadienne près de Medicine Hat (Alberta, Canada). Le modèle de franchissement de route prédisait une probabilité élevée de mortalité durant le franchissement de la Transcanadienne. Toutefois, des méthodes de regroupement génétique basées sur des modèles (STRUCTURE et BAPS) n'ont détecté aucune structure; une méthode de regroupement non basée sur un modèle (DAPC) a décelé une structure, mais la plupart des groupes étaient composés d'individus capturés dans toute la région à l'étude. Les estimations de la taille effective des populations étaient trop grandes pour être mesurées et la puissance de détection d'une éventuelle différentiation génétique se trouvait réduite si la taille effective dépassait 500. Cette réduction de la puissance était amplifiée quand le nombre de marqueurs microsatellites était réduit (de huit à cinq pour tenir compte d'allèles nuls). Nos résultats corroborent les cas signalés de migrations sur de grandes distances par cette espèce et indiquent q...
scite is a Brooklyn-based organization that helps researchers better discover and understand research articles through Smart Citations–citations that display the context of the citation and describe whether the article provides supporting or contrasting evidence. scite is used by students and researchers from around the world and is funded in part by the National Science Foundation and the National Institute on Drug Abuse of the National Institutes of Health.
hi@scite.ai
10624 S. Eastern Ave., Ste. A-614
Henderson, NV 89052, USA
Copyright © 2024 scite LLC. All rights reserved.
Made with 💙 for researchers
Part of the Research Solutions Family.