Molecular Quantum Similarity (MQS) descriptors and Density Functional Theory (DFT) based reactivity descriptors were studied for a series of 4-Acetylamino-2-(3,5-dimethylpyrazol-1-yl)-6-pyridylpyrimidines compounds used for Parkinson’s disease (PD) treatment. The quantification of the steric and electronic effects was shown through scales of quantitative convergence; such scales allow us to establish a methodology to quantify the similarity from the local chemical reactivity (Fukui Functions) point of view. This procedure provides new considerations in the local reactivity of the A2A Adenosine receptor antagonists in a disease of difficult control as PD. In addition, we present new considerations to the localized bonding theory and show a new methodology for quantum similarity on the Fukui Functions. Considering that the Fukui functions under a condensation scheme may have ambiguities in the (DFT) context.
Objetivo: Evaluar las interacciones proteína-proteína que pueden darse entre fragmentos de la proteína fibrilina-1, cuyas mutaciones causan el síndrome de Marfan (SM). Materiales y métodos: Se realizaron una serie de cálculos docking proteína-proteína entre las macromoléculas de interés se empleó el programa Molsoft ICM, se utilizaron las estructuras cristalinas de la proteína Integrina αVβ3 y de fragmentos de la proteína fibrilina-1, además se generaron mutaciones en la fibrilina-1, las cuales son características en pacientes con síndrome de Marfan, realizando posteriormente el acoplamiento molecular. Se determinó los aminoácidos que con mayor frecuencia estaban presentes en el sitio de interacción y su hidrofobicidad. Resultados: Se cuantifico la cantidad de aminoácidos hidrófobos presentes en las zonas de interacción dadas por los acoplamientos, teniendo en cuenta la energía del sistema, estuvo entre el 40 y 50 % de los aminoácidos de la zona de interacción, con un porcentaje mayor con respecto a aminoácidos neutros o cargados. En los resultados obtenidos utilizando las mutaciones realizadas sobre los fragmentos cbEGF22-TB4-cbEGF23 y cbEGF9-hyb2-cbEGF10 de la fibrilina-1, se encontró que no se ubicaron en zonas cercanas al sitio de interacción en la mayoría de los casos. Conclusiones: Las interacciones entre los fragmentos de fibrilina-1, y estos con respecto a la integrina mostraron en sus zonas de interacción la presencia mayoritariamente de aminoácidos hidrofóbicos, que es lo esperado normalmente.
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