RESUMO -Com o objetivo de avaliar o efeito da interação genótipo × ambiente sobre os pesos ao nascimento (PN), à desmama (P205) e ao sobreano (P550), foram analisados registros de peso de 10.874 animais da raça Nelore, filhos de 425 touros e de 7.629 vacas, criados em 46 fazendas nos três estados do Sul do Brasil no período de 1976 a 2001. Os componentes de (co)variância utilizados para estimar os parâmetros genéticos foram obtidos pelo REML, sob modelo animal, em análises uni e bivariadas. Os modelos consideraram aleatórios os efeitos genéticos aditivos direto (PN, P205 e P550) e materno (PN e P205) e o efeito residual e, como fixos, os efeitos de grupo de contemporâneos (PN, P205 e P550), regime alimentar (P205 e P550), condição de criação (P205 e P550), além da idade da vaca ao parto (PN e P205) como covariável, com os efeitos lineares e quadráticos. As herdabilidades diretas para cada estado variaram de 0,38 ± 0,04 a 0,56 ± 0,08; de 0,22 ± 0,03 a 0,47 ± 0,05 e de 0,35 ± 0,03 a 0,51 ± 0,05, respectivamente, para PN, P205 e P550; as herdabilidades maternas variaram de 0,19 ± 0,03 a 0,31 ± 0,03 e de 0,16 ± 0,08 a 0,48 ± 0,07, respectivamente, para PN e P205. As correlações genéticas estimadas entre os estados foram 0,75 ± 0,03; 0,25 ± 0,05; e 0,64 ± 0,07 para PN; 0,79 ± 0,08; -0,04 ± 0,07; e 0,41 ± 0,07 para P205; e 0,53 ± 0,02; 0,08 ± 0,15; e 0,76 ± 0,09 para P550, respectivamente, para os estados do Rio Grande do Sul e Santa Catarina, Rio Grande do Sul e Paraná e Santa Catarina e Paraná. De modo geral, as correlações de Spearman entre as DEP preditas nos estados foram baixas e indicam alterações na ordem de classificação dos reprodutores, como conseqüência da interação genótipo × ambiente.Palavras-chave: avaliação genética, bovinos de corte, classificação, correlação genética, herdabilidade Genotype and environment interaction effect on weights at birth, 205 and 550 days of age of Nellore cattle in the South Region of BrazilABSTRACT -This study aimed to evaluate the genotype × environment interaction effect on birth (PN), weaning (P205) and yearling (P550) weights of Nellore cattle raised in 46 farms in three states (Rio Grande do Sul-RS, Santa Catarina-SC and Paraná-PR) of the South Region of Brazil, from 1976 to 2001. Records on 10,874 animals, sired by 425 bulls and 7,629 dams were used to estimate (co)variance components by REML. Univariate and bivariate models included the contemporaneous group, feeding type (P205 and P550), management type (P205 and P550), age of cow at calving (PN and P205) covariate (linear and quadratic components) as fixed effects and direct additive genetic (PN, P205 and P550), maternal (PN and P205) and residual as random effects. Direct heritability estimates of PN, P205 and P550 within each State ranged from 0.38 ± 0.04 to 0.56 ± 0.08; from 0.22 ± 0.03 to 0.47 ± 0.05 and from 0.35 ± 0,03 to 0.51 ± 0,05, respectively. Maternal heritability estimates for the States ranged from 0.19 ± 0.03 to 0.31 ± 0.03 (PN) and from 0.16 ± 0.08 to 0.48 ± 0.07 (P205). Genetic correlations for PN, ...
RESUMO Para avaliar a influência de alguns fatores de ambiente sobre escores de avaliação visual à desmama em animais da raça Charolês e estimar parâmetros genéticos, foram utilizadas informações coletadas pelo PROMEBO durante os anos de 1994 a 2002. As características estudadas foram os escores de conformação (C), precocidade (P), musculatura (M) e tamanho (T) à desmama
RESUMO -Com os objetivos de estimar parâmetros genéticos e avaliar a tendência genética e a fenotípica para as características peso ao nascer (PN), ganho médio diário do nascimento à desmama (GMDND), peso à desmama ajustado para 205 dias (P205) e para os escores visuais de conformação, precocidade, musculatura e tamanho, na fase pré-desmama, foram utilizados 23.176 registros de animais da raça Aberdeen Angus, nascidos entre 1994 e 2004. Os componentes de (co)variância foram estimados pelo REML, utilizando-se um modelo animal. As herdabilidades diretas variaram de 0,10 (musculatura) a 0,27 (PN) e as maternas, de 0,07 (GMDND) a 0,21(P205). As correlações genéticas entre GMDND e os escores visuais variaram de 0,55 a 0,66 e para os escores visuais entre si, de 0,50 a 0,92. As tendências genéticas para PN, GMDND, P205 foram 17,5; 1,1 e 220,9 (g/ano) e para os escores visuais as tendências genéticas foram próximas de zero; as fenotípicas foram 29,8; -3,3 e 467,9 (g/ano). As herdabilidades diretas estimadas sugerem ser possível obter ganho genético por meio da seleção, embora com pequeno ganho para os escores visuais. As correlações genéticas entre GMDND e os escores visuais indicam que a seleção para a primeira promove melhoria nos escores visuais e vice versa.As tendências genéticas indicam progresso genético, porém, as fenotípicas, negativas para algumas características, sugerem a necessidade de melhorias nas condições de ambiente para viabilizar a expressão do genótipo.Palavras-chave: avaliação genética, bovinos de corte, correlação genética, escores de avaliação visual, herdabilidade, progresso genético Genetic parameters and genetic and phenotypic trends for pre-weaning productive and conformation traits for an Aberdeen Angus breed populationABSTRACT -To estimate genetic parameters and to evaluate the genetic and phenotypic progress for the traits birth weight (PN), average daily gain from birth to weaning (GMDND), weaning weight adjusted to 205 days of age (P205) and the visual scores for conformation, precocity, musculature and size, at the pre weaning phase, there were The genetic trends for PN, GMDND, P205 were 17.5, 1.1, 220.9 (g/year) and for the visual scores were almost zero; the phenotypic were 29.8, -3.3, 467.9 (g/year). The estimated direct heritabilities suggest that it can be possible to get genetic gain by selection in this population, although for the visual scores the gain will be low. The genetic correlations between GMDND and visual scores show that selection for GMDND promotes improvement in visual scores and vice-versa. The genetic trends indicate genetic progress, however the phenotypic, negatives for some traits, suggest the necessity of to improve environmental conditions.
RESUMO -Objetivou-se avaliar os efeitos aditivos direto e materno e os efeitos não-aditivos e heterozigóticos sobre os desempenhos pré e pós-desmama e desenvolver equações para predizer o desempenho de genótipos de uma população multirracial Aberdeen Angus (Angus) × Nelore. Nas análises, foram utilizados dois modelos. O modelo 1 foi adotado para as características pré-desmama peso à desmama ajustado para 205 dias (P205) e ganho de peso médio diário do nascimento à desmama (GMDND), considerando fixos os efeitos de grupo de contemporâneos (GC) e de grupo genético (GG), além das co-variáveis idade do bezerro à desmama (IBD) e idade da vaca ao parto (IVP). Para as características pós-desmama peso ao sobreano ajustado para 550 dias de idade (P550) e ganho médio de peso da desmama ao sobreano (GMDDS), utilizou-se o mesmo modelo, apenas substituindo a co-variável IBD pela idade do bezerro ao sobreano (IBS). O modelo 2 (M2), de regressão múltipla, foi utilizado depois que os dados foram ajustados para GC, IVP e IBD (P205) ou IBS (P550) e contemplou os efeitos genéticos aditivos diretos e maternos de raça e os efeitos de heterozigoses direta e materna. Os resultados das análises comprovaram diferenças entre os cruzamentos, uma vez que os animais com elevada heterozigose materna apresentaram melhor desempenho para P205 e GMDND, tendência semelhante à observada para a heterozigose direta. A influência do efeito direto sobre as características P550 e GMDDS foi maior que a do efeito materno. Os efeitos aditivos diretos da raça Angus determinaram maior desempenho. Não houve diferença significativa entre os valores estimados pelo modelo 1 e os preditos pelo modelo 2 para P205, P550 e GMDDS.Palavras-chave: estimativa e predição de desempenhos, heterose, multicolinearidade, regressão múltipla Direct, maternal additive genetic and heterozygotic effects for pre-and post-weaning traits in a multi-breed Aberdeen Angus-Nelore population ABSTRACT -The objective of this study was to estimate direct and maternal additive genetic, non-additive and heterozygotic effects for pre and post-weaning traits and to develop equations to predict growth performance in a multi-breed Aberdeen Angus (Angus)-Nellore herd. The analyses were performed by SAS ® using two different models. The model 1 (M1) was used for the pre-weaning traits, weaning weight adjusted to 205 days of age (P205) and average daily gain from birth to weaning (GMDND), and included the fixed effects of contemporary groups (GC), genetic groups (GG) and the covariates age of calf at weaning (IBD) and age of cow at calving (IVP). The same model except for replacing the covariate IBD by age of calf at yearling (IBS) was used for the post-weaning traits -yearling weight adjusted to 550 days of age (P550) and average daily gain from weaning to yearling (GMDDS). A multiple regression model (M2) was used after adjusting the data for GC, IVP and IBD (P205) and IBS (P550) effects and included the breed direct and maternal additive and the direct and maternal heterozygotic effects. Animals w...
-Genetic parameters and genetic and phenotypic trends were estimated for weight at weaning (WW) and visual scores (VS) of conformation (C), precocity (P), musculature (M) and navel (N) for Angus × Nellore crossbred calves.It was used 39,676 records from pre-weaning phase of animals born from 1992 to 2002 in mid-western, southeastern and southern Brazil. The components of covariance were estimated using REML, in animal model, considering as random the maternal and direct additive genetic effects, and as fixed, the effects of contemporaneous group, the genetic group of the animal and of the cow, and as covariates the age of the calf at weaning and the age of the cow at calving, both on days and with linear and quadratic effects, besides direct (DH) and maternal heterosis (MH), both with only the linear effect. Estimates of direct and maternal heritability were 0.30 and 0.19, respectively, for WW, whereas VSs ranged from 0.16 to 0.20 and from 0.09 to 0.16, which indicates the possibility to obtain genetic gain through selection. It is expected answer correlated to C, P and for M when selection is practiced for weight at weaning is expected, as well as for P and M when selection is practiced for C.The direct and maternal genetic trends for WW (g/year) and for C, P, M and N (points/year) were: 221.0 and -312.0; 0.0022 and 0.00003; 0.0010 and 0.0001; 0.0013 and -0.0008; 0.0010 and 0.00009, respectively, while the phenotypic were: -685.2; -0.0102; -0.0219; -0.0256 and -0.0453, which highlights the need to adopt criteria for identifying young bulls of higher genetic value for WW and VSs.Key Words: beef cattle, cross-breeding, genetic evaluation, genetic progress, morphologic evaluationParâmetros genéticos e tendências genéticas e fenotípicas para peso a desmama e escores visuais nessa fase estimados para tourinhos mestiços Angus-Nelore RESUMO -Foram estimados parâmetros genéticos e tendências genéticas e fenotípicas para peso a desmama (PD) e para os escores visuais (EVs) de conformação (C), precocidade (P), musculatura (M) e umbigo (U), para bezerros produtos do cruzamento entre as raças Angus e Nelore. Foram utilizados 39.676 registros da fase pré-desmama, de animais nascidos entre os anos de 1992 e 2002, nas regiões Centro-oeste, Sudeste e Sul do Brasil. Os componentes de (co)variâncias foram estimados utilizando-se o REML, em modelo animal, considerando como aleatórios, os efeitos genéticos aditivos diretos e maternos e, como fixos, os efeitos de grupo de contemporâneos, grupo genético do animal e da vaca e, como covariáveis a idade do bezerro a desmama, a idade da vaca ao parto, ambas em dias e com efeitos linear e quadrático, além da heterose direta (HD) e a heterose materna (HM), ambas somente com efeito linear. As estimativas de herdabilidade diretas e maternas foram 0,30 e 0,19, respectivamente para PD, enquanto que para os EVs variaram de 0,16 a 0,20 e de 0,09 a 0,16, indicando ser possível obter ganho genético através da seleção. É esperada resposta correlacionada em C, P, e M quando a seleção for pr...
Scrotal hernias (SH) are common congenital defects in commercial pigs, characterized by the presence of abdominal contents in the scrotal sac, leading to considerable production and animal welfare losses. Since the etiology of SH remains obscure, we aimed to identify the biological and genetic mechanisms involved in its occurrence through the whole transcriptome analysis of SH affected and unaffected pigs’ inguinal rings. From the 22,452 genes annotated in the pig reference genome, 13,498 were expressed in the inguinal canal tissue. Of those, 703 genes were differentially expressed (DE, FDR < 0.05) between the two groups analyzed being, respectively, 209 genes upregulated and 494 downregulated in the SH-affected group. Thirty-seven significantly overrepresented GO terms related to SH were enriched, and the most relevant biological processes were muscular system, cell differentiation, sarcome reorganization, and myofibril assembly. The calcium signaling, hypertrophic cardiomyopathy, dilated cardiomyopathy, and cardiac muscle contraction were the major pathways possibly involved in the occurrence of the scrotal hernias. The expression profile of the DE genes was associated with the reduction of smooth muscle differentiation, followed by low calcium content in the cell, which could lead to a decreased apoptosis ratio and diminished muscle contraction of the inguinal canal region. We have demonstrated that genes involved with musculature are closely linked to the physiological imbalance predisposing to scrotal hernia. According to our study, the genes MYBPC1, BOK, SLC25A4, SLC8A3, DES, TPM2, MAP1CL3C, and FGF1 were considered strong candidates for future evaluation.
RESUMOCom o objetivo de testar modelos genéticos alternativos ao aditivo-dominante em populações multirraciais, foram utilizadas informações do peso ao sobreano (PS) de 35.931 novilhos, filhos de 752 touros e 30.535 vacas das raças Aberdeen Angus (A) e Nelore (N) e de diversos grupos genéticos possíveis por meio do cruzamento entre elas. Foram testados cinco diferentes modelos (M) genéticos: o M1 continha o efeito genético fixo aditivo direto (AD), heterozigótico direto (HD), epistático direto (ED) e aditivo-conjunto direto (ACD); o M2, igual ao M1, menos o efeito ACD; o M3, igual ao M1, menos o efeito ED; o M4, igual ao M1, menos os efeitos ED e ACD; e o M5, igual ao M1, menos os efeitos HD, ED e ACD. Os modelos foram submetidos a três métodos de análise diferentes: método dos quadrados mínimos (MQM), regressão de cumeeira (RC) e máxima verossimilhança restrita (REML). O método de RC produziu estimativas de coeficientes com magnitudes e sinais explicados biologicamente. As estimativas dos efeitos, das (co)variâncias, dos parâmetros e dos valores genéticos diferiram entre os modelos, indicando a importância da correta escolha do modelo de análise, devendo-se ter conhecimento prévio do fenômeno estudado e sua interpretação biológica e sempre preceder à escolha de um modelo de análise genética multirracial o estudo da relação existente entre as variáveis independentes. Importantes efeitos adicionais ao efeito AD foram acrescentados pelas inclusões dos efeitos HD e ED aos modelos de análise. A notação matemática dos efeitos ACD, aplicada atualmente na literatura e testada neste estudo, não foi capaz de explicar a complementaridade entre raças como esperado, havendo problemas com casos de multicolinearidade entre os efeitos estudados.Palavras-chave: complementaridade entre raças, efeito aditivo, epistasia, heterozigose, peso ao sobreano ABSTRACT In order to evaluate alternative genetic models to the additive dominant model, weights at yearling (PS
RESUMO -Para estudo da heterogeneidade de variâncias e estimação de coeficientes de herdabilidade e de correlação genética em diferentes níveis de produção de leite e de gordura, foi utilizado um conjunto de dados composto de 8.887 registros de produção de 5.875 vacas filhas de 1.125 touros, no período de 1984 a 2001. Os dados foram estratificados em três diferentes níveis de produção, de acordo com a média de produção de leite do rebanho, em: baixo (<6000 kg), médio (>6000 a <7500 kg) e alto (>7500 kg). Os componentes de (co)variância foram obtidos pelo Método da Máxima Verossimilhança Restrita, utilizando um modelo animal, incluindo, como efeitos aleatórios, os efeitos genéticos direto do animal e o de ambiente permanente e, como fixos, rebanho dentro do núcleo de controle leiteiro, ano/época do parto e ordem da lactação, além das covariáveis idade da vaca ao parto e duração da lactação. As médias observadas e respectivos desvios-padrão, para produção de leite (PL) e produção de gordura (PG) variaram de 4.922±743 kg a 8.760±126 kg e de 163±30 kg a 298±53 kg, respectivamente. As estimativas de herdabilidade variaram de 0,13 a 0,19 e de 0,16 a 0,21, respectivamente para PL e PG. Os níveis que apresentaram menores estimativas de herdabilidade para produção de leite e gordura foram o baixo e o médio, sugerindo que, nestes níveis, a resposta esperada pela seleção poderá ser menos eficiente. Os coeficientes de correlação genética entre PL e PG variaram de 0,91 a 1,00, indicando que a seleção realizada para uma das características promoverá resposta quase que equivalente na outra.Palavras-chave: heterogeneidade de variâncias, parâmetros genéticos, produção de gordura, produção de leite Heritability Coefficients and Genetic Correlations for Milk and Fat Yields at Different Production Levels for Holstein Breed in the State of Rio Grande do SulABSTRACT -Heritability and genetic correlations coefficients in different levels of milk production and fat were evaluated in this study. A data set of 8,887 milk and fat records from 5,875 Holstein cows, sired by 1,125 bulls from 1984 to 2001 were used. Data were stratified in three levels according to the herd milk production, low (<6000 kg), medium (>6000 a <7500 kg) and high (>7500 kg). The (co)variance components were estimated by Restricted Maximum Likelihood Method including in an animal model as random, the genetic direct and the permanent environmental effects and as fixed, the effects of herd: milking control nucleus, year season, lactation order, and the age of the cow at parturition and the period of lactation as co variables. The observed means and standard deviations for milk (PL) and fat (PG) yields ranged from 4,922±743 kg to 8,760±126 kg and from 163±30 kg to 298±53 kg, respectively. The estimated heritability coefficients ranged from .13 to .19 and from .16 to .21, respectively for PL and PG. The highest values for the heritability coefficients, for PL and PG were observed at the low and medium levels, suggesting that at these levels the improvement expected by s...
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