The transcription/DNA repair factor TFIIH is organized into a core that associates with the CDK-activating kinase (CAK) complex. Using chromatin immunoprecipitation, we have followed the composition of TFIIH over time after UV irradiation of repair-proficient or -deficient human cells. We show that TFIIH changes subunit composition in response to DNA damage. The CAK is released from the core during nucleotide excision repair (NER). Using reconstituted in vitro NER assay, we show that XPA catalyzes the detachment of the CAK from the core, together with the arrival of the other NER-specific factors. The release of the CAK from the core TFIIH promotes the incision/excision of the damaged oligonucleotide and thereby the repair of the DNA. Following repair, the CAK reappears with the core TFIIH on the chromatin, together with the resumption of transcription. Our findings demonstrate that the composition of TFIIH is dynamic to adapt its engagement in distinct cellular processes.
In this study, different approaches were used to assess and overcome the severe effects of interference from the sample matrix from different types of sludges and wastewater on the analysis of nine beta-blockers and the beta sympathomimetic clenbuterol. The partitioning of the target compounds into sludge was investigated in wastewater treatment plants (WWTPs) in both Canada and Germany to evaluate whether this is an important mechanism for removal from sewage. Due to ion suppression in the electro spray interface, absolute recoveries were for certain compounds even lower than 20%. By using surrogate standards, acceptable relative recoveries of >75% were achieved for WWTP influents and effluents and for sludges. These matrix effects underline the need to use appropriate surrogate standards to aid in analyte quantitation. Using the developed methods, beta-blockers were detected at concentrations up to 2 microg/L in WWTP effluents, with metoprolol, sotalol, and atenolol present as the dominant compounds. Removal rates within WWTPs were highly inconsistent and ranged from 1-69%. Propranolol showed the greatest degree of partitioning into sludge with solid/water partition coefficients of one order of magnitude higher than those for all other compounds. However, even for propranolol, sorption did not contribute significantly to the overall elimination in WWTPs. It is likely that the removal of beta-blockers during waste water treatment can be attributed primarily to microbial biodegradation.
Zusammenfassung Hintergrund und Ziel Zur Abschätzung des Schädigungspotenzials natürlicher, kontaminierter Sedimente im Rahmen der Europäischen Wasserrahmenrichtlinie stellen Sedimenttoxizitätstests ein wichtiges Instrument dar. Dabei muss es bei der Testinterpretation möglich sein, zwischen natürlichen Einflüssen und anthropogenen Beeinträch-tigungen zu unterscheiden. Der Gesamtgehalt an organischem Kohlenstoff (TOC) als Summe von partikulär gebundenem (POC) und gelöstem (DOC) organischen Kohlenstoff kann die Mobilität von Schadstoffen in Sedimenten beeinflussen. In verschiedenen Studien wurde nachgewiesen, dass neben dem Einfluss auf die Bioverfügbarkeit insbesondere der DOC-Gehalt direkte Effekte auf aquatische Organismen haben kann. Ziel dieser Studie war es, den Einfluss eines erhöhten Anteils organischer Substanz im Sediment auf die Endpunkte Reproduktion und Biomasse des Sedimenttoxizitätstests mit dem endobenthischen Oligochaeten Lumbriculus variegatus zu ermitteln. Zudem wurden die Anreicherungsfaktoren der hydrophoben Schadstoffe 1,1-dichloro-2,2-bis(p-chlorphenyl) ethen (p,p'-DDE), 2´, 3, 4, 4´, 5´-Hexachlorbiphenyl (PCB 138) und 2, 2´, 4, 4´, 5, 5´-Hexachlorbiphenyl (PCB 153) unter Berücksichtigung des TOC-Gehalts und der Expositionsroute (perkutan oder ingestiv) bestimmt.Material und Methoden Die Testdurchführung erfolgte in Anlehnung an die OECD-Richtlinie 225 (2007) unter Verwendung von artifiziellen Sedimenten mit variierenden Torfgehalten. In drei unterschiedlichen Testmodifikationen wurde der Einfluss eines erhöhten TOC-Gehalts ohne und mit Sedimentdotierung ermittelt. Die nominale Schadstoffkonzentration der dotierten Sedimente betrug 50 µg/kg.Ergebnisse Die Ergebnisse zeigten maximale Anreicherungsfaktoren von 13 für beide PCB und 11 für p,p'-DDE in Sedimenten mit geringen Torfanteilen. Mit zunehmendem Torfanteil verringerte sich die Höhe der Anreicherungsfaktoren. Dabei stellte die Sedimentingestion die Hauptexpositionsroute dar. Darüber hinaus konnten überwiegend signifikant negative Korrelationen zwischen dem Torfgehalt in undotierten Sedimenten und der Reproduktion sowie der Biomasse ermittelt werden. In Kombination mit den Modellsubstanzen korrelierten sowohl Reproduktion als auch Biomasse positiv mit steigendem Torfgehalt.Diskussion Aufgrund dieser Ergebnisse kann eine direkte Wirkung der organischen Substanz, insbesondere von Huminstoffen, auf den Testorganismus nicht ausgeschlossen werden. Da die anhand der Anreicherungsfaktoren ermittelte Bioverfügbarkeit der Schadstoffe mit steigendem TOC-Gehalt abnahm, kann angenommen werden, dass sich durch Konglomeration mit den Modellsubstanzen auch die Verfügbarkeit der Huminstoffe reduzierte.Schlussfolgerungen Bei einer Bewertung von Toxizitäts-tests und Bioakkumulationsstudien mit Lumbriculus variegatus sollte daher der mögliche Einfluss gelöster organischer Substanz auf den Testorganismus berücksichtigt werden.Empfehlungen und Perspektiven Um detailliertere Kenntnisse über die für den Testorganismus kritische DOC-Konzentration zu erhalten, si...
scite is a Brooklyn-based organization that helps researchers better discover and understand research articles through Smart Citations–citations that display the context of the citation and describe whether the article provides supporting or contrasting evidence. scite is used by students and researchers from around the world and is funded in part by the National Science Foundation and the National Institute on Drug Abuse of the National Institutes of Health.
hi@scite.ai
334 Leonard St
Brooklyn, NY 11211
Copyright © 2024 scite LLC. All rights reserved.
Made with 💙 for researchers
Part of the Research Solutions Family.