STRUCTURE remains the most applied software aimed at recovering the true, but unknown, population structure from microsatellite or other genetic markers. About 30% of STRUCTURE-based studies could not be reproduced (Molecular Ecology, 21, 2012, 4925). Here we use a large set of data from 2,323 horses from 93 domestic breeds plus the Przewalski horse, typed at 15 microsatellites, to evaluate how program settings impact the estimation of the optimal number of population clusters K opt that best describe the observed data. Domestic horses are suited as a test case as there is extensive background knowledge on the history of many breeds and extensive phylogenetic analyses. Different methods based on different genetic assumptions and statistical procedures (DAPC, FLOCK, PCoA, and STRUCTURE with different run scenarios) all revealed general, broad-scale breed relationships that S U PP O RTI N G I N FO R M ATI O N Additional supporting information may be found online in the Supporting Information section. How to cite this article: Funk SM, Guedaoura S, Juras R, et al. Major inconsistencies of inferred population genetic structure estimated in a large set of domestic horse breeds using microsatellites. Ecol Evol. 2020;10:4261-4279. https://doi.
Decision tools might help female noncarriers to be involved in their follow-up in accordance with their genetic status and their family history, while taking into account the benefits and disadvantages of cancer screening.
Pour comparer l’effet de traitements hormonaux à base de mélatonine à ceux à base de progestatifs et d’hormone chorionique gonadotrope équine (eCG) sur l’amélioration des performances reproductives de la race ovine Ouled- Djellal, 829 brebis réparties sur quatre exploitations (A, B, C et D ; respectivement n = 248, 351, 100 et 80) ont été suivies de mars à octobre 2008. Dans l’exploitation B, les progestagènes ont eu un effet améliorateur, avec une fertilité de 92,3 p. 100 pour le traitement avec les éponges vaginales à l’acétate de médroxyprogestérone (MAP) + eCG 400 UI, et de 84,1 p. 100 pour le traitement avec les éponges vaginales à l’acétate de fluorogestone (FGA) + eCG 500 UI, au lieu de 23,2 p. 100 chez les témoins. Les taux de fertilité obtenus dans les exploitations A et C avec les implants de mélatonine après la première saillie ont été significativement moins importants que ceux des lots traités avec les progestagènes et eCG (A : 40,9 vs 79,9 p. 100 ; C : 24 vs 70 p. 100). Le taux de fertilité obtenu avec les implants de mélatonine dans l’exploitation A après la première saillie a été plus élevé (40,9 p. 100) que celui obtenu dans les exploitations C (24 p. 100) et D (17,5 p. 100). Dans l’exploitation D les implants de mélatonine ont amélioré la fertilité totale par rapport au lot témoin (55,0 vs 17,5 p. 100). La prolificité à la première saillie a été améliorée par le traitement MAP + eCG 400 UI dans les exploitations A (1,30) et B (1,70), alors que les traitements FGA + eCG 500 UI et avec implant de mélatonine n’ont pas eu d’effet sur la prolificité. La mélatonine associée à l’effet bélier et utilisée précocement a donné de bons résultats, de l’ordre de ceux obtenus avec les progestagènes.
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