Parodontidae is a small group of fish and some species are particularly difficult to identify due to the lack of sufficiently consistent morphological traits. Cytogenetically, the species possess 2n = 54 chromosomes and are either sex-homomorphic or sex-heteromorphic (regarding its chromosomes). We evaluated data on color, tooth morphology, cytogenetics, and mitochondrial markers (COI) in Apareiodon specimens from the Aripuanã River (Amazon basin) and the results were compared to other congeneric taxa. Morphological results show an overlap of body color and tooth morphology to other known Apareiodon . The cytogenetics data showed that the 2n = 54 chromosomes, 50 m/sm + 4 st and, a ZZ/ZW sex chromosome system in Apareiodon sp. are common to other species of the genus. However, the number and chromosomal localization of the 45S ribosomal and p Ph 2004 satellite DNA sites, in addition to W chromosome localization of the p Ph 2004 appear to be exclusive cytogenetic features in Apareiodon sp. Our phylogenetic tree revealed well-supported clades and confirmed, by barcode species delimitation analysis, a new Molecular Operational Taxonomic Unit (MOTU) for Apareiodon sp. (Aripuanã River). As a whole, the above features support the occurrence of a new species of the Apareiodon , thus far unknown for the Parodontidae.
A família Parodontidae agrupa espécies sem sistemas de cromossomos sexuais heteromórficos e espécies com heterogametia feminina. Na diversificação dos sistemas de cromossomos sexuais ocorrem acúmulos de sequências de repetição in tandem e elementos transponíveis. Este estudo tem como objetivo integrar dados genômicos de elementos repetitivos comparando genomas macho e fêmea de Apareiodon sp. bem como seu mapeamento físico nos cariótipos. Nesta análise foram utilizados dois software: o RepeatExplorer que busca repetitivos, utilizando algoritmo de clusterização de sequências (reads) baseados em grafos, fazendo um comparativo de macho e fêmea e o RepeatMasker para anotação de elementos repetitivos em genomas montados de um macho e de uma fêmea de Apareiodon sp. Para a análise pelo RepeatExplorer uma amostra de 2.200.000 reads para cada sexo foi obtida, sendo que o resultado gerou 64 clusters dos quais 4 apresentaram diferenças significativas no número de reads de DNAs repetitivos agrupados entre macho e fêmea, sendo os clusters 09, 33, 45 e 60. As sequências destes 4 clusters foram submetidas ao CENSOR no web server http://www.girinst.org, para a busca de similaridade aos DNAs repetitivos neste banco de dados. Os DNA repetitivos com maior frequência no cluster 09 foram: DNA Transposon MuDR-7, DNA Satellite Sat-9 e DNA Transposon Kolobok-2. No cluster 33 foram o DNA transposon EnSpm/CACTA, retrotransposon Copia-4 e Penelope-1, e DNA transposon Harbinger. Já no Cluster 45 foram encontrados o não autônomo Rep-6 e o Retrotransposon Gypsy-19-I e no Cluster 60 o DNA transposon EnSpm-16/CACTA e Retrotransposon Gypsy-3. As sequências destes elementos repetitivos mais representativos nos genomas foram recuperadas para desenho de primers a partir do software primer3plus e, posterior construção de sondas para uso na hibridação in situ fluorescente (FISH). Os dados do RepeatMasker estão em análise para que juntamente com os dados do RepeatExplorer e da FISH seja obtida as diferenças quantitativas dos elementos repetitivos nos genomas macho e fêmea. Os resultados preliminares foram promissores para a caracterização dos elementos repetitivos no genoma de Apareiodon sp. Nesse contexto, com estes dados somados à localização cromossômica pretende-se compreender a diversificação cariotípica e dos cromossomos sexuais em Parodontidae.
O gênero Neoplecostomus compreende espécies de tamanho pequeno que habitam riachos da região sul e sudeste do Brasil. O gênero apresenta interesse em estudos citogenéticos e genéticos por apresentar cariótipos conservados e indícios de ausência de fluxo gênico entre populações de subafluentes do rio Paraná. Das dezesseis espécies válidas descritas até o momento para este gênero, oito foram descritas para a bacia do rio Paraná e há evidências da ocorrência de novas espécies para esta bacia. Sendo assim, este trabalho teve como objetivo estudar a diferenciação cariotípica no gênero Neoplecostomus nas bacias hidrográficas dos rios Iguaçu, Itararé, Cinzas e Tibagi com vistas ao entendimento da evolução cariotípica e descrição da biodiversidade. Para isso, foram realizas coletas em quatro localidades: rio Pinhão – bacia do rio Iguaçu (Neoplecostomus sp. 1), rio Samambaias – bacia do rio Itararé (Neoplecostomus cf. botucatu), rio das Pedras – bacia do rio das Cinzas (Neoplecostomus sp. 2) e no rio São João – bacia do rio Tibagi (Neoplecostomus yapo). Os dados citogenéticos revelaram um número diploide de 54 cromossomos, fórmula cariotípica 18m+20sm+16st e número fundamental 108 para as quatro espécies analisadas. O bandamento C detectou poucas regiões heterocromáticas. A hibridização in situ do gene ribossomal 18S demonstrou a localização do sítio ribossomal 45S em um único par cromossômico e, em dois sítios cromossômicos para o gene ribossomal 5S. Os estudos citogenéticos realizados demonstram que as espécies pertencentes ao gênero Neoplecostomus apresentam estruturas cariotípicas similares, com cariótipo constituído basicamente de regiões eucromáticas sugerindo uma aparente conservação cariotípica a qual também já foi observada em outras espécies deste gênero e em outras espécies de Neoplecostomini.Apoio: CNPq, CAPES, Fundação Araucária, SETI, FAPESP
scite is a Brooklyn-based organization that helps researchers better discover and understand research articles through Smart Citations–citations that display the context of the citation and describe whether the article provides supporting or contrasting evidence. scite is used by students and researchers from around the world and is funded in part by the National Science Foundation and the National Institute on Drug Abuse of the National Institutes of Health.
hi@scite.ai
334 Leonard St
Brooklyn, NY 11211
Copyright © 2024 scite LLC. All rights reserved.
Made with 💙 for researchers
Part of the Research Solutions Family.