Defensins are components of the vertebrate innate immune system; they comprise a diverse group of small cationic antimicrobial peptides. Among them, β-defensins have a characteristic β-sheet-rich fold plus six conserved cysteines with particular spacing and intramolecular bonds. They have been fully studied in mammals, but there is little information about them in snakes. Using a PCR approach, we described 13 β-defensin-like sequences in Bothrops and Lachesis snakes. The genes are organized in three exons and two introns, with exception of B.atrox_defensinB_01 which has only two exons. They show high similarities in exon 1, intron 1 and intron 2, but exons 2 and 3 have undergone accelerated evolution. The theoretical translated sequences encode a pre-β-defensin-like molecule with a conserved signal peptide and a mature peptide. The signal peptides are leucine-rich and the mature β-defensin-like molecules have a size around 4.5 kDa, a net charge from +2 to +11, and the conserved cysteine motif. Phylogenetic analysis was done using maximum parsimony, maximum likelihood and Bayesian analyses, and all resulted in similar topologies with slight differences. The genus Bothrops displayed two separate lineages. The reconciliation of gene trees and species tree indicated eight to nine duplications and 23 to 29 extinctions depending on the gene tree used. Our results together with previously published data indicate that the ancestral β-defensin-like gene may have three exons in vertebrates and that their evolution occurred according to a birth-and-death model.
β-defensins are antimicrobial peptides presenting in vertebrate animals. They participate in innate immunity, but little is known about them in reptiles, including snakes. Although several β-defensin genes were described in Brazilian snakes, their function is still unknown. The peptide sequence from these genes was deduced, and synthetic peptides (with approximately 40 amino acids and derived peptides) were tested against pathogenic bacteria and fungi using microbroth dilution assays. The linear peptides, derived from β-defensins, were designed applying the bioisosterism strategy. The linear β-defensins were more active against Escherichia coli, Micrococcus luteus, Citrobacter freundii, and Staphylococcus aureus. The derived peptides (7–14 mer) showed antibacterial activity against those bacteria and on Klebsiella pneumoniae. Nonetheless, they did not present activity against Candida albicans, Cryptococcus neoformans, Trychophyton rubrum, and Aspergillus fumigatus showing that the cysteine substitution to serine is deleterious to antifungal properties. Tryptophan residue showed to be necessary to improve antibacterial activity. Even though the studied snake β-defensins do not have high antimicrobial activity, they proved to be attractive as template molecules for the development of antibiotics.
À minha família, minha base de tudo, meu lar, minha companhia, meu apoio, meu porto seguro. Aos meus pais por tamanha dedicação em nossa criação e educação que me ajudaram na luta em não desistir de chegar até aqui. Aos meus irmãos Rafael e Leonardo pela cia e carinho. Á Deus, pela minha vida, a cada nova manhã, pela minha coragem, e minha fé diária. Gratidão.Vou ter de agradecer à minha coorientadora primeiro, Dra Selma Maria de Almeida-Santos, que antes de tudo é uma grande amiga, e grande diretora, que me possibilitou fazer parte do seu grupo de pesquisa de Reprodução de Squamata desde 2015, assim como desenvolver este projeto durante a jornada de trabalho no Laboratório de Ecologia e Evolução do Instituto Butantan. Agradeço por todos os momentos bons, divertidos e até os momentos não tão bons, mas com certeza que somaram no meu aprendizado como ser humano e cientista. Por fim à gradeço por ter me apresentado ao meu orientador.Agradeço à Deus por ter colocado no meu caminho um ser humano tão iluminado.Hiperativo, centrado, humilde, divertido, exigente mas nunca bravo. De um raciocínio ligeiro e uma genialidade incomparável. Uma pessoa muito humana, um ser de um coração imenso. Um orientador que sabe ensinar muito falando pouco. Mas o pouco é tão raro que vale a pena gravar todas informações passadas durante as curtas reuniões. Quem me ensinou que doutorando é quem faz pesquisa e se vira correndo atrás de parcerias, colaborações, revistas para publicações sem ninguém para pegar na mão. E apesar dele não saber quase nada de serpentes me mostrou o universo da biologia molecular que pôde somar muito em meu aprendizado. Professor Durvanei Augusto Maria, espero passar muito do que me foi passado de conhecimento, e que eu tenho muitos orientandos pela frente. Gratidão.Depois destes só poderia agradecer aquele que mais me orientou, mais me apoiou, pegou no pé, cobrou, deu bronca, incentivou, papeou, apoiou nas publicações, nas participações de congressos, nos momentos de desânimo e fraqueza, em especial me incentivou a escrever de uma vez por todas a temida tese. E há 17 anos eu assistia à uma aula dele na faculdade em Mogi das Cruzes, e de tanto medo das cobras vim parar no Instituto Butantan, por teimosia e vontade de encarar as temidas serpentes. Meu grande amigo de todas as horas, o biólogo, pesquisador, diretor, conselheiro e professor, Giuseppe Puorto, minha gratidão. À toda a equipe do LEEV, funcionários, alunos, terceirizados, que fazem o nosso dia a dia ser menos pesado, nos apoiam, colaboram, e também incentivam a não desistir do sonho de fazer pesquisa. À Kelly,
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