There was a significant difference in house dust microbiota among different urbanization areas. The areas with a lower urbanization level presented higher dust-borne bacterial richness and diversity. Thus, modern urbanization has influence on the bacterial microbiome profiles of indoor dust.
Introducción La detección de anofelinos infectados por Plasmodium spp. se ha realizado tradicionalmente por medio de microscopia óptica e inmunoensayos. Actualmente, las metodologías basadas en la técnica de Reacción en Cadena de la Polimerasa (PCR), proveen una alta sensibilidad y especificidad; sin embargo, algunos autores han reportado que inhibidores, presentes en el cuerpo del mosquito, pueden disminuir la sensibilidad de la PCR para la detección de Plasmodium spp., y tal efecto podría reducirse con la utilización de protocolos de extracción de ADN que remuevan de forma eficiente los inhibidores potenciales. ObJetivo Comparar dos protocolos de extracción de ADN para la detección de infección por Plasmodium spp. en Anopheles spp. Materiales y métodos Se seleccionaron diez mosquitos Anopheles stephensi infectados con Plasmodium falciparum, previamente disectados, para separar cabeza-tórax de abdomen, que fueron evaluados por dos protocolos de extracción: uno con resina quelante y otro sin resina; se realizaron diluciones del producto de extracción y se amplificó el DNA por PCR anidada. Se compararon las diferencias entre las frecuencias de amplificación mediante la prueba t-Student y las hipótesis fueron probadas aplicando la prueba de diferencia entre las proporciones de dos poblaciones. Resultados En especímenes cuyo ADN fue extraído usando el protocolo sin resina quelante la amplificación de ADN del parásito fue de 11,6%, y con el protocolo con resina fue 6,6%. Del total de las amplificaciones, un 20% correspondieron a material de extracción sin dilución y un 7,5% a material de extracción diluido 1:10; la diferencia entre las proporciones de amplificación fue estadísticamente significativa (p<0,05). Conclusiones El protocolo que con mayor eficiencia permitió detectar ADN del parásito en ADN extraído de mosquitos fue aquel al que no se añadió resina quelante; con este, la amplificación fue aproximadamente dos veces mayor que con el protocolo con resina.
Background:The extended-spectrum -lactamases (ESBL) Ambler's class A are capable of hydrolyze broad spectrum penicillin and cephalosporins, and mostly are codified by plasmidial genes. Health-care associated infections (HAI) are a group of entities with a high frequency worldwide, specially in critical adult patients and children in Intensive Care Units (ICU). The frequency of ESBL in this kind of patients is unknown nowadays in ICU in Cartagena de Indias D.T., Bolívar Colombia.Methods & Materials: The goal of this project was to describe the epidemiology of ESBLS type TEM and SHV in the city of Cartagena de Indias D.T state of Bolívar in Colombia. Clinical samples (blood, urine, LRT secretion, surgical site secretion) were collected from adult patients under HAIs diagnosis (Ventilator Associated Pneumonia, Bloodstream Infection, Urinary Tract Infection, Surgical Site Infection). Phenotypic identification, susceptibility test and antibiotic profile was performed with an automatized method according the current CLSI standards, following of genotypic identification with molecular biology methods as PCR and sequencing to confirm the presence of TEM and SHV genes in susceptible and resistant bacteria.Results: The presence of ESBLS type TEM and SHV was frequent in the samples collected, finding that the presence of TEM/SHV at the same time was found in 43.3% of the samples and TEM ESBL was the most frequent, these findings were observed in susceptible and resistant bacteria. K pneumoniae was the most frequent bacteria (33.3%) follow by P. aeruginosa (28,9%) with TEM and SHV genes in susceptible and resistant samples at the same time. Conclusion:The presence of ESBL type TEM and SHV in susceptible and resistant bacteria in Health-care associated infections (HAI) in Intensive Care Units (ICU) patients has an importance in antibiotic therapy and prognosis of this kind of patients worldwide. Silenced genes in susceptible strains has been described in this kind of isolates, in Cartagena, Colombia this kind of findings are new, and could be part of the reason of the negative outcome on these patients.
Introducción: el éxito de Anopheles nuneztovari Gabaldón, 1940 como vector de malaria se relaciona en parte con su adaptación a diferentes condiciones ambientales. En este contexto, la variabilidad de estructuras como las alas, esenciales para el vuelo, podrían variar en respuesta a cambios climáticos en periodos cortos de tiempo. Métodos: se comparó la forma alar (tamaño y conformación) de una población de mosquitos hembras An. nuneztovari de Tierralta, Córdoba, en las temporadas climáticas, seca y lluviosa. Se digitalizaron 21 puntos de referencia en el ala izquierda, y se analizó la forma alar mediante morfometría geométrica. Resultados: se encontraron diferencias significativas en el promedio del tamaño alar entre las temporadas climáticas ( p = 0,007), pero no en su varianza ( p = 0,85); los mosquitos de temporada lluviosa presentaron tamaños alares más pequeños. Con respecto a la conformación alar, entre ambas temporadas, se encontraron diferencias estadísticamente significativas en sus promedios ( p < 0,0001), y la asignación correcta de los especímenes por temporada climática fue de 65% para la temporada seca y del 70% para la lluviosa. Conclusiones: los resultados sugieren un posible efecto de los periodos de sequía y lluvia sobre la conformación alar de An. nuneztovari. Se recomienda una evaluación más amplia, incluyendo un mayor número de poblaciones para ambas temporadas climáticas.
Staphylococcus aureus es responsable de un amplio espectro de cuadros clínicos que van desde infecciones en la piel y los tejidos blandos hasta enfermedades sistémicas muy graves que amenazan la vida; tiene gran importancia en la comunidad y está comúnmente implicado en infecciones nosocomiales. Además, un alto porcentaje de individuos está colonizado por S. aureus, lo cual constituye un factor de riesgo para su diseminación. S. aureus tiene gran capacidad de adquirir resistencia a los antimicrobianos y en la actualidad se encuentran cepas resistentes a la mayoría de los antibióticos disponibles; en particular, su resistencia a la meticilina, inicialmente en el ambiente hospitalario (HA-MRSA) y posteriormente en la comunidad (CA-MRSA), ha dificultado aún más el control mundial de este microorganismo. Los estudios de epidemiología molecular han permitido entender mejor las relaciones evolutivas de las cepas y definir el origen de los clones durante brotes epidémicos. En Colombia se sabe poco sobre la epidemiología de S. aureus y aún menos sobre su comportamiento en la comunidad. Por ello, estudios de vigilancia epidemiológica que involucren la tipificación molecular de las cepas permitirán comprender mejor su epidemiología y establecer estrategias más certeras de tratamiento y control.
Objective. To assess the presence of RNA from dengue virus by Real Time Polymerase Chain Reaction with Reverse Transcriptase (qRT-PCR), in anti-dengue IgM seronegative serum samples obtained from symptomatic patients with less than 5 days of fever, in the department of Bolivar, Colombia. Materials and Methods.Cross sectional descriptive study, where 50 anti-dengue IgM seronegative serum samples were analyzed by qRT-PCR. In addition, we reviewed the epidemiological charts of each patient in order to collect sociodemographic and blood count (CBC) data.Results. DENV-3 RNA was detected in seven (14 %) serum samples. The most common clinical manifestations were: fever (90 %; 45/50), headache (88 %; 44/50) and myalgia (74 %; 37/50). Regarding the CBC, the most significant findings were: thrombocytopenia (60 %; 30/50; 73.3% were men), and leukopenia (50 %; 25/50; 60% were men). Conclusion.Detection and typing of DENV genome by qRT-PCR could be considered a diagnostic tool for Dengue in anti-dengue IgM seronegative serum samples, especially, within four days after the onset of the signs of the disease.
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