RESUMO -As relações genéticas de 105 acessos de diferentes origens geográficas do banco de germoplasma de mangueira da Embrapa foram determinadas com base no marcador AFLP, de forma a orientar trabalhos de melhoramento e manejo de recursos genéticos da espécie para a região Semi-Árida brasileira. Foram ainda incluídos dois acessos de duas espécies do gênero Mangifera, como "outgroup". O DNA dos acessos foi extraído pelo método do CTAB, as reações de AFLP foram realizadas para os iniciadores EcoRI/MseI e as bandas polimórficas foram analisadas para construção de fenograma, baseando-se no coeficiente de similaridade de Jaccard. Foram obtidas 157 e 54 bandas de AFLP polimórficas e monomórficas, respectivamente, em 13 combinações de iniciadores. O valor co-fenético do fenograma foi estimado em 0,81. Foram observados cinco grupos: 1) cultivares como Amrapali, Malika, híbridos Embrapa-Cpac e algumas variedades americanas formando um grupo; 2) grupo formado, predominantemente, por cultivares americanas, com algumas inclusões de híbridos sul-africanos e brasileiros; 3) grande grupo formado por cultivares brasileiras, com algumas inclusões de cultivares australianas, indianas e americanas; 4) grupo formado por algumas variedades tipo Espada, Rosa e acessos de diferentes origens; e 5) grupo formado por M. foetida e M. similis. Os acessos Carabao e Manilla apresentaram a maior similaridade, 97%. Os acessos estudados apresentaram similaridade superior a 51%, evidenciando a alta variabilidade genética da coleção de germoplasma de mangueira estudada. Termos para indexação: Mangifera indica, divergência, germoplasma de manga. GENETIC SIMILARITY OF MANGO ACCESSIONS OF DIFFERENT GEOGRAPHIC ORIGINS EVALUATED WITH AFLP MARKERSABSTRACT -The genetic relationship among 105 mango accessions of different geographic origins of the Embrapa germplasm collection was estimated based on AFLP marker in order to orient breeding and management of genetic resource activities of this species to the Brazilian Semi-Arid region. Two additional accessions of other species of the Mangifera genus were also included as outgroup. The DNA of the accessions was extracted according to the CTAB protocol, the AFLP reactions were performed to EcoRI/ MseI primers and the polymorphic bands analyzed to built a phenogram based on the Jaccard similarity coefficient. A hundred and fifty-seven and fifty-four polymorphic and monomorphic bands, respectively, were obtained from 13 AFLP primer combinations. The phenogram cophenetic value was estimated in 0.81. Five groups were observed: 1) Amrapali, Malika, Embrapa-CPAC hybrids and some American varieties forming a group, 2) other built, predominantly, by American varieties, with some inclusions of South African and Brazilian hybrids, 3) a large group composed by Brazilian accessions, with some inclusion of Australian, Indian and American accessions, 4) a group with some accessions of Espada, Rosa and others of different origins, and 5) a group formed by M. foetida and M. similis. Carabao and Manilla presented the larges...
Resumo -O objetivo deste trabalho foi avaliar a distribuição da variabilidade genética do umbuzeiro (Spondias tuberosa), no Semi-Árido brasileiro, por meio de marcadores AFLP, para subsidiar estratégias de prospecção e conservação da espécie. Foram analisados 68 indivíduos de umbuzeiro de 15 ecorregiões, pelo dendrograma UPGMA e pela dispersão em escala multidimensional (MDS), com o coefi ciente de Jaccard de 141 bandas polimórfi cas de AFLP. A análise da variância molecular foi realizada pela decomposição total entre e dentro das regiões ecogeográfi cas. O dendrograma apresentou valor cofenético de 0,96, e o gráfi co MDS apresentou 0,25 para a falta de ajustamento. A variabilidade genética do umbuzeiro foi estimada em 0,3138, o que indica grande variação entre os grupos de indivíduos. Agrupamentos específi cos foram observados em seis regiões ecogeográfi cas, enquanto nas demais regiões observaram-se pares entre alguns indivíduos, sem formação de agrupamentos específi cos por local de amostragem, o que indica que a variabilidade genética do umbuzeiro não está uniformemente distribuída no Semi-Árido. Sugerem-se estratégias para o estabelecimento de maior número de áreas para conservação in situ ou amostragens de menor número de indivíduos, em várias unidades de paisagens, para conservação ex situ da variabilidade genética do umbuzeiro.Termos para indexação: Spondias tuberosa, análise multivariada, análise de variância molecular, dendrograma, escala multidimensional. Genetic variability of umbu trees in Brazilian Semi-Arid region, based on AFLP markersAbstract -The objective of this work was to evaluate the genetic variability distribution of umbu tree (Spondias tuberosa), within Brazilian Semi-Arid region, based on AFLP markers, in order to suggest prospecting and preservation strategies for this species. Sixty-eight umbu trees of 15 ecogeographic regions were analyzed for 141 polymorphic AFLP bands, through the UPGMA dendrogram and the multidimensional scaling (MDS), based on Jaccard's coeffi cient . Analysis of molecular variance was accomplished by total decomposition among and within ecogeographic regions. The dendrogram presented co-phenetic value of 0.96, while the MDS presented 0.25 for the badness-of-fi t. Umbu genetic variability was estimated in 0.3138, indicating a large variance among individual groups. Specifi c clusters were observed in six ecogeographic regions, and some individual pairs were observed in the other regions, with no specifi c clustering by sampling place, which indicates that the genetic variability of umbu tree is not uniformly distributed within Brazilian Semi-Arid. Strategies are suggested to set a larger number of protection areas for in situ conservation, or a smaller number of umbu individuals sampled, in various ecoregion units, for ex situ genetic variability conservation of this species.
Resumo -O objetivo deste trabalho foi estabelecer padrões alélicos e estimar as distâncias genéticas baseadas em marcador SSR de 44 cultivares de cebola adaptadas às condições de cultivo tropicais e subtropicais do Brasil. Para visualização da similaridade genética, utilizou-se o dendrograma UPGMA gerado da matriz de distâncias do coefi ciente de Jaccard, com base em 40 alelos de 13 locos SSR. O DNA total foi extraído pelo método CTAB 2x, e os produtos de PCR foram analisados em géis de poliacrilamida desnaturante 6% e corados com nitrato de prata. O número de pares de bases foi estimado pelo método da mobilidade inversa, com base em regressão de produtos de tamanho conhecido. A média da heterozigosidade dos locos SSR foi 0,58. Os 40 alelos dos 13 locos SSR foram sufi cientes para distinguir as 44 cultivares de cebola. O maior número de alelos em comum foi observado entre as cultivares Yellow Granex e Henry's Special PRR e o menor, entre as cultivares Baia Periforme Super Precoce e Excel. Os sete grupos principais de cultivares identifi cados no dendrograma apresentaram concordância com a genealogia conhecida e o tipo agronômico das cultivares avaliadas. Os locos SSR selecionados são adequados para melhoramento e proteção de cultivares da espécie.Termos para indexação: Allium cepa, dendrograma, similaridade, SSR. Molecular characterization of onion cultivars using microsatellite markersAbstract -The objective of this work was to establish allelic patterns and to estimate genetic distances based on the SSR marker in 44 onion cultivars adapted to Brazil's tropical and subtropical growing conditions. An UPGMA dendrogram generated from the distance matrix of the Jaccard's coeffi cient, based on 40 alleles of 13 SSR loci, was used for visualizing genetic similarities. Total DNA was extracted according to the CTAB 2x protocol, and the PCR products were analyzed in 6% denaturing polyacrylamide gels and stained with silver nitrate. The number of base pairs was estimated by the inverse mobility method, based on regression of products of known size. The heterozygosity mean was 0.58 for all SSR loci. The 40 alleles of the 13 SSR loci were enough to distinguish all 44 onion cultivars. The highest number of common alleles was observed between Yellow Granex and Henry's Special PRR cultivars, and the lowest was observed between the Baia Periforme Super Precoce and Excel cultivars. The seven main groups of onion cultivars identifi ed in the dendrogram were in agreement with the known genetic genealogy and with the agronomic type of the analyzed cultivars. The selected SSR loci are adequate for breeding programs and for protection of the cultivars of the species.
The traditional onion (Allium cepa) hybrid production requires the development of maintainer and male sterile lines and also a pollinator line with good specific combination ability. We report the identification of maintainer and male-sterile onion lines within the Brazilian 'Baia Periforme' derived population, 'Alfa São Francisco', associating random field pairing of male-fertile plants with selected male-sterile plants and PCR-based marker system monitoring S, T and N-cytoplasms. Male-sterile plants produced flowers with light green anthers which were easily detected in the field. A frequency of 2.0% of male-sterile plants was estimated in the 'Alfa São Francisco' sampled population. Male-sterile plants produced the 5´cob-marker 180-bp and the orfA501-marker 473-bp fragments, suggesting the T-cytoplasm type, while the maintainer line produced only the 5´cob-marker 180-bp. These identified lines will be important to develop tropical onion hybrids welladapted to Brazilian low latitudes and to future comparative studies with other onion cytoplasmic genic male sterility systems. Key words: Allium cepa, CMS, 'Alfa São Francisco', tropical hybrid Seleção assistida por marcadores de linha mantenedora dentro de uma população de cebola tropical RESUMO: A produção tradicional de híbrido de cebola (Allium cepa) requer o desenvolvimento de linhas mantenedoras e linhas macho estéreis, bem como uma linha polinizadora de boa capacidade específica de combinação. Reporta-se a identificação de linhas de cebola mantenedora e macho-estéreis numa população 'Alfa São Francisco' derivada da brasileira 'Baia Periforme', associando pareamento ao acaso no campo de plantas férteis com plantas macho-estéreis e sistema de PCR para monitoramento dos citoplasmas S, T e N. Plantas macho-estéreis produziram flores com anteras verde-claras, que foram facilmente identificadas no campo. A freqüência de 2,0% de plantas macho-estéreis foi estimada dentro de uma amostra da população 'Alfa São Francisco'. Plantas macho-estéreis produziram o marcador 5´cob de 180-pb e o marcador orfA501 de 473-pb, sugerindo que o citoplasma é do tipo T, enquanto a linha mantenedora da macho-esterilidade produziu apenas o marcador 5´cob de 180-pb. Essas linhas identificadas serão importantes para o desenvolvimento de híbridos de cebola tropical, bem adaptados às áreas de baixa latitude do Brasil e para estudos comparativos no futuro com outros sistemas da macho-esterilidade citoplasmática gênica de cebola.
-The genetic relationships between accessions of Jatropha
The objective of this work was to characterize 119 accessions of guava and 40 accessions of "araçá" sampled in 35 Brazilian ecoregions, according to the International Union for the Protection of New Varieties of Plants (UPOV) descriptors. The majority of "araçá" accessions presented wide spacing of leaf veins, while guava accessions presented medium to close spacing. Most fruits of "araçá" accessions were classified as small, contrasting with medium to large fruits of guava accessions. Most of "araçá" accessions (91%) presented white flesh fruit color, while 58% of guava accessions presented pale pink, pink and dark pink colors. Fruit differences among wild and cultivated Psidium species indicate fruit as the most altered trait under artificial selection.
A cebola, Allium cepa L. (2n=16), é originária das regiões de clima temperado que compreendem o Afeganistão, o Irã e partes do sul da antiga União Soviética. Tem sido cultivada por mais de 5.000 anos e, provavelmente, não existe mais em estado silvestre. As espécies mais próximas são A. galanthum e A. vavilovii, as quais podem ser encontradas em estado silvestres em áreas da antiga União Soviética e no Afeganistão (Goldman et al., 2000). Os europeus trouxeram a cebola para as Américas RESUMOFoi estimada a similaridade genética entre cultivares de cebola de diferentes tipos e regiões geográficas, de forma a orientar programas de recursos genéticos e melhoramento da espécie no Nordeste brasileiro. Foram analisadas 41 cultivares, adotando-se para a visualização da similaridade genética o fenograma UPGMA gerado da matriz de distâncias genéticas estimadas pelo coeficiente de Jaccard e baseadas em 146 bandas polimórficas de Pst1 e Mse1 de AFLP. A correlação cofenética foi de 0,91, indicando boa confiabilidade da representação gráfica para a interpretação dos resultados. Foram observados dois grupos principais no fenograma, no ponto de corte de 0,55 de similaridade: 1) grupo formado por cultivares predominantemente brasileiras, com algumas inclusões de cultivares estrangeiras; e 2) grupo formado por três cultivares estrangeiras (Mercedes, Perfect e TEG 502 PRR). Rijnsburger Jumbo e IPA 8 apresentaram a maior similaridade (85%), enquanto Madrugada foi a mais divergente em relação às demais cultivares. As cultivares da série IPA se dividiram em subgrupos no grupo das cultivares brasileiras (IPA 8, IPA 10 e IPA 11; IPA 12, IPA 7, IPA 2 e IPA 6; IPA 3, IPA 4 e IPA 9), indicando haver variabilidade genética a ser explorada entre aquelas situadas em subgrupos distintos. Bola Precoce e BRS Cascata apresentaram a maior similaridade entre as cultivares de origem brasileira. Foi observada similaridade superior a 39%, refletindo a alta variabilidade genética da coleção de cebola estudada. A introdução de novos acessos deve considerar procedências outras que não norte americanas, para aumentar a variabilidade de germoplasma de cebola disponível no Nordeste do Brasil. Palavras-chave:Allium cepa, cultivares, dissimilaridade, índice de Jaccard, UPGMA. ABSTRACT Genetic similarity among onion cultivars of different types and origins, based on AFLP markersThe genetic similarity among onion cultivars of different origins was evaluated, in order to carry out genetic resources and breeding programs for this species on the Brazilian Northeast. Forty-one onion cultivars were analyzed for 146 polymorphic Pst1/Mse1 AFLP bands, according to UPGMA phenogram, built with the Jaccard's similarity coefficient matrix. The phenogram co-phenetic value was estimated in 0.91 showing a good adequacy of the data. In the phenogram were observed two main onion groups at the cut point of 0.55 of similarity: 1) group composed of predominantly Brazilian cultivars, with some inclusion of foreigners; and 2) group with three foreign cultivars (Mercedes, Perfect a...
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