The study was designed to evaluate putative mechanisms by which lipid-associated loci identified by genome-wide association studies (GWAS) are involved in the molecular pathogenesis of coronary artery disease (CAD) using a comprehensive statistical and bioinformatics analysis. A total of 1700 unrelated individuals of Slavic origin from the Central Russia, including 991 CAD patients and 709 healthy controls were examined. Sixteen lipid-associated GWAS loci were selected from European studies and genotyped using the MassArray-4 system. The polymorphisms were associated with plasma lipids such as total cholesterol (rs12328675, rs4846914, rs55730499, and rs838880), LDL-cholesterol (rs3764261, rs55730499, rs1689800, and rs838880), HDL-cholesterol (rs3764261) as well as carotid intima-media thickness/CIMT (rs12328675, rs11220463, and rs1689800). Polymorphisms such as rs4420638 of APOC1 (p = 0.009), rs55730499 of LPA (p = 0.0007), rs3136441 of F2 (p < 0.0001), and rs6065906 of PLTP (p = 0.002) showed significant associations with the risk of CAD, regardless of sex, age, and body mass index. A majority of the observed associations were successfully replicated in large independent cohorts. Bioinformatics analysis allowed establishing (1) phenotype-specific and shared epistatic gene–gene and gene–smoking interactions contributing to all studied cardiovascular phenotypes; (2) lipid-associated GWAS loci might be allele-specific binding sites for transcription factors from gene regulatory networks controlling multifaceted molecular mechanisms of atherosclerosis.

Background. Imbalance in the system of redox homeostasis is an important link in the pathogenesis of type 2 diabetes (T2D). Gamma-glutamyl cyclotransferase is an antioxidant defense enzyme directly involved in the metabolism of glutathione, an endogenous antioxidant. The aim of the study was to examine the association of single nucleotide polymorphisms (SNP) rs38420 (GA), rs4270 (TC), rs6462210 (CT) and rs28679 (GA) in GGCT gene with the risk of developing T2D. Materials and Methods. The study included 1022 T2D patients and 1064 healthy volunteers. Genotyping of GGCT gene loci was performed using iPLEX technology on a MassArray Analyzer 4 genome time-of-flight mass spectrometer (Agena Bioscience). Results. As a result, we identified for the first time the association of SNP rs4270 in the GGCT gene with the risk of T2D in the Russian population. We have also established genetic and environmental interactions associated with predisposition to the disease: protective effect of gamma-glutamyl cyclotransferase gene was observed only in non-smokers under condition of daily consumption of fresh vegetables and fruits, whereas in persons with insufficient consumption of plant foods, as well as in all smoking patients protective effect of GGCT was not observed. In patients with T2D, the level of hydrogen peroxide and glutathione monomer was sharply increased compared to the controls. SNP rs4270 was also found to be associated with elevated levels of reduced glutathione in the plasma of type 2 diabetics. Conclusion. Thus, for the first time it was established that polymorphic locus rs4270 in the GGCT gene is associated with a predisposition to T2D, but its relationship with the disease is modulated by smoking and fresh plant foods consumption.

Анализируется литература последних лет, посвященная изучению генов, ответственных за регуляцию липидного обмена и развитие коронарного атеросклероза. Ключевые слова: GWAS, полногеномное ассоциативное исследование, липидный обмен, ИБС This review deals with the analysis of foreign and domestic literature of recent years on the search for genes involved in the regulation of lipid metabolism and responsible for the development of coronary atherosclerosis.

No abstract

государственный медицинский университет" Минздрава России. Курск; 2 БМУ "Курская областная клиническая больница". Курск, Россия Цель. Провести анализ ассоциаций полиморфных вариантов rs7412 и rs4420638 гена аполипопротеина Е (APOE) с риском развития ишемической болезни сердца (ИБС) и эффективностью гиполипидемической терапии розувастатином. Материал и методы. Образцы дезоксирибонуклеиновой кислоты и фенотипические данные 1700 неродственных индивидов славянского происхождения, уроженцев Центральной России. Фармакогенетическое исследование включало 205 пациентов, страдающих ИБС. Пациентам назначали розувастатин с определением уровней липидов и толщины комплекса интима-медиа (ТИМ) по прошествии 6 и 12 мес. наблюдения. Результаты. Носители минорного аллеля T полиморфного варианта rs7412 гена APOE характеризовались более низким риском развитием ИБС и более высоким стартовым уровнем холестерина (ХС) липопротеинов низкой плотности (ЛНП). Ассоциации этого полиморфного варианта зависели от индекса массы тела. Ассоциация с повышенным риском развития ИБС была характерна для мужчин, носителей вариантного аллеля G полиморфного варианта rs4420638 гена APOE. При лечении розувастатином пациентов с ИБС, более выраженное гиполипидемическое действие в отношении общего ХС и ХС ЛНП было характерно для лиц, гомозиготных по минорному аллелю T полиморфного варианта rs7412 гена APOE по итогам 1 мес. терапии; ослабление гиполипидемического действия в отношении общего ХС имело место у носителей гетерозиготного генотипа A/G полиморфного варианта rs4420638 гена APOE по итогам 12 мес. терапии. Обнаружена связь полиморфного варианта rs7412 гена APOE с динамикой максимальной ТИМ у пациентов с ИБС при лечении розувастатином в виде отсутствия регресса ТИМ у носителей вариантного аллеля T по итогам 6 мес. гиполипидемической терапии. Заключение. Полиморфные варианты гена APOE ассоциированы с показателями обмена ХС, риском развития ИБС и эффективностью гиполипидемической терапии розувастатином. Ключевые слова: аполипопротеин Е, rs7412, rs4420638, ишемическая болезнь сердца, розувастатин. Отношения и деятельность: нет.