Human papillomavirus (HPV) trong đó 14 týp HPV nguy cơ cao (hr) có liên quan đến hơn 99% ca ung thư cổ tử cung. Để đánh giá các chỉ số kỹ thuật của sinh phẩm chẩn đoán HPV bằng Realtime-PCR cần các bộ mẫu chuẩn phù hợp. Chúng tôi tiến hành nghiên cứu này, nhằm phát triển các bộ mẫu chuẩn HPV để đánh giá độ nhạy lâm sàng và phân tích, độ đặc hiệu và độ chính xác đã được thiết lập từ 14 plasmid tái tổ hợp và các mẫu bệnh phẩm lâm sàng. Đặc tính mẫu chuẩn được đánh giá bằng PCR với cặp mồi PGMY09/ PGMY11 và 2 bộ sinh phẩm thương mại. Chúng tôi đã xây dựng được 4 bộ mẫu panel chuẩn bao gồm: (i) Bộ mẫu xác định độ nhạy lâm sàng với 60 bệnh phẩm dương tính với 14 týp hrHPV, (ii) Bộ mẫu xác định độ nhạy phân tích gồm 14 mẫu plasmid chứa đoạn gen của HPV đã xác định được nồng độ, (iii) Bộ mẫu xác định độ đặc hiệu gồm 103 mẫu lâm sàng âm tính và (iv) Bộ mẫu xác định độ chính xác gồm mẫu thuộc 14 týp với 4 nồng độ khác nhau. Đặc tính của các bộ mẫu chuẩn được kiểm tra bởi 2 phòng thí nghiệm độc lập và cho kết quả đồng nhất. Đây là các bộ mẫu chuẩn hrHPV sử dụng để đánh giá kỹ thuật Realtime-PCR lần đầu tiên được thiết lập và công bố tại Việt Nam.
Human papillomavirus (HPV) 68 là một trong các týp HPV nguy cơ cao gây ung thư cổ tử cung với tỷ lệ nhiễm chỉ sau HPV52, 16 và 18. Mặc dù vậy các vắc xin phòng HPV hiện nay không bao gồm týp vi rút này. Hơn nữa thông tin về đặc điểm di truyền của týp này còn rất hạn chế. Vì vậy, chúng tôi tiến hành nghiên cứu này nhằm phân tích di truyền của 12 chủng HPV68 phân lập từ 3076 bệnh phẩm của phụ nữ tại Hà Nội và Thành phố Hồ Chí Minh bằng giải trình tự gen. Dựa trên sự khác biệt trình tự nucleotit vùng gen L1, E6 và E7, các dòng của HPV68 được xác định bằng phương pháp maximum likelihood, trong khi đó các vị trí đa hình nucleotit và biến đổi axit amin được so sánh với trình tự gốc (chủng prototype). Kết quả cho thấy HPV68 dòng C chiếm 80% số mẫu HPV68 phát hiện được. Gen L1 có tần suất đa hình nucleotit cao nhất (8,2%) và protein E7 có tỷ lệ axit amin biến đổi cao nhất trong 3 gen nghiên cứu (11,7%). Trong số các vị trí đa hình dẫn đến thay thế axit amin, Y18C và Q22E tìm thấy ở các chủng HPV68 tại Việt Nam nằm trong vùng tương tác giữa protein E7 và Rb1. Tuy nhiên, ảnh hưởng của các đa hình và biến đổi axit amin đến khả năng hình thành ung thư cần được nghiên cứu sâu hơn.
scite is a Brooklyn-based organization that helps researchers better discover and understand research articles through Smart Citations–citations that display the context of the citation and describe whether the article provides supporting or contrasting evidence. scite is used by students and researchers from around the world and is funded in part by the National Science Foundation and the National Institute on Drug Abuse of the National Institutes of Health.
hi@scite.ai
10624 S. Eastern Ave., Ste. A-614
Henderson, NV 89052, USA
Copyright © 2024 scite LLC. All rights reserved.
Made with 💙 for researchers
Part of the Research Solutions Family.