En el transcurso de los años 1998 y 1999, la Secretaría de Salud del Guainía realizó búsqueda de triatominos en 38 comunidades indígenas del departamento del Guainía y determinó la seroprevalencia de infección con Trypanosoma cruzi en 9 comunidades. Los resultados entomológicos de los muestreos señalaron un índice de dispersión triatomínica de 31.5% y tres especies de triatominos: Rhodnius brethesi, Rhodnius prolixus y Pastrongylus geniculatus. Rhodnius prolixus y Panstrongylus geniculatus son nuevos registros para el departamento del Guainía. R. brethesi se registró por primera vez en Colombia en el departamento del Guainía en 1999 (Villegas et al. 1999); en el presente estudio se encontraron dos especímenes infectados naturalmente con T. cruzi, lo cual hace suponer que este. especie puede ser uno de los vectores de la enfermedad de Chagas en el departamento ya que posee una amplia distribución pues fue capturada en 10 comunidades. mientras que R. prolixus se halló en una y P. geniculatus en dos. Los resultados serológicos muestran una prevalencia de infección con T. cruzi en 4 comunidades.
Durante 1998, la Secretaría de Salud del Guainía realizó diagnóstico de malaria, seguimiento a pacientes positivos, captura de anofelinos, mapa y muestreo de criaderos, así como identificación de fauna anofelina, con el objeto de determinar la incidencia, prevalencia y los aspectos entomológicos que están relacionados con la transmisión de esta patología en el departamento. Se tomaron 2464 exámenes de gota gruesa, de los cuales 343 fueron positivos por primera vez, de éstos 292 procedían del departamento del Guainía, 47 del departamento del Vichada, 2 del departamento del Meta y 2 del país de Venezuela; 71 exámenes positivos por segunda vez se consideraron recaídas. La incidencia de malaria en el departamento del Guainía en 1998 fue 11 por mil habitantes y la prevalencia de 13 por mil, de cada siete casos nuevos de paludismo, uno presenta recaída. El porcentaje de gotas gruesas positivas, por primera vez, fue 12.6%; la relación P/asmodium vivax : Plasmodium falciparum 6: 1. Los Anopheles identificados en el área urbana fueron Anopheles darlingi, A. oswaldoi, A. rangeli y A. trinkae y en el área rural A. triannulatus, A. oswaldoi, A. evansae y A. peryassui. En relación con los criaderos de anofelinos en el departamento se intervino la parte urbana y su distribución se representa en un mapa. Estos fueron muestreados semanalmente durante el año y tratados con organofosforados. Las observaciones sobre comportamiento de los vectores se hicieron en el intradomicilio y peridomicilio; Anopheles está picando dentro y fuera de la vivienda, pero no está reposando en las paredes o muebles de las casas.
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