Gracilaria tenuistipitata is a red macroalga often found in intertidal environments, where it is frequently under drought stress due to tidal water scarcity. In order to be able to study the molecular mechanisms involved in G. tenuistipitata resistance to dehydration, we have done a dehydration assay, tested different RNA extraction protocols, and selected new reference genes for reverse transcription quantitative PCR (RT-qPCR). After testing four different methods, we found that an adapted TRIzol method resulted in the highest quantities of pure RNA from less biomass. This method yielded an average of 783.6 ng mg −1 of clean RNA from 25 mg of fresh tissue in only 1.5 h. Additionally, DNAse I treatment and silica spin column purification were done prior to RT-qPCR. Of the nine putative reference genes tested for expression stability under control and drought-like conditions, a combination of four genes: β-GALACTOSIDASE B (GLB), TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIB (GTF2B), EUKARYOTIC ELONGATION FACTOR 2 (EEF2), and β-TUBULIN (TUB) was selected. This allowed us to measure the transcription level of THIOREDOXIN (TRX), OXYGEN-EVOLVING ENHANCER 1 (OEE), and NITRATE REDUCTASE 2 (NIA2). TRX was upregulated after 1-h dehydration and kept higher transcriptional levels even 4 h later. In contrast, OEE1 transcriptional levels were slowly downregulated, and NIA2 transcriptional levels were downregulated 1 h after dehydration but returned to regular levels 4 h after.This suggests that 40 % dehydration of G. tenuistipitata induced transcriptional responses without changing the relative growth rate or affecting the thalli mortality.

Chaves, G.A.T.) Auxin signaling pathways and their interactions with the sugarcane circadian clock. 2017. 149 p. PhD Thesis-Graduate Program in Biochemistry.

Dedico esse trabalho à minha família, minha fortaleza e inspiração. AgradecimentosPrimeiramente gostaria de agradecer à minha família, pai, mãe, irmã, vó e todo mundo mais, pelo suporte e pelo amor, por tudo, sem vocês esse trabalho não teria se concretizado.Quero agradecer muito à minha orientadora Profa. Dra. Aline Maria da Silva por tudo, os ensinamentos, o ambiente de trabalho, tudo tudo tudo. Também quero agradecer ao Dr.Paulo Adriano Zaini, pelas conversas, dicas e compreensão, pela ajuda e disponibilidade sempre. Outra pessoa muito importante a quem eu quero agradecer é a minha amiga Dra.Marilene Silva Oliveira, pela amizade e presença incondicionais, pelos conselhos e ajuda com experimentos, e tudo mais, muito muito muito muito obrigado. Agradeço também ao técnico do nosso laboratório, Alexandre Sanchez, pela eficiência e prestatividade e aos grupos de pesquisa liderados pelos professores Dr. Walter Terra, Dra. Regina Lúcia Baldini, Dra. SuelyLopes Gomes e Dra. Glaucia Mendes Souza, pelos equipamentos e reagentes disponibilizados.Quero agradecer muito aos meus amigos, que foram força e companhia quando eu precisei, e quando eu não precisei também. Muito obrigado ao pessoal da HGF, André, Marcelo e Vitor, por serem presentes, amigos, família. Quero agradecer também a outras pessoas muito importantes e que também estiveram comigo ao longo dessa jornada, Lucas, por ter vivido isso comigo, Tati, pessoas que me ajudaram/ajudam a acreditar, mesmo nos momentos mais difíceis. Também quero agradecer aos amigos do IQ, aos amigos do lab, Rodrigo, Paulo, Ana, Luciana, Oséias, Wesley, Joaquim, Deibs, Fernando, Alê, pela ajuda e por produzirem um ambiente de trabalho agradável e estimulante. Finalmente, quero agradecer a um grupo de pessoas que foram muito importantes anteriormente ao mestrado, mas cuja importância ainda se faz presente. Muito obrigado ao Prof. Dr. Fernando Fortes Valência, por ter salvado minha graduação; à Júlia, por ter me dado qualquer apoio que eu precisasse, bem no comecinho de tudo; ao pessoal de uma república muito louca onde eu morei; à Liviazinha, que me abriu os olhos há muito tempo atrás; à Ju, que me ensinou a pipetar; à Isa, que me deu uma visão mais realista de trabalho; as minhas ex-orientadoras de Iron is an essential nutrient for bacteria, being involved in many metabolic processes. Despite its low solubility, bacteria present efficient and specific systems for uptake, utilization and storage of iron, meanwhile controlling metal concentration adequately to prevent potential toxic effects of free iron. Xylella fastidiosa is a Gram-negative bacterium which colonizes the xylem of a wide range of crops and wild species of plants worldwide. This bacterium is the agent of several diseases affecting economically important crops, such as citrus, grapevine and coffee. Among the proposed X. fastidiosa virulence mechanisms is the formation of biofilm which may oclude xylem vessels causing hydric stress. It is postulated that iron uptake might cause reduction of its concentration within the xyle...