Objective:
Toll-like receptors (TLRs) are significant receptors to the innate immune system which symbolizes a family of pattern recognition receptors. We aimed to investigate associations between rs4833095 polymorphism of TLR1, rs3804099 polymorphism of TLR2, rs5744174 polymorphism of TLR5, and rs10004195 polymorphism of TLR10 in dyspeptic individuals with Helicobacter pylori infection.
Methods:
Genomic DNA was isolated and genotyping of rs4833095 polymorphism in TLR1, rs3804099 polymorphism in TLR2, rs5744174 polymorphism in TLR5, and rs10004195 polymorphism in TLR10 were investigated in 400 individuals (205 in dyspeptic individuals with H. pylori-positive subjects and 195 dyspeptic individuals with H. pylori-negative subjects) by real-time PCR. Statistical analysis was performed by Pearson’s Chi-square test.
Results:
According to our study; rs4833095 polymorphism in TLR1 C allele, rs3804099 polymorphism in TLR2 C allele, rs5744174 polymorphism in TLR5 C allele, and rs10004195 polymorphism in TLR10 A allele increased the risk of H. pylori infection [odds ratio (OR), 2.01; 95% confidence interval (CI), 1.39–3.16; OR, 1.78; 95% CI, 1.19–2.6; OR, 1.87; 95% CI, 1.25–2.78; OR, 2.66; 95% CI, 1.72–4.099, respectively].
Conclusion:
This is the first study that investigates TLRs in H. pylori infection in Turkey. Our findings may support the hypothesis that polymorphisms in certain TLRs may cause a genetic predisposition to H. pylori-related gastric problems.
Otoimmün tiroid hastalıklarında CTLA-4 geninin in silico analizinin değerlendirilmesi Evaluation of the in silico analysis of CTLA-4 gene in autoimmune thyroid diseases Duygu Kırkık1,
Genel sağlık için ağız ve diş sağlığı oldukça önemlidir. Ağız ve diş hastalıkları dünyada en yaygın görülen sağlık problemlerinin başında gelmektedir. Diş eti hastalıkları; dişi çevreleyen ve dişi destekleyen kemiğe kadar ilerleyen, dişeti iltihabı ve diş problemlerini kapsamaktadır. Tedavi süresince dental birçok işlemde biyomalzeme kullanılmaktadır. Tedavinin etkinliğini değiştiren unsurlar arasında kullanılan malzemeler, malzemelerin kalitesi ve biyouyumu önem arz etmektedir. Vucüt dışarıdan yapısına katılan, yabancı maddelere karşı tepki göstermesine rağmen; dokulara göre geliştirilmiş biyouyumluluk gösteren biyomalzemeleri kabul etmektedir. Doku ortamı içerisinde herhangi bir hasara karşı; yüzey konfigürasyonu geliştirme, dokuyu indükleme ve inflamasyona karşı red cevabı oluşturma, biyomalzemelerin en önemli fiziksel özellikleri arasındadır. Bu makale de amaç, dental uygulamalarda kullanılan biyomalzemeleri tanımlamak, sınıflandırmak ve görevlerini araştırmaktır.
Detection of CD40 polymorphisms and investigation of their relationship with possible diseases by bioinformatics methodsBiyoinformatik yöntemler yardımıyla, CD40 polimorfizmlerinin tespiti ve olası hastalıklarla ilişkinin araştırılması
Background: Various variants of the miR-219-1 gene are one of the first genes associated with NSCLC prognosis in the literature.
Objectives: We aimed to genotype two different variants of the miR-219-1 gene and to investigate to using of the result as a biomarker in the diagnosis and treatment of NSCLC.
Materials and Methods: The patients were chosen according to International NSCLC criteria and genomic DNA was isolated from blood (138 patients and 100 healthy individuals). Then qRT-PCR was applied to determine the rs213210 and rs421446 variants of miR-219-1 gene polymorphisms. Allele and genotype frequencies were compared using Pearson’s chi-square and Fisher’s exact tests test.
Results: We found that TT genotype (p=0,381) in rs213210 compared with CC genotype (p=0,165) and CC genotype (p=0,823) in rs421446 compared with TT genotype (p=0,537) did not show a significantly increased risk of NSCLC. There is no relationship between polymorphisms in miR-219-1 and the outcome of NSCLC.
Conclusion: miRNA single nucleotide polymorphisms can be used as genetic biomarkers to predict cancer susceptibility, early diagnosis, and prognosis. Our study has shown that two variants of miR-219-1 were not related to NSCLC in the Turkish population. The reason for this can be differences in ethnicity, regions, and background of population and these differences could lead to various outcomes.
Keywords: NSCLC; miR-219-1 gene; single-nucleotide polymorphisms.
Bazı bitkiler yüzyıllardır tıbbi amaç için kullanılmaktadır. Gastrointestinal bozukluklar, inflamasyon ve diyabet gibi bazı patolojik durumlar için İranlılar ve Türkiye'nin Güneydoğu Anadolu Bölgesi tarafından kullanılan en popüler bitkilerden biri Teucrium polium L. 'dir. Literatürde Teucrium polium L. bitkisinin toksisite seviyesini gösteren herhangi bir çalışma bulunmamaktadır. Bu çalışmada amaç; Türkiye' de yetişen Teucrium polium L. bitkisinin HepG2 hücre hattı üzerindeki etkisini araştırmaktır. Gereç ve Yöntem: Çalışmamızda; Teucrium polium L. bitkisinin toksisite seviyesini ölçmek için hücre kültürü metodu kullanılmıştır. Bulgular: Araştırmamızdan elde ettiğimiz sonuçlara göre; Teucrium polium L. bitkisi HepG2 hücre hattı üzerinde yüksek oranda toksisite göstermiştir. Sonuç: Çalışmamızdan elde ettiğimiz bilgilere göre; insanların bilinçsizce tükettiği ürünler doğal da olsa, insan vücudunda tahribatlara, hücre ölümlerine, DNA kırıklarına neden olabilir. Teucrium polium L. bitkisi insanlar tarafından kullanıma uygun değildir.
scite is a Brooklyn-based organization that helps researchers better discover and understand research articles through Smart Citations–citations that display the context of the citation and describe whether the article provides supporting or contrasting evidence. scite is used by students and researchers from around the world and is funded in part by the National Science Foundation and the National Institute on Drug Abuse of the National Institutes of Health.