Capsicum species are very important in Brazil because of economic, cultural and biological factors, and the country is considered to be a diversity center for this genus. Collection and maintenance of the genetic diversity in Capsicum are important to avoid genetic erosion. Besides the identification of species, the characterization and evaluation of accessions maintained in gene banks are of fundamental importance. For this purpose, multivariate methods have become an important tool in the classification of conserved genotypes. The objectives of this study were: i) to identify and characterize accessions of the Capsicum spp collection and draw conclusions about the potential use of certain accessions in different production sectors; ii) to estimate the genetic divergence among accessions using the Ward-MLM procedure, and iii) to evaluate the efficiency of the analysis of continuous and categorical data using the Ward-MLM procedure. Fifty-six Capsicum spp accessions were evaluated based on 25 descriptors, 14 of which were morphological and 11 agronomic. Based on the qualitative descriptors, it was possible to identify all species and, together with the agronomic descriptors, genotypes could be indicated with potential for use in various production sectors. Five was determined as the ideal number of groups by the criteria pseudo-F and pseudo-t 2 . The Ward-MLM procedure allowed the differentiation of the species C. annuum, C. frutescens, C. baccatum, and C. chinense in separate groups. The Ward-MLM procedure showed some level of efficiency in clustering Capsicum species analyzing morphological and agronomic data simultaneously.
ABSTRACT. Accessions in gene banks need to be characterized and evaluated to determine their genetic diversity. We made a joint diversity analysis of the tomato gene bank of the Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro in Rio de Janeiro State, using the Ward-modified location model. Forty Solanum lycopersicum accessions were characterized and evaluated for 22 morphoagronomic descriptors and 131 random amplified polymorphic DNA markers. Based on the pseudo-F and pseudo-t 2 criteria, the optimal number of groups was established as five. Variability within groups was high for Divergence among tomatoes using Ward-MLM both continuous and discrete nominal data. The first two canonical variables explained about 90% of the inter-group variability. Care should be taken in using the Ward-modified location model technique to avoid incorporating excessive and unnecessary markers, which could favor molecular markers when compared with morphoagronomic variables. However, the minimum number of markers is germplasm-dependent and must be recalculated for each new divergence analysis.
ABSTRACT. Use of multivariate statistical algorithms is considered an important strategy to quantify genetic similarity. Local varieties and traditional (heirloom) seeds of genotypes are key sources of genetic variation. The Universidade Estadual do Norte Fluminense (UENF), Rio de Janeiro, Brazil, has a tomato gene bank with accessions that have been maintained for more than 40 years. We compared various algorithms to estimate genetic distances and quantify the genetic divergence of 40 tomato accessions of this collection, based on separate and joint analyses of discrete and continuous variables. Differences in continuous variables and discrete and joint analyses were calculated based on the Mahalanobis, Cole Rodgers and Gower distances. Although opinions differ regarding the validity of joint analysis of discrete and continuous data, we found that analyzing a larger number of variables together is viable and can help in the discrimination of accessions; the information that is generated is relevant and promising for both, the accessions conservation and the use of genetic resources in breeding programs.
E studos de divergência genética são importantes para o conhecimento da variabilidade genética das populações e possibilitam o monitoramento de bancos de germoplasmas (Cruz e Carneiro, 2003), pois geram informações úteis para preservação e uso dos acessos (Toquica et al., 2003 et al., 1998). Marshall (1989), estimou que 0,5% dos acessos de um banco devem ser requisitados por ano, e considerou que este seria o uso mínimo desejável. Porém, isto dificilmente acontece, e segundo Li et al. (1998), os fatores que dificultam o uso do banco de germoplasma são a não disponibilidade dos acessos aos melhoristas, a falta de conhecimento sobre os acessos conservados e o não conhecimento dos curadores sobre os programas realizados pelos melhoristas. Hammer (2003), afirma que um banco de germoplasma não pode ser um museu, devendo-se estimular a avaliação dos acessos por meio de análises genéticas.Para determinar quão distante geneticamente uma população ou genótipo é de outra são utilizados métodos biométricos, onde se quantifica ou se estima a heterose, que são analisados pela estatística multivariada permitindo unificar múltiplas informações de um conjunto de caracteres. Vários métodos podem ser utilizados, dentre eles estão a análise por componentes principais, variáveis canônicas e métodos aglomerativos. A escolha do método RESUMOTécnicas multivariadas foram utilizadas para avaliar a divergên-cia genética entre 56 acessos da coleção de germoplasma de Capsicum spp. da UENF. Foram utilizados onze descritores quantitativos propostos pelo International Plant Genetic Resources Institute, em um experimento conduzido em condições de campo, em Campos dos Goytacazes (RJ), no delineamento de blocos ao acaso com três repetições e 10 plantas por parcela. A distância generalizada de Mahalanobis (D 2 ) foi utilizada como medida de dissimilaridade. Foram aplicadas variáveis canônicas, método hierárquico do vizinho mais próximo, método de otimização de Tocher e projeção das distâncias no plano. As variáveis avaliadas foram comprimento e diâmetro do fruto, número de sementes por fruto, peso médio do fruto, altura de planta, diâmetro da copa, peso de 1000 sementes, dias para florescimento, dias para frutificação, número de frutos por planta e peso de frutos por planta. Houve diferença significativa entre os acessos para todos os descritores avaliados. Observou-se concordância entre todas as técnicas multivariadas utilizadas e foi possível separar os acessos em oito grupos distintos, indicando a existência de variabilidade genética entre os acessos. A maior distância generalizada de Mahalanobis foi 266,42. Observou-se que acessos têm potencial para serem utilizados como genitores em cruzamentos para obtenção de progênies com alta heterose. Pela análise das variáveis canônicas observou-se que os cruzamentos com maior potencial heterótico seriam 56x43, 34x08 e 59x41.Palavras-chave: Capsicum spp., germoplasma, variáveis canônicas, método de Tocher, projeção das distâncias no plano, recursos genéticos.
The Capsicum breeding has been developed with emphasis in bell pepper (Capsicum annuum) and few studies are available in other species, especially C. baccatum, which has potential use not only as disease resistance source but also in obtaining new genotypes suitable for farmers' production. In the present work, the combining ability of ten C. baccatum hybrids, along with their five parentals, were tested considering 12 agronomic traits. The hybrids were produced from a complete diallel without reciprocals and assessed in greenhouse conditions, in Campos dos Goytacazes, Rio de Janeiro state, Brazil, during the period July to December 2009. The experimental design was a randomized block with three replications and the following agronomic traits evaluated: canopy diameter (CD), plant height (PH), days to fructification (DF), number of fruits per plant (NFP), mean fruit weight (FW), dry fruit matter weight (FDM), dry matter content (DM), fruit length (FL), fruit diameter (FD), pulp thickness (PT), total soluble solids (TSS) and yield per plant (PP). Significant differences were observed only for general combining ability (GCA) in regard to PH, FW, FDM, DM, PT and TSS, indicating that additive effects were involved on the control of these characters. For CD, DF, NFP, FL, FD and PP, there was significance not only for GCA but also for specific combining ability (SCA) indicating that non-additive and additive effects were important in genetic control of these traits. The hybrids UENF 1629 X UENF 1732, UENF 1616 X UENF 1732 and UENF 1624 X UENF 1639 were considered superior because they have favorable agronomic traits.
ABSTRACT. Small farmers have played an important role in maintaining genetic resources of traditional varieties. Collecting and characterizing germplasm, especially landraces and heirloom varieties, are strategic activities that would create a knowledge base describing the traditional varieties of a given region and reduce the risk of genetic erosion. The objectives of this work were as follows: collect sweet potato roots from rural properties and local markets in Rio de Janeiro State, Brazil; characterize the accessions using RAPD and ISSR molecular markers, comparing the efficiency in discrimination of these two types of molecular markers; and estimate the genetic variability of the population. Fifty-nine samples from rural properties and 19 from local markets were studied. A matrix of binary data was developed to analyze the molecular data using the Jaccard index to estimate genetic differences among accessions, and clusters were made using the UPGMA method. The molecular techniques detected genetic variability among the accessions, with cophenetic correlation coefficients (CCC) of 0.80 for RAPDs and 0.89 for ISSRs. The RAPD and ISSR marker results corresponded well, with a correlation of 0.55. All of the accessions were considered distinct, which demonstrates that traditional farmers maintain sweet potato genotypes that have good genetic diversity.Keywords: genetic resources, germplasm characterization, genetic variability, heirloom seeds.Comparação dos marcadores RAPD e ISSR na estimativa da diversideade genética entre acessos de batata-doce (Ipomoea batatas (L.) Lam.) RESUMO. Os pequenos agricultores têm um importante papel na manutenção de recursos genéticos das variedades tradicionais. A coleta e caracterização de germoplasma, especialmente variedades locais e heirloom são atividades estratégicas que permitem o desenvolvimento de conhecimentos sobre as variedades tradicionais de uma determinada região reduzindo o risco de erosão genética. Os objetivos deste trabalho foram: coletar raízes de batata-doce em propriedades rurais e estabelecimentos comerciais do Estado do Rio de Janeiro, Brasil; caracterizar os acessos usando os marcadores moleculares RAPD e ISSR; e estimar a variabilidade genética na população. Cinquenta e nove amostras coletadas em propriedades rurais e em 19 estabelecimentos comerciais foram estudadas. Uma matriz de dados binários foi desenvolvida para análise dos dados moleculares, usando o índice de Jaccard para estimar a dissimilaridade genética entre os acessos, e os grupos foram obtidos usando o método UPGMA. As técnicas moleculares detectaram variabilidade genética entre os acessos, com correlação cofenética de 0,80 para RAPD e 0,89 para ISSR. O resultado obtido com RAPD e ISSR foi correspondente, com uma correlação de 0,55. Todos os acessos coletados foram considerados distintos, o que demonstra que os agricultores tradicionais da região Norte Fluminense detêm genótipos de batata-doce com expressiva diversidade genética.Palavras-chave: recursos genéticos, caracterização de germoplas...
O uso de germoplasma em programas de melhoramento está relacionado à disponibilidade de informações sobre os acessos contidos numa coleção ou banco. A caracterização e a divergência genética e fenotípica entre acessos de bancos de germoplasma têm sido determinadas, e várias espécies de hortaliças já foram objeto de estudos nessa área. Com o objetivo de quantificar a divergência fenotípica entre 29 acessos de Capsicum spp., com base em caracterização morfológica e agronômica, 37 descritores foram analisados utilizando-se técnicas de componentes principais, análise de agrupamento e variáveis multicategóricas. O experimento foi conduzido em condições de campo, em Campos dos Goytacazes, RJ, no período de março a dezembro de 2004. Os dados obtidos foram analisados utilizando-se os recursos computacionais do programa GENES. Os grupos formados pelos métodos de Tocher e do vizinho mais próximo foram parcialmente concordantes. A análise de variáveis multicategóricas foi eficiente na quantificação da divergência fenotípica.
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