Key messageRice breeding programs based on pedigree schemes can use a genomic model trained with data from their working collection to predict performances of progenies produced through rapid generation advancement.AbstractSo far, most potential applications of genomic prediction in plant improvement have been explored using cross validation approaches. This is the first empirical study to evaluate the accuracy of genomic prediction of the performances of progenies in a typical rice breeding program. Using a cross validation approach, we first analyzed the effects of marker selection and statistical methods on the accuracy of prediction of three different heritability traits in a reference population (RP) of 284 inbred accessions. Next, we investigated the size and the degree of relatedness with the progeny population (PP) of sub-sets of the RP that maximize the accuracy of prediction of phenotype across generations, i.e., for 97 F5–F7 lines derived from biparental crosses between 31 accessions of the RP. The extent of linkage disequilibrium was high (r 2 = 0.2 at 0.80 Mb in RP and at 1.1 Mb in PP). Consequently, average marker density above one per 22 kb did not improve the accuracy of predictions in the RP. The accuracy of progeny prediction varied greatly depending on the composition of the training set, the trait, LD and minor allele frequency. The highest accuracy achieved for each trait exceeded 0.50 and was only slightly below the accuracy achieved by cross validation in the RP. Our results thus show that relatively high accuracy (0.41–0.54) can be achieved using only a rather small share of the RP, most related to the PP, as the training set. The practical implications of these results for rice breeding programs are discussed.Electronic supplementary materialThe online version of this article (10.1007/s00122-017-3011-4) contains supplementary material, which is available to authorized users.
Even today, there are wide health inequalities in Latin America and the Caribbean. The country with the most favorable health indicators was Cuba and that with the least favorable was Haiti. We recommend systematic evaluation of health inequalities in Latin America and the Caribbean through the Inequalities in Health Index and other indices, in order to analyze actions, policies and programs to reduce inequities in this region.
RESUMENLos datos sobre prevalencia de consumo de alcohol en Argentina, podrían indicar un fuerte impacto del consumo de alcohol en la mortalidad general y en la esperanza de vida, en especial en el sexo masculino. El objetivo de este trabajo es analizar el impacto del consumo de alcohol en la mortalidad de los argentinos en el año 2008, mediante la metodología propuesta por el Centers of Disease Control and Prevention (CDC, 1990), suavizando los casos con el promedio de defunciones producidas entre los años 2007 a 2009. Así mismo se analizan los Años de Esperanza de Vida Perdidos (AEVP) del año 2008, según la metodología propuesta por Arriaga (1996). Se utilizaron fuentes de datos secundarios: registro de defunciones y datos de prevalencia de consumo de alcohol en la población. En ese año se produjeron 11.013 muertes atribuidas al consumo de alcohol (3,6% del total de muertes en la población), de las cuales el 73% se produjeron en el sexo masculino. Los AEVP a causa del consumo de alcohol fueron de 0,20 años en mujeres y 0,80 años en hombres. Las causas con más impacto en la pérdida de esperanza de vida son las causas externas de mortalidad y el grupo más afectado fue el de 15 a 34 años. Los resultados de este trabajo reflejan la necesidad de potenciar las estrategias de intervención dirigidas a controlar el consumo de alcohol, en especial en hombres jóvenes.Palabras clave: Mortalidad, Alcoholismo, Esperanza de Vida. ABSTRACTPrevalence data about alcohol consumption in Argentina may indicate a strong impact on general mortality and life expectancy, mainly in males. The aim of this study was to analyze the impact of alcohol consumption on mortality in the Argentineans in 2008, through of the Centers of Disease Control and Prevention (CDC, 1990) methodology, smoothing cases with average deaths between 2007 and 2009. Furthermore Years of Life Expectancy Lost (YLEL) was calculated. Secondary data sources was using: death records and prevalence data about alcohol consumption. In 2008 there were 11,013 deaths attributed to alcohol consumption (3.6% of all deaths in the population), of which 73% occurred in males. The YLEL due to consumption of alcohol were 0.20 years in women, and 0.80 years in men. Death causes with most impacted in life expected were external causes and the age group most affected was 15 to 34. The results of this work reflect the need to enhance intervention strategies aimed at controlling alcohol consumption, especially in young men.
El logro de una buena cobertura de las estadísticas vitales (especialmente de los nacimientos y las defunciones), aún constituye un desafío muy importante en los países de América Latina. De ello depende el estudio de numerosas temáticas relacionadas con la salud de la población, como la situación y evolución de la natalidad, la fecundidad y la mortalidad. Al hacer un seguimiento de los avances en este aspecto, desde la demografía se ha notado que las técnicas de estimación más corrientes no funcionan adecuadamente al ser utilizadas en unidades geográficas o político-administrativas subnacionales. Para enfrentar el inconveniente, se están aplicando procedimientos poco frecuentes de estimación o incluso, desarrollando otras técnicas que permiten avanzar en el estudio de la cobertura de nacimientos y defunciones en diferentes niveles geográficos. En este trabajo se propone una revisión bibliográfica sobre las evaluaciones realizadas en América Latina desde el año 2000. Se recorta el análisis a estudios promovidos en el ámbito de los institutos nacionales de estadística y de los ministerios de salud, y considerando procedimientos principalmente de tipo directo.
<p>Se ha reconocido ampliamente que el nivel educativo de las madres influye en el nivel de la mortalidad infantil (MI) pero poco se sabe de la situación en la provincia de Córdoba-Argentina para monitorear inequidades. Por ello, el objetivo fue identificar brechas en la MI según el nivel de instrucción de las madres en la provincia. La fuente de datos es el Censo de Población, hogares y viviendas (2010). Se utiliza la técnica indirecta de Brass. Se calculan indicadores de desigualdad y se simula el nivel actual de la MI aplicando las brechas detectadas. Se arribó a la conclusión de que a mayor nivel educativo menor el riesgo de los niños de morir antes del año de edad. El RR fue de 1,73 y el RAP de 25%. De no existir la brecha, la TMI hubiera sido 6 en vez de 8 ‰ nacidos vivos en 2015.</p>
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