Using whole exome sequencing, Fassio et al. identify de novo mutations in ATP6V1A, encoding the A subunit of v-ATPase, in four patients with developmental encephalopathies and epilepsy. Functional and expression studies demonstrate impaired lysosomal homeostasis, defective neurite elongation and loss of excitatory inputs in cultured neurons.

No abstract

No abstract

No abstract

Congenital central hypothyroidism (CCH) is a very rare disease. Alterations in pituitary development genes as well as mutations of immunoglobulin superfamily member 1 and transducin β-like protein 1 can result in CCH and multiple pituitary hormone deficiencies. However, mutations of the thyrotropin-releasing hormone receptor or thyroid-stimulating hormone-beta (TSHB) gene are responsible for isolated CCH. In this paper, we present the cases of two siblings with a novel mutation of TSHB. Direct sequencing of the coding regions and exon/intron boundaries of the TSHB gene revealed two homozygous nucleotides changes. One of them was c.40A>G (rs10776792) which is a very common variation that is also seen in healthy individuals, the other was c.94G>A at codon 32 of exon 2 which resulted in a change from glutamic acid to lysine (p.E32K). Both patients were homozygous and the parents were heterozygous.

Amaç: Williams-Beuren Sendromu nadir görülen genetik bir hastalıktır. Bu hastalarda doğumsal kalp hastalıkları sık görülmekte ve sendromdaki en önemli mortalite ve morbidite nedenini oluşturmaktadır. Çalışmamızda, Williams sendromu tanısı ile takip edilen hastalarımızın kardiyovasküler bulguları ve klinik izlemleri değerlendirildi. Gereç ve Yöntemler:Ocak 2011-Kasım 2017 tarihleri arasında Çocuk Kardiyoloji Bölümü tarafından Williams Sendrom tanısı koyulan toplam 12 olgu değerlendirildi.Bulgular: Hastaların %83'ünde doğumsal kalp hastalığı mevcuttu. En sık görülen kardiyak anomali pulmoner stenozdu. Hastaların %60'ında pulmoner stenoz, %50'sinde aort stenozu, %30'unda ventriküler septal defekt, %20'sinde atriyal septal defekt saptandı. Birer olguda hipertrofik kardiyomiyopati, aort koarktasyonu ve mitral kapak prolapsusu vardı. Eşlik eden ek anomalilere bakıldığında; hastaların %50'sinde hipotiroidi, %50'sinde idiyopatik hiperkalsemi, %16'sında nefrolitiyazis, %34'ünde herni saptandı.Sonuç: Williams sendromlu hastalarda doğumsal kalp hastalıkları sık görülmektedir. Klinik belirti ve bulgu olmasa da bu çocukların kardiyak açıdan değerlendirilmesi, erken tanıyı sağlayacak ve ileride ortaya çıkabilecek geri dönüşümsüz komplikasyonların gelişmesini engelleyecektir. Bu hastalar; eşlik edebilecek çoklu sistemik bozukluklar açısından belirli aralıklarla izlenmelidir.

Objectives: Duchenne and Becker muscular dystrophies (DMD/BMD) are muscle diseases that show X-linked recessive inheritance. The disease occurs depending on large mutations, deletions/duplications, small mutations, point mutations and mid-intronic mutations of the gene encoding the protein called dystrophin. Therefore, in this study, we aimed to investigate the pathogenic variants of DMD in the affected family. Methods: A 23-year-old male who had weakness in the muscles, difficulty climbing the stairs, frequent falls at the age of seven was referred to the Medical Genetics department for an initial diagnosis of DMD/BMD. His siblings also suffered from similar symptoms. Therefore, eight individuals from the same family were included in the study. MLPA analysis was performed to evaluate deletion/duplication and variants of the DMD gene were evaluated by targeted NGS. Sophia DDM algorithms were used for the bioinformatics analysis of data, and the pathogenicity of the mutations was evaluated based on in silico prediction tools. Results: Allelic variants were identified in 8 individuals of the family including two suspected patients and six suspected obligatory carriers. NGS analysis revealed that proband and his nephew were hemizygous for pathogenic c.10018T > C (p.Cys3340Arg, C3340R) mutation and mother, two sisters and niece were carriers. Conclusions: C3340R mutation was first reported in a Taiwanese BMD patient among the 23 different pathologic changes. This variant identified as pathogenic because of being highly conserved cysteine substitution in the dystroglycan-binding domain of dystrophin. This study has the importance of reporting an infrequent pathogenic mutation, C3340R, in two patients and four suspected obligatory carriers of a Turkish family.

ÖZETAmacımız, yaş ve aile hikayesinden bağımsız olarak merkezimizde over (OC) ve endometriyum kanseri (EC) tanısı ile cerrahisi ve ardından genetik mutasyon analizi uygulanan hastalarımızın mutasyon sıklığını ve sekanslarını araştırmaktır. Son yıllarda önleyici stratejilerin gelişimi dışında tedavi seçeneklerindeki fırsatlar ve genetik çalışmaların artışı herediter kanserlere ilgiyi arttırmıştır. En sık görülen herediter jinekolojik kanserler; herediter meme over kanseri (HBOC) ve Lynch Sendromu (LS) dur. Hastalığın düşük prevalansı, test pahalılığı ve etik sebepler popülasyon bazlı taramayı kullanışsız hale getirmektedir. Birimimizde 01.04.2018-01.10.2019 tarihleri arasında genetik araştırması yapılan 37 EC ve 15 OC tanısı almış hastamız çalışmaya dahil edilmiştir. BRCA1/2 ve LS genlerini de içeren (MLH1, MSH2, MSH6, PMS 2) 25 genden oluşan geniş ailevi panel testi uygulanmıştır. Ailevi gen paneli testi yapılan 27 EC hastamızda, 1 MLH1 ve 1 ATM geninde patolojik mutasyon saptandı (%3.7 LS,%3.7 non LS). 11 hastada önemi belirsiz varyant mutasyon (VUS) görüldü (%40.7). BRCA mutasyon araştırması yapılan 20 EC'li hastamızda patolojik mutasyon saptanmadı. BRCA mutasyonu araştırılan 14 OC'lu hastamızda 3 patolojik varyant identifiye edildi ve hepsi BRCA1 genindeydi (HBOC %21,4). Ailevi kanser paneli değerlendirilen 4 OC'lu hastada 1 MSH6 ve 1 ATM geninde patolojik mutasyonlar izlendi. Over ve endometriyum kanserlerinde ailevi geniş mutasyon verilerinin çoğalması ve literatürde paylaşımı VUS oranlarını azaltacak, BRCA ve LS dışındaki genlerin jinekolojik kanserlerdeki rolünü ortaya çıkartacak ve yeni tarama algoritmalarını oluşturacaktır.