S-adenosylmethionine (SAM) riboswitches are widespread in bacteria, and up to five different SAM riboswitch families have been reported, highlighting the relevance of SAM regulation. On the basis of crystallographic and biochemical data, it has been postulated, but never demonstrated, that ligand recognition by SAM riboswitches involves key conformational changes in the RNA architecture. We show here that the aptamer follows a two-step hierarchical folding selectively induced by metal ions and ligand binding, each of them leading to the formation of one of the two helical stacks observed in the crystal structure. Moreover, we find that the anti-antiterminator P1 stem is rotated along its helical axis upon ligand binding, a mechanistic feature that could be common to other riboswitches. We also show that the nonconserved P4 helical domain is used as an auxiliary element to enhance the ligand-binding affinity. This work provides the first comprehensive characterization, to our knowledge, of a ligand-controlled riboswitch folding pathway.

Riboswitches are noncoding mRNA elements that control gene expression by altering their structure upon metabolite binding. Although riboswitch crystal structures provide detailed information about RNA-ligand interactions, little knowledge has been gathered to understand how riboswitches modulate gene expression. Here, we study the molecular recognition mechanism of the -adenosylmethionine SAM-I riboswitch by characterizing the formation of a helical stacking interaction involving the ligand-binding process. We show that ligand binding is intimately linked to the formation of the helical stacking, which is dependent on the presence of three conserved purine residues that are flanked by stacked helices. We also find that these residues are important for the formation of a crucial long-range base pair formed upon SAM binding. Together, our results lend strong support to a critical role for helical stacking in the folding pathway and suggest a particularly important function in the formation of the long-range base pair.

Transmettre de l'information sur les jeux de hasard et d'argent (JHA) semble être une façon efficace de sensibiliser la population aux problèmes de jeu. L'utilisation d'un site Web comme outil de sensibilisation peut être une approche adaptée pour atteindre les jeunes adultes puisqu'ils naviguent souvent sur Internet. Avant de lancer un tel site Web à l'ensemble de la population, il est important d'évaluer si la transmission d'informations par cet outil de communication est efficace pour informer les jeunes adultes sur les problèmes de jeu. Le but de la présente étude est d'évaluer si la transmission d'informations sur les JHA par le biais d'un site Web de sensibilisation permet d'améliorer les connaissances et de favoriser la reconnaissance des mythes associés au jeu. L'étude vise également à vérifier la satisfaction des utilisateurs envers le site Web. Cent joueurs réguliers âgés de 18 à 25 ans ont été répartis entre le groupe expérimental (consultation du site Web) et le groupe contrôle (lecture de magazines). Les participants devaient, pendant 30 minutes, naviguer sur le site ou lire des articles de revues et remplir les questionnaires expérimentaux avant et après leur tâche. Conformément au postulat de départ, les participants du groupe expérimental sont plus nombreux que ceux du groupe contrôle à rapporter des connaissances justes en matière de JHA et à pouvoir identifier les mythes reliés aux JHA après la consultation du site. Lors du post-test, les participants du groupe expérimental sont également plus nombreux à manifester des connaissances plus justes et à identifier correctement les mythes comparativement au prétest. En outre, ils ont aimé la présentation visuelle et la facilité de navigation du site. Les implications des résultats sont discutées.