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To investigate the origin and diversity of domestic guinea-pigs Cavia porcellus (Linnaeus, 1758; Rodentia, Caviidae), we sequenced the mitochondrial cytochrome b gene of 12 domestic and 10 wild specimens from six species, including the two presumed as ancestral to the domestic one: Cavia tschudii and Cavia aperea. All maximum parsimony and maximum likelihood analyses grouped C. porcellus with C. tschudii (mean K2P distance = 3.2 %); best trees had 609 steps (CI = 0.796; Bremer support Index (SI) = 28), and a -Ln = 4419.52, with 100 % and 97 % bootstrap support respectively. This clade, supported by three substitutions and 96 % bootstrap, is also obtained in the cladistic analysis of corresponding amino acids. When the C. aperea node was forced to join C. porcellus, these trees were consistently longer, less likely and robust, and with less defining characters than the optimal one. All C. porcellus sequences also clustered in a node defined by 15 substitutions. The sub-node containing animals from city markets, pet shops and laboratories was characterized by four substitutions (one non-silent, SI = 7, and 91 % bootstrap). Some South American C. porcellus, called "criollos" (creoles) by local breeders, were more diverse. Probably, a particular clade from southern Peru and Chile may represent a pre-Columbian lineage. Mean K2P distance between C. tschudii and C. aperea was rather large, 7.7 %. Cavia appeared as a robust node (100 % bootstrap). These results indicate that C. tschudii is the species most closely related to C. porcellus.Key words: Andes, Caviidae, cytochrome b, domestication, guinea pig, molecular phylogeny. RESUMENPara investigar el origen y la divergencia de los cuyes domésticos Cavia porcellus (Linnaeus, 1758; Rodentia, Caviidae), secuenciamos el gen mitocondrial para citocromo b de 12 especímenes domésticos y 10 silvestres de seis especies, incluyendo las dos que se presumen como ancestro de la doméstica: C. tschudii y C. aperea. Todos los análisis de máxima parsimonia y máxima verosimilitud agruparon a C. porcellus con C. tschudii (promedio de distancias K2P = 3,2 %); los mejores árboles tenían 609 pasos (CI = 0,796; Índice de Apoyo de Bremer (SI) = 28), y un -Ln = 4.419,52; con apoyos de remuestreo de 100 % y 97 % respectivamente. Dicho clado también apareció en el análisis cladístico de los aminoácidos correspondientes, apoyado por tres sustituciones y 96 % remuestreo. Cuando el nodo de C. aperea fue forzado a unirse al de C. porcellus, estos árboles fueron consistentemente más largos, menos probables y robustos, y con menos caracteres definitorios que el óptimo. Todas las secuencias de C. porcellus se agruparon también en un nodo definido por 15 sustituciones. El subnodo con animales de mercados de ciudad, tiendas de mascota y laboratorios se caracterizó por cuatro sustituciones (una no silenciosa, SI = 7 y 91 % remuestreo). Los C. porcellus sudamericanos, llamados "criollos" por los criadores locales, son más diversos. Probablemente, un clado del sur del Perú y Chile representa un lina...

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RESUMENExisten cuatro especies de camélidos sudamericanos, dos de ellos silvestres, guanaco (Lama guanicoe) y vicuña (Vicugna vicugna), y dos formas domésticas, alpaca (Lama pacos) y llama (Lama glama), cuyo origen ha sido objeto de debate. En el presente estudio la variación en el patrón de bandas G de los cromosomas de llamas y alpacas y la secuencia de dos genes mitocondriales han sido usados para estudiar el origen y la clasificación de llamas y alpacas. Patrones de bandas cromosómicas similares fueron observados en las cuatro especies de Lamini, incluso similares a los descritos para camello, Camelus bactrianus. Sin embargo, se encontraron finas y consistentes diferencias en los brazos cortos del cromosoma 1, permitiendo separar a camellos, guanacos y llamas, de las de vicuñas y alpacas. Este patrón fue consistente incluso en un híbrido guanaco x alpaca. Relaciones equivalentes fueron encontradas en las secuencias completas del gen para citocromo b, así como en el árbol de expansión mínima de las secuencias parciales de la región control, agrupando a guanacos con llamas y a vicuñas con alpacas. Los análisis filogenéticos mostraron a V. vicugna y a L. guanicoe como grupos recíprocamente monofiléticos. El análisis de las secuencias de ambos genes mostró dos clados entre las vicuñas, concordantes con las subespecies reconocidas para esta especie, pero los resultados obtenidos para guanacos no reflejaron la existencia de las cuatro subespecies previamente propuestas. El análisis combinado de variaciones cromosómicas y moleculares demostraron una alta similitud genética entre alpacas y vicuñas, así como entre llamas y guanacos. Aunque se revela hibridización direccional, nuestros resultados apoyan fuertemente la hipótesis de que la llama se deriva de L. guanicoe, y la alpaca de V. vicugna, apoyando la reclasificación de la alpaca como V. pacos.Palabras clave: Camelidae, Lama pacos, Vicugna pacos, Lama glama, cromosomas, citocromo b, d-loop. ABSTRACTFour camelid species exist in South America: two wild, the guanaco (Lama guanicoe) and the vicuña (Vicugna vicugna), and two domestic, the alpaca (Lama pacos) and the llama (Lama glama). However, the origin of the domestic species has been a matter of debate. In the present study, variations in chromosome G banding patterns and in two mitochondrial gene sequences have been used to study the origin and classification of the llama and alpaca. Similar patterns in chromosome G band structure were observed in all four Lamini species, and these in turn were similar to the bands described for camels, Camelus bactrianus. However, fine and consistent differences were found in the short arms of chromosome 1, separating camels, guanacos and llamas from vicuñas and alpacas. This pattern was consistent even in a hybrid guanaco x alpaca. Equivalent relationship

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