Species identification through DNA barcoding is a tool to be added to taxonomic procedures, once it has been validated. Applying barcoding techniques in public health would aid in the identification and correct delimitation of the distribution of rodents from the subfamily Sigmodontinae. These rodents are reservoirs of etiological agents of zoonoses including arenaviruses, hantaviruses, Chagas disease and leishmaniasis. In this study we compared distance-based and probabilistic phylogenetic inference methods to evaluate the performance of cytochrome c oxidase subunit I (COI) in sigmodontine identification. A total of 130 sequences from 21 field-trapped species (13 genera), mainly from southern Brazil, were generated and analyzed, together with 58 GenBank sequences (24 species; 10 genera). Preliminary analysis revealed a 9.5% rate of misidentifications in the field, mainly of juveniles, which were reclassified after examination of external morphological characters and chromosome numbers. Distance and model-based methods of tree reconstruction retrieved similar topologies and monophyly for most species. Kernel density estimation of the distance distribution showed a clear barcoding gap with overlapping of intraspecific and interspecific densities < 1% and 21 species with mean intraspecific distance < 2%. Five species that are reservoirs of hantaviruses could be identified through DNA barcodes. Additionally, we provide information for the description of a putative new species, as well as the first COI sequence of the recently described genus Drymoreomys. The data also indicated an expansion of the distribution of Calomys tener. We emphasize that DNA barcoding should be used in combination with other taxonomic and systematic procedures in an integrative framework and based on properly identified museum collections, to improve identification procedures, especially in epidemiological surveillance and ecological assessments.

Since it was trapped in the XIX th century, Rhagomys rufescens has been considered a rare endangered sigmodontine rodent and an endemic species of the Atlantic forest. Only a handful of vouchers of this taxon were known by Thomas, 1886. Recently, eight new individuals were collected, providing new geographical, morphological and phylogenetic (based on molecular evidence) information on this species. In the present work we report the southernmost occurrence record for R. rufescens at Indaial, Santa Catarina State, with the largest collected series of this species, the northernmost occurrence record at Santa Teresa, Espírito Santo State, and new records from Poços de Caldas, Minas Gerais State, from Ibiúna and Ribeirão Grande, São Paulo State.

ResumoDe agosto de 2004 a março de 2008, foi realizado um inventário da mastofauna terrestre da Reserva Biológica Estadual do Sassafrás para aumentar o conhecimento acerca deste grupo no estado de Santa Catarina. As esp cies foram registradas atrav s de armadilhas fotográ cas, avistamentos, coleta de animais mortos, rastros e armadilhas de captura viva. Foram registradas 43 espécies pertencentes a oito ordens. Informações sobre a biologia das espécies registradas foram incluídas, bem como as ameaças para os mamíferos terrestres da região. The objective of the study was to investigate and better describe the mammalian fauna of Santa Catarina state. We recorded species presence via several methods, including sightings, collection of fallen stoc , identi cation of trac s, utilization of camera traps, and live animal trapping. In full, we recorded 43 mammalian species distributed among eight orders. Our constructed inventory includes information on the biology of some species recorded, as well as potential threats to the conservation of terrestrial mammals in this region. Palavras-chave:

We report Akodon serrensis Thomas, 1902 from three localities in the state of Santa Catarina, in southern Brazil. The specimens were identified based on cytogenetic and craniometric analyses. These are the first records of A. serrensis collected in Santa Catarina, which extend the range of this species ca. 330 km S.

Rhagomys rufescens (Rodentia: Sigmodontinae) is an endemic species of the Atlantic forest from Southern and Southeastern Brazil. Some authors consider Rhagomys as part of the tribe Thomasomyini; but its phylogenetic relationships remain unclear. Chromosomal studies on eight specimens of Rhagomys rufescens revealed a diploid number of 2n = 36 and a number of autosome arms FN = 50. GTG, CBG and Ag-NOR banding and CMA3 /DAPI staining were performed on metaphase chromosomes. Eight biarmed and nine acrocentric pairs were found in the karyotype of this species. The X and Y chromosomes were both acrocentric. Most of the autosomes and the sex chromosomes showed positive C-bands in the pericentromeric region. The X chromosome showed an additional heterochromatic block in the proximal region of the long arm. Nucleolus organizer regions (NORs) were located in the pericentromeric region of three biarmed autosomes (pairs 4, 6 and 8) and in the telomeric region of the short arm of three acrocentrics (pairs 10, 12 and 17). CMA 3 /DAPI staining produced fluorescent signals in many autosomes, especially in pairs 4, 6, and 8. This study presents cytogenetic data of Rhagomys rufescens for the first time.

As florestas estacionais são ecossistemas marcados por grande sazonalidade climática, que ocorrem na região tropical em todo o mundo e estão associadas aos vários biomas brasileiros. Apesar do clima subtropical, estas florestas também ocorrem no sul do Brasil, na calha do rio Uruguai e seus principais afluentes, uma região ainda carente em estudos sobre a fauna. Neste sentido, apresentam-se aqui os resultados obtidos com o levantamento da mastofauna durante a etapa de implantação da Usina Hidrelétrica Foz do Chapecó, na divisa entre os estados de Santa Catarina e Rio Grande do Sul, no período de setembro de 2007 a junho de 2010. Foram empregados os métodos de observação direta, levantamento de vestígios e atropelamentos, armadilhas fotográficas, captura de pequenos mamíferos com armadilhas de arame e chapa de alumínio e com armadilhas de interceptação e queda, captura de morcegos com redes de neblina, busca por colônias e entrevistas. Foram registradas 68 espécies, pertencentes a 22 famílias e nove ordens de mamíferos, incluindo 16 espécies ameaçadas e duas exóticas. A riqueza de pequenos mamíferos foi relativamente alta. Akodon spp. e Oligoryzomys nigripes foram as espécies mais abundantes entre os não voadores, e Sturnira lilium e Artibeus spp. entre os morcegos. Várias espécies de médio e grande porte registradas são raras ou estão extintas localmente. Esses dados possivelmente refletem os impactos da grande perda de cobertura floresta e da pressão caça, cuja mitigação é fundamental para conservação da biota regional.

As florestas estacionais são ecossistemas marcados por grande sazonalidade climática, que ocorrem na região tropical em todo o mundo e estão associadas aos vários biomas brasileiros. Apesar do clima subtropical, estas florestas também ocorrem no sul do Brasil, na calha do rio Uruguai e seus principais afluentes, uma região ainda carente em estudos sobre a fauna. Neste sentido, apresentam-se aqui os resultados obtidos com o levantamento da mastofauna durante a etapa de implantação da Usina Hidrelétrica Foz do Chapecó, na divisa entre os estados de Santa Catarina e Rio Grande do Sul, no período de setembro de 2007 a junho de 2010. Foram empregados os métodos de observação direta, levantamento de vestígios e atropelamentos, armadilhas fotográficas, captura de pequenos mamíferos com armadilhas de arame e chapa de alumínio e com armadilhas de interceptação e queda, captura de morcegos com redes de neblina, busca por colônias e entrevistas. Foram registradas 68 espécies, pertencentes a 22 famílias e nove ordens de mamíferos, incluindo 16 espécies ameaçadas e duas exóticas. A riqueza de pequenos mamíferos foi relativamente alta. Akodon spp. e Oligoryzomys nigripes foram as espécies mais abundantes entre os não voadores, e Sturnira lilium e Artibeus spp. entre os morcegos. Várias espécies de médio e grande porte registradas são raras ou estão extintas localmente. Esses dados possivelmente refletem os impactos da grande perda de cobertura floresta e da pressão caça, cuja mitigação é fundamental para conservação da biota regional.