Objective. To detect vancomycin-resistant enterococci (VRE) using chromogenic selective medium CHROMagar™VRE (CHROMagar, France). Materials and Methods. In the first part of the study, a total of 39 vancomycin-resistant and 20 vancomycinsusceptible Enterococcus spp. isolated from blood culture with known susceptibility profiles were incubated on the CHROMagar™VRE (CHROMagar, France) and examined after 24 h and 48 h of incubation. In the second part of the study, a total of 110 rectal swabs were taken from patients with hematological malignancies and incubated on the CHROMagar™VRE. The vancomycin susceptibility of isolates grown on the selective medium was further evaluated by the broth microdilution method (CLSI, 2017). Glycopeptide resistance genes were detected by PCR. Results. Using the CHROMagar™VRE, a total of 36 (92.3%) vancomycin-resistant isolates were detected after 24 h and additional two isolates – after 48 h of incubation. The sensitivity of the selective medium for detection of VRE obtained from blood culture was 92% and 97% after 24 h and 48 h of incubation, respectively. All 20 vancomycin-susceptible enterococci did not grow on the CHROMagar™VRE (specificity – 100%). Of 110 rectal swabs, 35 (31.8%) samples were positive for Enterococcus spp. on the CHROMagar™VRE (33 – E. faecium и 2 – E. faecalis). Resistance to vancomycin was detected in 32⁄33 (97%) E. faecium isolates, of them 28 and 4 strains were isolated after 24 h and 48 h of incubation; all VRE strains carried vanA gene. The proportion of false positive isolates was 3.4% after 24 h of incubation and 8.6% after 48 h of incubation on the CHROMagar™VRE medium for screening of VRE from rectal swabs. Conclusions. The chromogenic selective media CHROMagar™VRE has a high sensitivity and specificity for the detection of VRE and can be used for screening in laboratory practice.
Цель. Изучить распространенность генов приобретенных карбапенемаз среди изолятов A. baumannii, выделенных из гемокультуры больных опухолями системы крови. Материалы и методы. В исследование были включены изоляты A. baumannii, выделенные из ге мокультуры пациентов, находившихся на лечении в 7 стационарах России (2003-2015 гг.). Чувствительность изолятов A. baumannii к карбапенемам оценивали согласно критериям CLSI (2017). Наличие генов карбапенемаз класса D (групп blaOXA51, blaOXA24/40, blaOXA23 и blaOXA58) и класса B (групп blaIMP, blaVIM и blaNDM) определяли методом ПЦР в режиме реального времени с ис пользованием коммерческих наборов. Результаты. Всего исследовано 74 изолята A. baumannii, выделенных из гемокультуры, из кото рых 55 (74,3%) были нечувствительными к меропенему и/или имипенему. Гены приобретенных OXAкарбапенемаз обнаружены у 70,9% (39/55) карбапенемонечувствительных изолятов. Гены ме таллобеталактамаз (blaNDM, blaVIM и blaIMP) выявлены не были. Наиболее распространенными генами приобретенных OXAкарбапенемаз были blaOXA24/40like (51,3%), далее следовали гены групп blaOXA23 (38,5%) и blaOXA58 (10,3%). Значения МПК50/90 меропенема и имипенема оказались выше у изолятов A. baumannii, несущих гены приобретенных карбапенемаз, по сравнению с нечувствительными к кар бапенемам изолятами без приобретенных карбапенемаз. Наиболее высокие значения МПК50/90 кар бапенемов регистрировались у продуцентов ферментов группы OXA24/40 (64 и 128 мкг/мл). Выводы. Гены приобретенных OXAкарбапенемаз выявлены у 70,9% карбапенемонечувстви тельных изолятов A. baumannii, среди которых преобладали продуценты ферментов группы OXA24/40, имеющие наиболее высокие значения МПК.
Objective. To evaluate antimicrobial susceptibility of Enterococcus spp. isolated from blood culture in patients with hematological malignancies. Materials and Methods. Antimicrobial susceptibility of 427 Enterococcus spp. collected from 10 hospitals in 8 cities of Russia in 2002-2016 as part of the multicenter study was tested by the broth microdilution method [CLSI 2015]. Results. Among bloodstream pathogens there was a prevalence of E. faecium (78.2%), followed by E. faecalis (19.7%) and other Enterococcus spp. (2.1%). A total of 50 (15%) vancomycin-resistant E. faecium (Vancomycin-resistant Enterococcus – VRE) was detected, of them 33 (66%) were harboring vanA gene, 17 (34%) – vanB gene. In 2012 one linezolid resistant E. faecium (MIC = 16 µg/mL) was detected. Linezolid-resistant E. faecium contained the G2576T 23S rRNA mutation. All VRE faecium including the one linezolid-resistant isolate were susceptible to daptomycin. All E. faecium were susceptible to tigecycline, 78.7% – to chloramphenicol, 74.9% – to tetracycline. Proportion of E. faecium with high level resistance to gentamicin was 85%, to streptomycin – 60%, to both aminoglycosides – 45%. All E. faecalis were susceptible to linezolid, teicoplanin and tigecycline; 97.6% – to ampicillin. One isolate of E. faecalis (1.2%) with intermediate susceptibility to vancomycin (MIC = 16 µg/mL) harboring vanD gene and one isolate of E. gallinarum resistant to vancomycin, carrying vanC1 and vanB genes were detected. Conclusions. Isolates of E. faecalis had more favorable profile of antimicrobial susceptibility comparing to E. faecium. A total of 15% E. faecium were vancomycin resistant and one of them had resistance to linezolid. In this study one E. faecalis and one E. gallinarum isolates were non-susceptible to vancomycin.
Цель. Изучить распределение генов blaCTXM, blaTEM и blaSHV у изолятов Enterobacterales с продукци ей беталактамаз расширенного спектра (БЛРС), выделенных из гемокультуры больных опухолями системы крови. Материалы и методы. Материалом исследования были изоляты Enterobacterales, выделенные из гемокультуры больных, находившихся на стационарном лечении в 10 лечебных учреждениях России (20032015 гг.). Продукция БЛРС у Enterobacterales была определена фенотипическими методами (CLSI 2017). Наличие генов, кодирующих ферменты TEM, SHV и CTXM, определяли методом поли меразной цепной реакции (ПЦР) с использованием специфических праймеров. Результаты. Всего было исследовано 499 изолятов Enterobacterales с продукцией БЛРС. В структуре микроорганизмов преобладали Klebsiella pneumoniae (43,9%) и Escherichia coli (43,3%). Исследуе мые гены были представлены у Enterobacterales как в сочетании (79%), так и изолированно (19,6%). Гены blaCTXM были наиболее распространенными (82,6%), далее следовали гены blaTEM (73,7%) и blaSHV (53,7%). У 1,4% (n=7) изолятов Enterobacterales с продукцией БЛРС исследуемые гены blaCTXM, blaTEM, blaSHV выявлены не были. Гены blaCTXM были обнаружены у 84,9% K. pneumoniae, 89,8% E. coli и 42,6% Enterobacter cloacae. Гены blaCTXM принадлежали к кластерам blaCTXM1 (88,8%), blaCTXM9 (14,8%) и blaCTXM2 (0,2%). Доля изолятов, имеющих сочетание генов двух разных кластеров blaCTXM, составила 4,1%. Выводы. Среди Enterobacterales с продукцией БЛРС наиболее распространенными были гены blaCTXM (82,6%), основная доля которых принадлежала к кластеру blaCTXM1 (88,8%). У большинства исследуемых изолятов (79%) было выявлено сочетание генов разных типов беталактамаз, а у 4,1% CTXMпродуцирующих Enterobacterales-сочетание генов двух разных кластеров.
scite is a Brooklyn-based organization that helps researchers better discover and understand research articles through Smart Citations–citations that display the context of the citation and describe whether the article provides supporting or contrasting evidence. scite is used by students and researchers from around the world and is funded in part by the National Science Foundation and the National Institute on Drug Abuse of the National Institutes of Health.
hi@scite.ai
10624 S. Eastern Ave., Ste. A-614
Henderson, NV 89052, USA
Copyright © 2024 scite LLC. All rights reserved.
Made with 💙 for researchers
Part of the Research Solutions Family.