Профиль Метилирования Группы Генов МикроРНК При Светлоклеточном Почечноклеточном Раке; Связь С Прогрессией Рака

Abstract

MicroRNA regulates gene expression, is involved in many cellular processes, and plays an important role in the development of cancer. The regulation of the expression of miRNA genes can be achieved by methylating their CpG islands, which is shown in different types of tumors. The methylation of miRNA genes in clear cell renal cell carcinoma (CCRCC) has mainly been studied for the miR-9 and miR-34 families. The methylation of six miRNA genes (miR-124a-2, -124a-3, -9-1, -9-3, -34b/c, -129-2) was investigated with the use of representative set of CCRCC samples (46 cases). Methylation of three genes miR-124a-2, -124a-3, and -129-2 was studied in kidney tumors for the first time. Methylation analysis was performed using methyl specific PCR. It is shown that the frequency of methylation of six genes (miR-124a-2, -124a-3, -9-1, -9-3, -34b/c and -129-2) was significantly higher in tumor samples than in samples of histologically normal tissue (P < 3 x 10(-5) by Fisher's exact test). These results suggest the properties of tumor suppressors for the six miRNA genes indicated in CCRCC. We also found correlations between the methylation frequency of some miRNA genes and signs of the progression of CCRCC (tumor size, clinical stage, loss of differentiation, and metastasis).

Methylation of 10 miRNA genes in clear cell renal cell carcinoma and their diagnostic value

“…Анализировали парные образцы опухоли и гистологически неизмененной ткани почки, полученные от 70 больных скПКР, и 19 образцов ткани почки от умерших от неонкологических заболеваний (обозначенных как «доноры»). Отбор образцов проводили, как описано ранее [15]. Клинико-гистологические характеристики образцов по TNM-классификации [17] приведены в табл.…”

“…Бисульфитную конверсию ДНК и метилспецифичную полимеразную цепную реакцию (МС-ПЦР) проводили, как описано ранее [18]. Праймеры и условия МС-ПЦР для исследуемых фрагментов генов миРНК взяты из [15,[19][20][21] По данным ROC-анализа, эти системы позволяют диагностировать скПКР при выявлении метилирования хотя бы одного из данных генов (критерий отсечения 1/4 или 1/5). Наборы маркеров из 4 и 5 генов (MIR-9-1, -34b/c, -124a-3, -129-2; и с добавлением MIR-130b) характеризуются клинической чувствительностью 90 %, специфичностью 94 % (площадь под ROC-кривой (area under ROC curve, AUC) 0,93 и 0,94 соответственно) и, по-видимому, оптимальны для диагностики скПКР среди изученных нами генов миРНК.…”

“…Обсуждение В данной работе изучено изменение статуса метилирования 10 генов миРНК (MIR-9-1, -9-3, -34b/c, -107, -124a-1, -124a-2, -124a-3, -129-2, -130b, -148a) на представительной выборке парных образцов опухолей и гистологически неизмененных тканей почки от 70 больных скПКР и тканей почки от 19 умерших от неонкологических заболеваний. Следует отметить, что метилирование 7 генов (MIR-9-1, -9-3, -34b/c, -124a-1, -124a-2, -124a-3 и -129-2) было изучено нами ранее на меньшей выборке больных скПКР [15,16]. Метилирование генов MIR-107, -130b и -148a при скПКР в данной работе исследовано впервые.…”

“…Сопоставление результатов по метилированию генов миРНК с клинико-гистологическими характеристиками исследованных образцов скПКР позволило определить 4 гена миРНК, метилирование которых связано с прогрессированием скПКР: MIR-107, -124a-3, -129-2 и -130b. Связь метилирования генов MIR-124a-3 и -129-2 с параметрами прогрессирования скПКР согласуется с нашими данными, полученными ранее [15,16]. В данном исследовании впервые выявлена статистически значимая ассоциация метилирования гена MIR-107 с поздней клинической стадией и метастазированием скПКР, а также гена MIR-130b -с поздней клинической стадией и увеличением размера опухолей.…”

“…Как показано ранее, в том числе авторами данной работы, профили гиперметилирования генов миРНК могут использоваться как потенциальные биомаркеры для диагностики и прогноза течения разных видов рака [11][12][13][14]. При этом анализ гиперметилирования генов миРНК при скПКР представлен единичными публикациями [14][15][16].…”