Μοριακή μελέτη των γονιδίων των πρωτεϊνών του ριβοσωμικού μίσχου της υπεροξειδικής δισμουτάσης και της κινάσης της καζεΐνης 2 στο μύδι Mytilus galloprovincialis

Abstract

Αναπληρώτρια Καθηγήτρια Τμήματος Βιολογίας Πανεπιστημίου Αθηνών vii viii Πρόλογος Η εργασία αυτή πραγματοποιήθηκε κατά το χρονικό διάστημα 2006 έως 2010 στον Τομέα Γενετικής και Βιοτεχνολογίας του Τμήματος Βιολογίας του Εθνικού και Καποδιστριακού Πανεπιστημίου Αθηνών, υπό την επίβλεψη της Επίκουρης Καθηγήτριας Σοφίας Κουγιανού-Κουτσούκου, την οποία ευχαριστώ πρώτα από όλα για την εμπιστοσύνη με την οποία με τίμησε όλα αυτά τα χρόνια, καθώς και τη γενικότερη κατανόηση και καθοδήγηση. Η επιστημονική της κρίση υπήρξε καθοριστική για την Παπαντώνης, ο Δρ. Χρήστος Κοντός, ο Υποψήφιος Διδάκτωρ Πάνος Γιαννός, και οι Υποψήφιες Διδάκτορες Ιωάννα Χαλατσά και Ιωάννα Κοκκίνου. Η εργασία αυτή δε θα μπορούσε να πραγματοποιηθεί αν δεν περνούσα πάρα πολλές ώρες στο εργαστήριο. Σε αυτά τα καθημερινά ξενύχτια συμπαραστάτες υπήρξαν πολλοί συνάδελφοί μου, των οποίων η παρότρυνση και ο ενθουσιασμός για την έρευνα με βοήθησαν να ξεπεράσω την οποιαδήποτε κούραση. Ένα μεγάλο ευχαριστώ στον Δρ. Γιάννη Δρόσο για την βοήθειά του όλα αυτά τα χρόνια κατά τα οποία συνυπήρξαμε ως Υποψήφιοι Διδάκτορες του Τομέα Γενετικής και Βιοτεχνολογίας και που στις πιο δύσκολες στιγμές ήταν εκεί. Θα ήθελα επίσης να ευχαριστήσω από τα βάθη της καρδιά μου τον Λέκτορα Βασίλη Κουβέλη και τον Δρ. Αντώνη Κριμιτζά που όποτε χρειάστηκα την επιστημονική τους βοήθεια μου την προσέφεραν απλόχερα. Το τελευταίο χρονικό διάστημα της διατριβής μου είχα την χαρά να διευρύνω τους επιστημονικούς μου ορίζοντες σε χώρους που δεν είχα ασχοληθεί μέχρι σήμερα, και για αυτό ευχαριστώ τους Υπ. Διδάκτορες Θεοδώρα Κορομηλά και Γιάννη Παπαϊωάννου. Επίσης, θα ήταν παράλειψή μου να μην ευχαριστήσω την Γραμματέα του Τομέα Γενετικής και Βιοτεχνολογίας, Αθηνά Μπούρμπουλα, που με αγκάλιασε και με βοήθησε με κάθε τρόπο σε ό,τι αφορά την γραφειοκρατία της Διατριβής μου. Ιδιαίτερες ευχαριστίες στους διπλωματικούς που με βοήθησαν στην ομαλή διεξαγωγή των πειραμάτων μου στο εργαστήριο και σε δύσκολες στιγμές με άντεξαν. Ευχαριστώ τη Μαρίνα Μακαρώνα, τη Μαρία Ανδρέου, το Σωτήρη Τασιγιώργο, την Ελένη Λασθιωτάκη, την Κωνσταντίνα Θανοπούλου, την Εβίτα Μανιατοπούλου, την Κατερίνα Τσικαλάκη, τον Απόστολο Λυράκο, το Θάνο Λαμπρόπουλο, το Θανάση Λέκκα και τη Μαρία Γουλιελμάκη. Η οικονομική υποστήριξη του Ιδρύματος Κρατικών Υποτροφιών για την υλοποίηση της διατριβής μου ήταν πολύ σημαντική. 2.1 Απομόνωση ολικού RNA από ιστό μυδιού M. galloprovincialis με τη χρήση του παράγοντα TRIzol (Invitrogen Cat No.15596-026)………………..……71 2.2 Απομόνωση ολικού RNA και mRNA από ιστό μυδιού M. galloprovincialis με κολώνες (Invitrogen Cat No. 12183-555)………………………………….……...71 2.3 Κατασκευή μορίων cDNA με αντίδραση RT-PCR με SuperScript III…….72 2.4 Απομόνωση χρωμοσωμικού DNA μικρής κλίμακας από ιστό μυδιού M. galloprovincialis κατά Holmes και Bonner (1973)………………………73 2.5 Απομόνωση πλασμιδιακού DNA με mini preps………………………..……74 2.6 Απομόνωση μικρής κλίμακας πλασμιδιακού DNA υψηλής Περιεχόμενα Κολαΐτη Ρεγγίνα-Μαρία 2 καθαρότητας κατά Iyer R………………………………………………………...........74 2.7 Ηλεκτροφόρηση νουκλεϊκών οξέων……………………………………..……75...