Viral noncoding RNAs: more surprises

Abstract

Eukaryotic cells produce several classes of long and small noncoding RNA (ncRNA). Many DNA and RNA viruses synthesize their own ncRNAs. Like their host counterparts, viral ncRNAs associate with proteins that are essential for their stability, function, or both. Diverse biological roles—including the regulation of viral replication, viral persistence, host immune evasion, and cellular transformation—have been ascribed to viral ncRNAs. In this review, we focus on the multitude of functions played by ncRNAs produced by animal viruses. We also discuss their biogenesis and mechanisms of action.

The host Integrator complex acts in transcription-independent maturation of herpesvirus microRNA 3′ ends

“…Because viruses commonly acquire mechanisms from their hosts, it is possible that unusual HVS pri-miRNAlike substrates exist in uninfected cells (Tycowski et al 2015). Moreover, because miR 3 ′ box processing occurs independently of snRNA promoter-driven transcription, such substrates would not be limited to snRNA precursors.…”

Inflammasomes and its importance in viral infections

“…The expression of inflammasome components is inhibited by a similar method during viral infections. Another viral strategy for immune evasion is the regulation of the expression of host genes by the production of post-transcriptional regulators such as microRNAs of both viral and cellular origin that can exert positive or negative regulation [135]. Viral miRNAs can directly alter components of the immune system.…”

Occurrence of Small Homologous and Complementary Fragments in Human Virus Genomes and Their Possible Role

“…Роль внРНК рассматривалась неоднократно в обширных обзорах в разных аспектах [5,11,19], и в обсуждении полученных нами результатов будут затронуты другие аспекты их возможных функций. Выявленные в настоящем исследова-нии в геномах вирусов 3 категории последова-тельностей -аутоКП, ГП и КП -потенциально могут играть роль в различных процессах жиз-ненного цикла вирусов и соответственно влиять на течение инфекционного процесса, который они вызывают у человека.…”

“…В заключение хотелось бы подчеркнуть, что биоинформатика позволяет анализировать еди-новременно множество вирусов на уровне и ну-клеиновых кислот, и белков, выявляя новые дан-ные, позволяющие сделать обобщающие выводы о происхождении и эволюции вирусов, которые невозможно извлечь экспериментально [8,10,17,19], и по-новому взглянуть на существующие представления о вирусных инфекциях и послед-ствия вакцинации против них. Выявленная ком-пьютерным анализом распространенность малых ГП и КП среди геномов разных вирусов человека можно рассматривать как результат многократной рекомбинации между ними, свершавшейся в про-шлом и возможной в настоящем и определяющей их изменчивость и адаптацию.…”