Triticeae contains hundreds of species of both annual and perennial types. Although substantial genomic tools are available for annual Triticeae cereals such as wheat and barley, the perennial Triticeae lack sufficient genomic resources for genetic mapping or diversity research. To increase the amount of sequence information available in the perennial Triticeae, three expressed sequence tag (EST) libraries were developed and annotated for Pseudoroegneria spicata, a mixture of both Elymus wawawaiensis and E. lanceolatus, and a Leymus cinereus  L. triticoides interspecific hybrid. The ESTs were combined into unigene sets of 8 780 unigenes for P. spicata, 11 281 unigenes for Leymus, and 7 212 unigenes for Elymus. Unigenes were annotated based on putative orthology to genes from rice, wheat, barley, other Poaceae, Arabidopsis, and the non-redundant database of the NCBI. Simple sequence repeat (SSR) markers were developed, tested for amplification and polymorphism, and aligned to the rice genome. Leymus EST markers homologous to rice chromosome 2 genes were syntenous on Leymus homeologous groups 6a and 6b (previously 1b), demonstrating promise for in silico comparative mapping. All ESTs and SSR markers are available on an EST information management and annotation database (http://titan.biotec.uiuc.edu/triticeae/).Key words: Triticeae, Leymus, Elymus, Pseudoroegneria spicata, expressed sequence tag, simple sequence repeat, microsatellite, comparative genomics.Résumé : Les hordées comprennent des centaines d'espèces tant du type annuel que pérenne. Bien qu'il existe pour les cé-réales annuelles comme le blé et l'orge de nombreux outils génomiques, les hordées pérennes sont dépourvues des ressources génomiques pour des travaux de cartographie ou des études de diversité génétique. Afin d'augmenter l'information nucléotidique disponible pour les hordées pérennes, trois banques d'EST ont été produites et annotées pour le Pseudoroegneria spicata, pour un mélange de l'Elymus wawawaiensis et de l'E. lanceolatus, ainsi que pour un hybride interspéci-fique entre le Leymus cinereus et le L. triticoides. Les EST ont été combinés en collections d'unigènes au nombre de 8 780 chez le P. spicata, de 11 281 chez les Leymus et de 7 212 chez les Elymus. Les unigènes ont été annotés en fonction de l'orthologie putative avec les gènes du riz, du blé, de l'orge, d'autres graminées, d'Arabidopsis ou de la banque de sé-quences non-redondantes du NCBI. Des marqueurs microsatellites (SSR) ont été développés, testés pour leur amplification et polymorphisme, et alignés sur le génome du riz. Les marqueurs EST du Leymus homologues aux gènes situés sur le chromosome 2 du riz étaient synténiques aux groupes homéologues 6a et 6b (1b) chez Leymus, ce qui illustre le potentiel de la cartographie génétique in silico. Tous les EST et marqueurs microsatellites sont disponibles au sein d'une base de données permettant la gestion et l'annotation des EST (http://titan.biotec.uiuc.edu/Triticeae/).