Validation of a 52-mtSNP minisequencing panel for haplogroup classification of forensic DNA samples

Recent advances in forensic biology and forensic DNA typing: INTERPOL review 2019–2022

“…NGS sequencing of the mtGenome has permitted improved resolution of the most common West Eurasian mtDNA control region haplotype [ 497 ]. Phylogenetic alignment and haplogroup classification have continued to be refined with new sequence information [ 498 ], and new assays have been developed to aid haplogroup classification [ 499 ]. Concerns over potential paternal inheritance of mtDNA have also been addressed [ 500 , 501 ].…”

Diseño y validación de un ensayo de minisecuenciación múltiple para detectar polimorfismos asociados con Síndrome Metabólico

“…Se evaluó mediante la repetibilidad obtenida en cinco muestras, procesadas tres veces por un mismo funcionario; y mediante reproducibilidad, valorada a partir de la evaluación de los resultados obtenidos en las mismas cinco muestras procesadas a ciegas, por otro funcionario, utilizando otro termociclador del laboratorio 28 .…”

“…La intensidad de las señales en la mayoría de los SNP presento variaciones, aunque fueron equilibradas, esto debido a la diferencia de intensidad de la señal emitida por el fluorocromo con que estaba marcado cada ddNTP 25 . También la movilidad de los fragmentos varió ligeramente las posiciones de los SNP en los electroferogramas, debido al tamaño de los fragmentos a detectar y al analizador genético, el polímero y tamaño del capilar, factores que afectan la movilidad electroforética 25, 28 . Aunque estos aspectos en ningún momento dificultaron la asignación alélica de cada SNP, es importante realizar la validación del ensayo para establecer las condiciones de aceptabilidad, antes de ser usado para el análisis de muestras, adicionalmente consideramos indispensable, conservar todas las condiciones seguidas durante la validación, al analizar las muestras, para garantizar la reproducibilidad de los resultados.…”