Using mixed models to combine smooth size-selection and catch-comparison curves over hauls

Abstract

Parametric size-selection curves are often combined over hauls to estimate a mean selection curve using a mixed model in which between-haul variation in selection is treated as a random effect. This paper shows how the mixed model can be extended to estimate a mean selection curve when smooth nonparametric size-selection curves are used. The method also estimates the between-haul variation in selection at each length and can model fixed effects in the form of the different levels of a categorical variable. Data obtained to estimate the size-selection of dab by a Nordmøre grid are used for illustration. The method can also be used to provide a length-based analysis of catchcomparison data, either to compare a test net with a standard net or to calibrate two research survey vessels. Haddock data from an intercalibration exercise are used for illustration.Résumé : Les courbes paramétriques de sélection de la taille sont souvent combinées dans toutes les récoltes pour obtenir une courbe de sélection moyenne qui utilise un modèle mixte dans lequel la variation de la sélection entre les récoltes est considérée comme un effet aléatoire. Notre étude démontre comment le modèle mixte peut être étendu de façon à estimer une courbe de sélection moyenne en utilisant des courbes lisses de sélection non paramétriques. La méthode estime aussi la variation de la sélection entre les récoltes pour chacune des longueurs et elle peut modéliser des effets fixes sous forme de niveaux différents d'une variable catégorique. Un exemple utilise des données obtenues pour estimer la sélection de taille chez la limande par une grille de Nordmøre. La méthode peut aussi servir à analyser des données de comparaisons de récoltes d'après la longueur, soit pour comparer un filet expérimental avec un filet standard ou pour calibrer deux navires d'inventaire de recherche. Un exemple utilise des données sur l'aiglefin provenant d'un exercice d'intercalibration.[Traduit par la Rédaction] Fryer et al. 459

Square mesh panels in North Sea demersal trawls: Separate estimates of panel and cod-end selectivity

“…to test for any differences between any of the nets) and on a pairwise basis (i.e. to test for any differences between two specific nets) using the bootstrap hypothesis test and the test statistic T ave described by Fryer et al (2003) Haddock Whiting Many haddock were caught in most tows. However, only whiting above 20 cm were caught in reasonable numbers, so the trials provided scant data for estimating the selection of small whiting.…”

“…The smoother analysis uses the methods described by Fryer et al (2003). Taking the logistic transform of Eq.…”

Physiological Condition, Short-Term Survival, and Predator Avoidance Behavior of Discarded Norway Lobsters (Nephrops norvegicus)

“…Further analysis was undertaken by modelling the data using the smoother based method on Fryer et al (2003) implemented in R.…”

A simple statistical method for catch comparison studies

“…A more recent curve fitting method/approach was proposed by Fryer et al (2003). They used a two-stage mixed effects model similar to that commonly used for selectivity analysis (Millar and Fryer, 1999).…”