Uma nova visão da tripla hélice do DNA: parâmetros estruturais, espectroscópicos e eletrônicos de ligações de hidrogênio para os emparelhamentos de Watson-Crick e Hoogsteen

Abstract

Através dos cálculos B3LYP/6-31+G(d,p), as estruturas intermoleculares da dupla e tripla hélices do DNA formadas por Timina (T) Adenina (A) foram totalmente otimizadas. Com base na análise de parâmetros estruturais, modos vibracionais e intensidades de absorção no espectro de infravermelho, foram identificadas ligações de hidrogênio entre as bases purina e pirimidina. Pela transferência de carga entre os orbitais de fronteira HOMO e LUMO respectivamente do receptor e doador de prótons, a aplicação dos protocolos NBO e ChElPG proporcionaram resultados insatisfatórios. Todavia, todas as ligações de hidrogênio foram caracterizadas através de descritores QTAIM, pelos quais novos perfis intermoleculares foram obtidos tanto para a dupla (TA) quanto para a tripla (TAT) hélices do DNA.

The Quantum Electronic Partitioning as Modernization in the Studies of the Intermolecular Interactions

“…In view of all exposed here about the modernization for the hydrogen bond studies [47], although from the emergence of other types of intermolecular interactions, it is established a recognition concerning the application of a quantum mechanical formalism, for instance, initially for determining of geometries and spectroscopy parameters [48], but the necessity to the executability of the electronic partitioning, especially via SAPT method, in fact it becomes truth. The determination of the interaction energy on the basis of the traditional supermolecule approach deprives the real understanding of the electronic nature of the intermolecular interactions, wherein, surely, it consists on physical properties from electrostatic, dispersive, spin exchange, inductive nature, basically.…”