El endofitismo de hongos en plantas tiene efectos benéficos y depende de varios factores. En este estudio se evaluó el endofitismo individual y el consorcio de cinco especies —Trichoderma spirale, T. longibrachiatum, T. parareesei, T. andinense y T. hamatum— en raíz y bráctea de banano Williams y Francés in vitro. La mortalidad, la longitud y el diámetro de raíz de plantas ex vitro fueron evaluados. Se observaron diferencias significativas de endofitismo en raíz (X21.00= 31.13, P<0.05); T. longibrachiatum y T. hamatum tuvieron 48 por ciento de endofitismo en la variedad Williams, y T. spirale, 58 por ciento en la variedad Francés. El tratamiento formado por las cinco especies presentó 24 por ciento de endofitismo en raíz de la variedad Williams y 8 por ciento en la variedad Francés. Se observó relación entre endofitismo y crecimiento de diámetro de raíz (R2= 0.771, P<0.05); sin embargo, no se observó relación (R2= 0.298, P<0.05), (R2= 0.089) entre endófitismo de especies de Trichoderma y mortalidad de plantas de banano de ambas variedades.