O objeto de estudo desse artigo é a identificação e análise de metais traço, cromo, cádmio, cobre, chumbo, ferro, manganês, níquel, e zinco em quatro pontos diferenciados de um sistema de aquaponia abastecido com água pluvial e uma amostra de água fluvial de um córrego próximo ao local para comparativo da influência da poluição urbana, as coletas ocorreram nos meses de dezembro de 2022, fevereiro e abril de 2023. O sistema de aquaponia experimental movido por energia fotovoltaica e eólica, sem conexão com o sistema de energia elétrica, possuindo um ciclo fechado apenas com energia limpa e fornecimento de água pluvial. O sistema de aquaponia foi implantado em uma área urbana, com proximidade de grandes vias com intenso fluxo de veículos, na cidade de Curitiba, Paraná, Brasil. Nas análises os metais traços com concentrações mais elevadas foram o chumbo com 0,047mg/L na coleta de dezembro de 2022 e de 0,011 mg/L em abril de 2023 no ponto de coleta do sistema de água pluvial, sendo o chumbo um elemento traço tóxico ao ser humano, e ao desenvolvimento de plantas, e o índice de 0,128mg/L de chumbo na amostra de água fluvial, em abril de 2023. O elemento cromo não foi identificado nas amostras, em comparativo com outras pesquisas o chumbo apresentou-se em taxas mais elevadas. As concentrações de cobre foram elevadas no ponto 1 de água pluvial de 0,0100125mg/L e no ponto de água fluvial 0,00905 mg/L mesmo constituindo um corpo hídrico altamente poluído. Para verificar a viabilidade do uso exclusivo de água pluvial para o sistema de aquaponia é necessário complementar com análises das concentrações de metais traços nos peixes e verduras.