Three‐taxon Statements: A More Precise Use of Parsimony?

Abstract

Abstract— Binary characters can be represented in data matrices by the three‐taxon statements they imply. Transforming characters into three‐taxon statements may increase the sensitivity of parsimony to differences in the fit of data to alternative cladograms. Extrapolation of the technique to multistate features allows semi‐additive characters to be coded accurately. In many cases, analysis of the transformed data produces fewer equally parsimonious solutions than does analysis of the raw data. In other cases, additional equally parsimonious solutions, or even different solutions, may be produced; in those cases, the results appear to accommodate information from a larger number of characters than do the results from raw data.

“A character does not make a genus, but the genus makes the character”: three-taxon statement analysis and intuitive taxonomy

“…3TA can recognize clades, for which the standard (conventional) Maximum Parsimony (MP) analysis provides no unequivocal synapomorphies, as was clearly demonstrated by Nelson (1996) (see also Williams & Ebach 2005, 2008, using the hypothetical matrices of the binary characters, or even no synapomorphies, as optimized under the criterion of conventional parsimony (e.g., Nelson & Platnick 1991, see also Mavrodiev 2016). …”

“…As mentioned by Williams & Ebach (2016), three-taxon statement analysis (3TA), one of the two approaches to Hennigian cladistics (e.g., Williams & Siebert 2000), originally proposed by Nelson & Platnick (1991), is just such a method.…”

"Descrição morfológica e posição filogenética de um anuro novo (Lissamphibia, Tetrapoda) do Cretáceo Superior Continental do Brasil (Formação Adamantina, Bacia Bauru) do Município de Marília, (SP)"

“…A metodologia adotada para determinar as relações filogenéticas entre o novo táxon e os demais grupos de Anura foi a Cladística (segundo Hennig, 1966;Nelson e Platnick, 1991;Wiley, 1981;Rieppel, 1988). A análise dos dados seguiu os princípios da parcimônia (Kluge & Farris, 1969;Farris, 1970).…”

Eficiência dos métodos de codificação em análises de endemismo: um exemplo do Oceano Atlântico Sul-Ocidental

“…A análise de três-itens (3IA, Nelson & Platnick, 1991) é uma metodologia de inferência filogenética que utiliza a mínima expressão hierárquica possível (3is-enunciados de três-itens) para encontrar padrões relacionais (Williams & Siebert, 2000;Williams & Ebach, 2005). A análise de parcimônia padrão e a 3IA aplicam o mesmo critério de otimização, porém utilizam matrizes de dados diferentes: binária e de 3is, respectivamente, que resolvem diferentemente os caracteres conflitantes (Platnick, 1993;Nelson, 1996;Williams, 2002).…”

“…A análise de parcimônia padrão e a 3IA aplicam o mesmo critério de otimização, porém utilizam matrizes de dados diferentes: binária e de 3is, respectivamente, que resolvem diferentemente os caracteres conflitantes (Platnick, 1993;Nelson, 1996;Williams, 2002). A 3IA tem sido uma metodologia geralmente utilizada para inferir relações entre áreas de endemismo (Nelson & Platnick, 1991;Roig-Juñent et al, 2006;Escalante et al, 2007;Parenti & Ebach, 2009). Porém, sob uma perspectiva prática, e a despeito de ser uma opção que aparentemente incorpora a incerteza dos dados de distribuição nas entradas faltantes (Marques, 2005), enunciados de três-itens não foram explorados para a análise de congruência distribucional entre táxons ou homologia biogeográfica primária (senso Morrone, 2001).…”