Реферат. Существует несколько коммерческих наборов для выделения ДНК, пригодных для экстракции геном-ной ДНК из образцов цельной крови, но эта процедура требует определенных затрат времени, ручной работы и довольно дорога. Альтернативной техникой мог бы быть метод исследования сухого пятна крови (СПК), который позволяет быстрее выделять ДНК, более дешевый и простой. Мы разработали некоммерческий метод сухого пятна крови и оценили достаточны ли качество и количество ДНК, выделенной из СПК и неинвазивно получаемого мазка со щеки. Изоляты ДНК, полученные из образцов крови с этилендиаминтетрауксусной кислотой и пятен крови на фильтровальной бумаге, были сопоставлены после выделения ДНК посредством колонки и двумя альтернатив-ными методами. Образцы крови были получены посредством трения стерильным сухим хлопковым тампоном по внутренней поверхности щеки испытуемого. Кроме того, было измерено качество выделенной ДНК, полученной разными методами, проведен анализ кривых плавления 5 цитохромов P450 и 3 АТФ-связанных кассетных поли-морфизмов посредством полимеразной цепной реакции (ПЦР) в реальном времени. Во всех случаях результаты генотипирования были полными. Более того, производные кривых плавления образцов ДНК из капиллярной крови и альтернативных образцов были сопоставимы и высоковоспроизводимы. Средние измеренные концентрации ДНК составили 16,0 нг/мкл (12,6-19,4 нг/мкл) и 70,2 нг/мкл (57,3-83,1 нг/мкл) соответственно для сухого пятна и образца со щеки (p<0,001). Выделение ДНК методом СПК является альтернативным существующим коммерческим наборам для выделения ДНК и более простым методом для установления различий по генотипам. Метод расши-ряет возможности быстрого и простого выделения ДНК. В частности, неинвазивный метод получения материала со щеки может стать хорошей альтернативой инвазивному пути получения образцов. Ключевые слова: метод исследования сухого пятна крови и образца со щеки, ДНК, генотипирование.
Pharmacogenetic testing after a simPle Dna isolation methoD
P. Wijnen, O. Bekers, M. van Dieijen-visser, M. DrentAbstract. Several commercial DNA isolation kits are available for extracting genomic DNA from whole blood samples, but these procedures require certain consumption of hand and work time and are rather expensive. An alternative technique could be dried blood spot (DBS) sampling, with which DNA isolation is faster, cheaper and logistics are easier. We have developed a non-commercial DBS method and examined whether the quality and quantity of DNA, isolated from DBS and noninvasively obtained buccal swab (BS) samples, was satisfactory. DNA isolation from EDTA blood samples and blood spots on filter paper were compared after DNA isolation with a column method and two different DBS methods. BS samples were obtained by rubbing a sterile, dry cotton swab against the inside of the subject's cheek. In addition, the quantity of the obtained DNA was measured and melting curve analyses of 5 cytochrome P450 and 3 ATP-binding cassette polymorphisms were performed with real-time PCR FRET assays to establish the qual...