Dedico.Ao meu amigo Fernando D. Andreote, e minha amiga Cristiane C. F. Fasanella e aos seus filhos Giovanni F. Andreote e Fellipe C. Fasanella e a Simone Raposo Cotta minha namorada e companheira. Aos amigos do laboratório em Gronigen na Holanda, onde fiz parte do meu doutorado e em especial a Michele de Cassia Pereira e Silva;
Ofereço.A aluna Maryeimy Varon Lopez, orientada pelo Prof. Dr. Fernando Dini Andreote, que desenvolve projeto na mesma área, dentro do qual obteve os dados de pirosequenciamento; Á bibliotecária Marilia Garcia Henyei, pela revisão da tese; The mangrove is a coastal ecosystem, located in the interface regions between the land and sea environments, with exclusive occurrence in tropical and subtropical areas. Such location confers to the mangrove sediments unique characteristics, like as high salinity and low availability of oxygen, associated with the high abundance of organic matter. The result of these conditions is the occurrence of a restrict plant diversity, associated with a great diversity of animals, who use the mangroves for its protection and reproduction. The present study has shown how the communities of archaea (16S DNAr and amoA) and bacteria (16S DNAr and nifH) are structured in mangrove soils under distinct states of preservation. The DGGE patterns indicate alterations in the composition of targeted communities, linking its structure with the environmental contamination, while the quantifications of targeted genes by real time PCR (qPCR) has indicated alterations only in the community of ammonium oxidizers archaea. The phylogeny of these groups revealed the presence of groups commonly found in soils and water samples, besides the occurrence of particular groups, possibly resulted from a speciation process in the mangrove environment. In general, results indicated that archaeal and bacterial communities are responsive to the mangroves contamination, and its alteration can also lead to differential nitrogen processing in these soils. (BASHAN; HOLGUIN, 2002). Assim, as bactérias estão envolvidas em processos de transformação de nutrientes (e.g. fixação biológica do nitrogênio, amonificação, nitrificação e denitrificação), e também são responsáveis pela maior parte do fluxo de carbono em sedimentos de manguezais tropicais . Dessa forma, temos que nos manguezais ocorre uma interdependência entre micro e macro-organismos, onde os macro-organimos dependem dos microorganismos para a reciclagem de nutrientes, e os micro-organismos se beneficiam pela absorção de fontes de carbono oferecidas principalmente pela vegetação . É possível formular a hipótese de que na ausência ou redução da microbiota, haverá prejuízo nas atividades comerciais e ecológicas, e possivelmente a destruição dos ecossistemas de manguezais . Portanto, o conhecimento das comunidades microbianas dos 17 manguezais é de grande relevância para entender melhor a dinâmica desse ecossistema, destacando sua preservação e manutenção. Ainda dentro desta temática, alguns trabalhos têm descrito a composição de comunid...