The role of TNF-α (rs1800629) ve IKZF1 (rs4132601) gen polimorphisms in pathogenesis of Hodgkin’s lymphoma

Abstract

Amaç: Tümör nekroz faktör-alfa (TNF-α), nekroz veya apoptoza yol açan çeşitli sinyal yolaklarında, inflamatuvar ve otoimmün hastalıkların patogenezinde rol oynamaktadır. TNF-α genindeki rs1800629 polimorfizmi G>A değişimi yaparak genin ifade seviyelerini etkiler. TNF-α -308G alleli ile karşılaştırıldığında, A alleli daha yüksek transkripsiyonel aktiviteye sahiptir. IKZF1 geni ise, hücre döngüsünün ilerlemesini ve hücre sağkalımını kontrol eden genlerin ekspresyonunu düzenleyen transkripsiyon faktörü IKAROS'u kodlamaktadır. IKZF1 geni, kromatinin yeniden şekillenmesi ile ilişkili çinko parmak DNA bağlayıcı proteinler ailesindendir. Bu protein lenfosit diferansiasyonunun da düzenleyicisidir. IKZF1 genindeki rs4132601 polimorfizminin T/G değişimi yaparak genin ekspresyon seviyesini etkilediği ve otoimmün hastalıklar ve lenfoma ile ilişkili olduğu bulunmuştur. TNF-α ile IKZF1 gen polimorfizmlerinin Hodgkin lenfoma için bir risk faktörü olup olmadığını değerlendirmeyi amaçladık. Yöntem: Hodgkin lenfoma tanısı olan hasta grubu ile malignitesi olmayan kontrol grubu hastalarda TNF-α ve IKZF1gen polimorfizmleri gerçek zamanlı polimeraz zincir reaksiyon (Rt-PCR) yöntemi ile araştırılmıştır. Elde edilen veriler SPSS paket programında analiz edilmiştir. Bulgular: TNF-α (rs1800629) genindeki polimorfizmde, gruplara göre TNF-α (rs1800629) genotip ve allel dağılımlarının farklılık göstermediği saptanmıştır (p>0.05). Gruplara göre TNF-α (rs4132601) genotipler arasında farklılık göstermediği anacak allel dağılımlarının farklılık gösterdiği saptanmıştır (p=0,087), ve hasta grubunda kontrol grubuna kıyasla G alleli T alleline göre 2,34 kat daha fazla tespit edilmiştir. Sonuç: Bulgularımız, IKZF1 (rs4132601) geninde G allelinin Hodgkin lenfoma için bir risk faktörü olabileceğini göstermektedir.